More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0880 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  86.33 
 
 		 373 aa  665    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  86.06 
 
 		 373 aa  662    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  83.91 
 
 		 373 aa  657    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  86.33 
 
 		 373 aa  665    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  85.48 
 
 		 373 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  86.33 
 
 		 373 aa  665    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  86.33 
 
 		 373 aa  664    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  86.33 
 
 		 373 aa  665    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 373 aa  758    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  85.48 
 
 		 373 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0998  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  85.48 
 
 		 372 aa  643    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  87.67 
 
 		 373 aa  682    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  84.95 
 
 		 373 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  86.33 
 
 		 373 aa  665    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2854  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  85.25 
 
 		 373 aa  647    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  85.48 
 
 		 373 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  83.91 
 
 		 373 aa  657    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  86.33 
 
 		 373 aa  665    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  83.91 
 
 		 373 aa  655    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  85.48 
 
 		 373 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  87.94 
 
 		 373 aa  684    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  86.06 
 
 		 373 aa  662    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  87.94 
 
 		 373 aa  684    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  67.65 
 
 		 375 aa  542  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  67.65 
 
 		 375 aa  543  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  66.85 
 
 		 375 aa  530  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  66.31 
 
 		 377 aa  522  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  62.33 
 
 		 375 aa  496  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  59.41 
 
 		 383 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  59.68 
 
 		 383 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.54 
 
 		 374 aa  464  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  59.68 
 
 		 383 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  59.14 
 
 		 383 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  59.14 
 
 		 379 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000040953  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.87 
 
 		 379 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.87 
 
 		 379 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.87 
 
 		 379 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.33 
 
 		 379 aa  451  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.53 
 
 		 379 aa  448  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.06 
 
 		 379 aa  450  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  56.99 
 
 		 379 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.03 
 
 		 384 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1054  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  55.91 
 
 		 384 aa  443  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.189276  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  54.84 
 
 		 375 aa  435  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  55.53 
 
 		 384 aa  429  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  55.91 
 
 		 383 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.449795  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2749  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.06 
 
 		 384 aa  418  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.186478  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  52.43 
 
 		 381 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  45.79 
 
 		 706 aa  243  3.9999999999999997e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2269  Prephenate dehydrogenase  36.75 
 
 		 371 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00760536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  33.96 
 
 		 276 aa  152  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  32.04 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  34.57 
 
 		 274 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  33.47 
 
 		 288 aa  144  4e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  32.83 
 
 		 274 aa  142  9e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  28.52 
 
 		 505 aa  137  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  30.91 
 
 		 447 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1946  prephenate dehydrogenase  29.46 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.772286  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  30.11 
 
 		 443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  30.11 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  28.25 
 
 		 437 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  28.16 
 
 		 439 aa  125  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  29.03 
 
 		 443 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  31.73 
 
 		 288 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3767  prephenate dehydrogenase  33.62 
 
 		 242 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000142598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1648  hypothetical protein  23.81 
 
 		 351 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0329926 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  26.13 
 
 		 375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2473  prephenate dehydrogenase  33.5 
 
 		 258 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.413514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  28.73 
 
 		 288 aa  96.7  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0118  Prephenate dehydrogenase  27.06 
 
 		 262 aa  96.7  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2811  Prephenate dehydrogenase  30.18 
 
 		 259 aa  96.3  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  27.41 
 
 		 287 aa  93.6  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1747  Prephenate dehydrogenase  27.07 
 
 		 263 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4586  Prephenate dehydrogenase  26.33 
 
 		 294 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0334  Prephenate dehydrogenase  28.32 
 
 		 292 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  25.75 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1510  prephenate dehydrogenase  26.94 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  25.51 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1877  chorismate mutase / prephenate dehydrogenase  29.03 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.786603 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1453  prephenate dehydrogenase  26.74 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.542491  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1605  prephenate dehydrogenase  29.09 
 
 		 374 aa  79.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.294712  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0545  prephenate dehydrogenase  23.01 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3485  prephenate dehydrogenase  30.29 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01188  prephenate dehydrogenase  29.65 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282588  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1368  Prephenate dehydrogenase  29.31 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  40.26 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0972  prephenate dehydrogenase  34.38 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.161395  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  50 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1429  prephenate dehydrogenase  24.77 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.394252  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3617  chorismate mutase  42.31 
 
 		 110 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766482 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  26.27 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  41.98 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1063  prephenate dehydrogenase  26.55 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0026  chorismate mutase  38.46 
 
 		 96 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630084  normal  0.0206275 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  24.78 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0808  chorismate mutase  23.85 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0594729  normal  0.450237 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2392  Prephenate dehydrogenase  32.73 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.801901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  39.78 
 
 		 397 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  25.48 
 
 		 294 aa  57  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  27.1 
 
 		 294 aa  57  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>