More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5647 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  100 
 
 
433 aa  866    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.86 
 
 
444 aa  297  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  43.7 
 
 
429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  43.03 
 
 
430 aa  281  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  44.04 
 
 
383 aa  276  7e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  42.62 
 
 
429 aa  270  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  41.38 
 
 
442 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.54 
 
 
405 aa  256  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.23 
 
 
428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  55.41 
 
 
489 aa  236  9e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  41.14 
 
 
433 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  38.13 
 
 
410 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  54.94 
 
 
508 aa  227  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  40.52 
 
 
452 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.01 
 
 
386 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  39.11 
 
 
420 aa  221  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  42.33 
 
 
410 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4726  histidine kinase  37.87 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.6 
 
 
343 aa  212  9e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0375931  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  38.58 
 
 
416 aa  207  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  39.47 
 
 
439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.13 
 
 
418 aa  201  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.43 
 
 
405 aa  192  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  34.79 
 
 
492 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.89 
 
 
395 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.82 
 
 
586 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  38.27 
 
 
412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4688  histidine kinase  37.87 
 
 
419 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.33 
 
 
415 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  47.09 
 
 
402 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  32.22 
 
 
442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2758  histidine kinase  49.13 
 
 
389 aa  180  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00845914  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  36.47 
 
 
446 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.4 
 
 
375 aa  177  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  36.39 
 
 
463 aa  176  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  34.1 
 
 
438 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  35.23 
 
 
434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.26 
 
 
417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  35.17 
 
 
434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 
438 aa  173  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  45.33 
 
 
435 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 
445 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  45.66 
 
 
476 aa  170  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 
435 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 
435 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 
435 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4021  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
411 aa  168  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185539  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0262  putative signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 
465 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.186103 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  44.84 
 
 
388 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11900  signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 
447 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 
445 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.38 
 
 
466 aa  163  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.16 
 
 
432 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.89 
 
 
403 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  48.2 
 
 
463 aa  159  9e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  43.69 
 
 
444 aa  158  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  42.99 
 
 
624 aa  158  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 
461 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.26 
 
 
422 aa  155  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  44.8 
 
 
429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3916  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.7 
 
 
431 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257994  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2642  histidine kinase  38.46 
 
 
426 aa  153  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 
621 aa  144  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
433 aa  144  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  43.72 
 
 
374 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35880  signal transduction histidine kinase  44.87 
 
 
454 aa  139  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 
408 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07210  histidine kinase  42.79 
 
 
237 aa  137  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3104  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.21 
 
 
459 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.8316  hitchhiker  0.000380562 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.65 
 
 
398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149067  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 
408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  42.59 
 
 
580 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
417 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 
725 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  45.27 
 
 
587 aa  124  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 
326 aa  124  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3516  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
388 aa  123  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370817  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8723  Histidine kinase  39.36 
 
 
365 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
570 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 
594 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2641  histidine kinase  35.04 
 
 
453 aa  109  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0175588  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
565 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6491  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 
576 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194722  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4245  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
595 aa  98.2  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3280  histidine kinase  36.25 
 
 
664 aa  97.1  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2603  Histidine kinase  37.67 
 
 
720 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00739798  normal  0.140215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  37.67 
 
 
689 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1533  histidine kinase  38.39 
 
 
451 aa  94.4  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  36.19 
 
 
687 aa  94  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  36.68 
 
 
462 aa  93.6  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 
401 aa  93.2  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 
709 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
407 aa  90.9  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  31.5 
 
 
403 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  38.43 
 
 
650 aa  89.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  32.24 
 
 
373 aa  89.7  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
403 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 
775 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 
469 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.143525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>