248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3050 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3380  nucleoside transporter  94.27 
 
 		 419 aa  738    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000393425  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1214  NupC family protein  85.42 
 
 		 432 aa  677    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3232  nucleoside transporter  92.6 
 
 		 419 aa  721    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294256  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3551  nucleoside transporter  93.56 
 
 		 419 aa  738    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000301741  unclonable  0.0000000473709 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1138  nucleoside transporter  92.79 
 
 		 419 aa  717    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000131174  unclonable  0.00000000000578399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3368  nucleoside transporter  92.6 
 
 		 419 aa  721    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000590778  hitchhiker  0.00789316 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  100 
 
 		 419 aa  819    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000162905  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  89.76 
 
 		 420 aa  719    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000239256  n/a   
 
 
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  91.89 
 
 		 419 aa  711    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000565727  hitchhiker  0.000000000517288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  91.65 
 
 		 419 aa  711    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000101153  unclonable  0.0000254337 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  88.33 
 
 		 420 aa  714    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000184803  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  91.41 
 
 		 419 aa  709    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000852943  unclonable  0.000000000104739 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0971  nucleoside transporter  88.31 
 
 		 419 aa  681    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000546598  decreased coverage  0.000216747 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3229  nucleoside transporter  91.89 
 
 		 419 aa  712    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000798644  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  89.74 
 
 		 419 aa  727    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000683947  hitchhiker  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  91.41 
 
 		 419 aa  712    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000097854  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  71.66 
 
 		 427 aa  593  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  69.27 
 
 		 420 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03378  hypothetical protein  69.79 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002628  nucleoside permease NupC  68.62 
 
 		 427 aa  551  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000361858  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  65.88 
 
 		 419 aa  531  1e-149  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  67.76 
 
 		 425 aa  525  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  67.68 
 
 		 418 aa  527  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124283  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3628  nucleoside transporter  68.31 
 
 		 423 aa  504  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0832  NupC family nucleoside transporter  68.31 
 
 		 423 aa  503  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3499  NupC family nucleoside transporter  68.31 
 
 		 423 aa  504  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  63.22 
 
 		 402 aa  499  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0458  nucleoside transporter  66.67 
 
 		 425 aa  495  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0556  nucleoside transporter  65.97 
 
 		 425 aa  496  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  62.41 
 
 		 414 aa  493  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  58.08 
 
 		 422 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  57.75 
 
 		 422 aa  484  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  62.26 
 
 		 403 aa  484  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  58.31 
 
 		 422 aa  481  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  64.02 
 
 		 414 aa  482  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  57.86 
 
 		 406 aa  479  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  57.94 
 
 		 417 aa  479  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0634  Na+ dependent nucleoside transporter  61.19 
 
 		 408 aa  472  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4420  nucleoside transporter  55.06 
 
 		 425 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0740  concentrative nucleoside/H+ symporter  54.48 
 
 		 425 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0887086  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0109  nucleoside transporter  55.16 
 
 		 424 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1069  nucleoside transporter  55.16 
 
 		 424 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1270  nucleoside transporter  55.16 
 
 		 424 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2812  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  55.16 
 
 		 424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2667  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  54.93 
 
 		 566 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0472301  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0129  nucleoside transporter  54.93 
 
 		 424 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  58.09 
 
 		 408 aa  451  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0409  nucleoside transporter  54.93 
 
 		 426 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  54.42 
 
 		 404 aa  439  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1717  nucleoside transporter  55.34 
 
 		 420 aa  435  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  54.65 
 
 		 402 aa  434  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000113486  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  54.92 
 
 		 405 aa  434  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  52.73 
 
 		 402 aa  428  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6659  Na+ dependent nucleoside transporter  51.99 
 
 		 424 aa  428  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0207815  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  52.98 
 
 		 403 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0093  NupC family protein  50.36 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  54.94 
 
 		 399 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  52.52 
 
 		 402 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  52.52 
 
 		 402 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  52.52 
 
 		 402 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  52.76 
 
 		 402 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1234  sodium-dependent nucleoside transport protein  53.12 
 
 		 401 aa  421  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3885  Na+ dependent nucleoside transporter  60.48 
 
 		 408 aa  418  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412566 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  52.98 
 
 		 402 aa  421  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  53.57 
 
 		 402 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3295  Na+ dependent nucleoside transporter-like  50.81 
 
 		 418 aa  415  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0945024  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2675  Na+ dependent nucleoside transporter  50.96 
 
 		 401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  51.8 
 
 		 403 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000134447  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  51.8 
 
 		 403 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000645183  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6715  Na+ dependent nucleoside transporter  50.7 
 
 		 424 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  51.56 
 
 		 403 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3405  Na+ dependent nucleoside transporter  51.67 
 
 		 415 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1592  Na+ dependent nucleoside transporter-like  50.7 
 
 		 424 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6239  Na+ dependent nucleoside transporter  50.7 
 
 		 424 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  52.28 
 
 		 403 aa  404  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000231054  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  50 
 
 		 413 aa  402  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2908  Na+ dependent nucleoside transporter  47.32 
 
 		 419 aa  393  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004082  NupC family protein  53.25 
 
 		 371 aa  385  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.117555  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4296  NupC family protein  48.33 
 
 		 401 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5601  nucleoside transporter, NupC family  51.08 
 
 		 403 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740053  hitchhiker  6.13455e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5085  NupC family nucleoside transporter  51.56 
 
 		 403 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4916  Na+ dependent nucleoside transporter  51.56 
 
 		 403 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.08996e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5359  nucleoside transporter, NupC family  51.56 
 
 		 403 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000539018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4931  Na+ dependent nucleoside transporter  51.56 
 
 		 403 aa  381  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000051013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5475  NupC family nucleoside transporter  51.56 
 
 		 403 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000807855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5325  nucleoside transporter, NupC family  51.56 
 
 		 403 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42869e-44 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3487  Na+ dependent nucleoside transporter  49.5 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1971  Na+ dependent nucleoside transporter  48.92 
 
 		 416 aa  373  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1926  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  49.38 
 
 		 416 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.146383 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3093  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  48.12 
 
 		 417 aa  374  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.687878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2247  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  48.92 
 
 		 416 aa  373  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00577659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  47.73 
 
 		 408 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1497  nucleoside transporter  47.65 
 
 		 416 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293356  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2458  NupC family nucleoside transporter  47.89 
 
 		 416 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2308  NupC family nucleoside transporter  47.89 
 
 		 416 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  hitchhiker  0.000933793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2461  NupC family nucleoside transporter  48.83 
 
 		 416 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.766388  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2297  NupC family nucleoside transporter  47.65 
 
 		 416 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2819  NupC family nucleoside transporter  47.26 
 
 		 408 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3297  nucleoside transporter, NupC family  47.42 
 
 		 416 aa  365  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0805  nucleoside transporter, NupC family  47.65 
 
 		 415 aa  360  3e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>