209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3113 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  82.68 
 
 		 461 aa  758    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  79.4 
 
 		 471 aa  747    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  79.92 
 
 		 472 aa  759    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  80.37 
 
 		 465 aa  712    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  81.43 
 
 		 465 aa  752    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  82.82 
 
 		 463 aa  753    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3114  major facilitator transporter  76.65 
 
 		 475 aa  689    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  82.28 
 
 		 463 aa  753    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  100 
 
 		 476 aa  947    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  72.49 
 
 		 466 aa  657    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  81.12 
 
 		 471 aa  762    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  79.4 
 
 		 471 aa  747    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  83.33 
 
 		 472 aa  789    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  81.9 
 
 		 471 aa  765    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  81.29 
 
 		 471 aa  761    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  80.13 
 
 		 478 aa  753    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  55.26 
 
 		 466 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  53.2 
 
 		 462 aa  462  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0209  major facilitator transporter  55.17 
 
 		 466 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  55.68 
 
 		 478 aa  455  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0223  major facilitator transporter  56.32 
 
 		 461 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  55.16 
 
 		 415 aa  439  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0516  major facilitator transporter  55.9 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  53.81 
 
 		 417 aa  420  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0263  major facilitator superfamily MFS_1  55.94 
 
 		 462 aa  415  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464987  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  53.36 
 
 		 449 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  55.08 
 
 		 447 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2636  major facilitator transporter  52.49 
 
 		 429 aa  403  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103448  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0214  major facilitator superfamily MFS_1  53.08 
 
 		 444 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131109  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  43.79 
 
 		 475 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13420  AmpG-related permease  44.25 
 
 		 515 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  46.74 
 
 		 439 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0962  AmpG-related permease  45.63 
 
 		 515 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2143  major facilitator transporter  45.84 
 
 		 450 aa  356  5e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4369  AmpG-related permease  46.44 
 
 		 515 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4494  AmpG-related permease  46.44 
 
 		 515 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1235  muropeptide MFS uptake transporter AmpG  40.72 
 
 		 550 aa  348  1e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4078  AmpG-related permease  45.19 
 
 		 516 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4383  ampG protein, putative  45.14 
 
 		 516 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.920569  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1355  AmpG-related permease  45.93 
 
 		 515 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.010612  normal  0.140605 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1198  AmpG permease  46.44 
 
 		 519 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  44.26 
 
 		 465 aa  345  8.999999999999999e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3596  major facilitator transporter  44.54 
 
 		 478 aa  338  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.597959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1156  major facilitator transporter  39.96 
 
 		 553 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0968602  normal  0.231698 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2288  major facilitator transporter  42.49 
 
 		 468 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  44.37 
 
 		 447 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  42.68 
 
 		 443 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0296  AmpG protein  39.28 
 
 		 457 aa  294  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0367426 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  37.72 
 
 		 504 aa  289  6e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  36.72 
 
 		 482 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  36.5 
 
 		 482 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0624  major facilitator transporter  39.74 
 
 		 461 aa  272  9e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 		 459 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0110  major facilitator superfamily MFS_1  42.59 
 
 		 452 aa  272  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0140571  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 457 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  37.69 
 
 		 454 aa  268  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  37.17 
 
 		 456 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  37.83 
 
 		 443 aa  262  8.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  38 
 
 		 452 aa  260  4e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  38.62 
 
 		 455 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  38.55 
 
 		 460 aa  250  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  36.05 
 
 		 495 aa  248  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  35.23 
 
 		 495 aa  247  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5113  major facilitator superfamily MFS_1  39.49 
 
 		 463 aa  245  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  35.23 
 
 		 428 aa  244  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  36.5 
 
 		 412 aa  244  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  36.58 
 
 		 429 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002702  AmpG permease  33.77 
 
 		 450 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1667  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 451 aa  238  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0579205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0944  MSF transporter  33.85 
 
 		 447 aa  238  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  36.15 
 
 		 429 aa  236  6e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1420  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 		 438 aa  236  6e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.508599 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  35.35 
 
 		 492 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  35.35 
 
 		 492 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  35.35 
 
 		 492 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1889  putative ampG protein  33.41 
 
 		 462 aa  233  6e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  35.56 
 
 		 426 aa  233  8.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  37.81 
 
 		 411 aa  231  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  36.26 
 
 		 492 aa  230  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1648  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 450 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  36.9 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  33.19 
 
 		 425 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1449  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 453 aa  221  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  39.39 
 
 		 409 aa  218  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02935  signal transducer  38 
 
 		 431 aa  218  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.726126  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  34.49 
 
 		 416 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  34.68 
 
 		 426 aa  218  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03703  putative muropeptide transport protein  33.56 
 
 		 448 aa  216  9e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8458  major facilitator superfamily MFS_1  33.56 
 
 		 442 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03281  hypothetical protein  33.73 
 
 		 409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  32.87 
 
 		 491 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  32.87 
 
 		 491 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0814  putative permease  31.19 
 
 		 424 aa  214  3.9999999999999995e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  32.36 
 
 		 417 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  34.95 
 
 		 419 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4016  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 444 aa  212  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  32.64 
 
 		 491 aa  211  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  45.5 
 
 		 1565 aa  211  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  45.5 
 
 		 1565 aa  211  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  32.64 
 
 		 491 aa  210  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>