More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2642 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2642  histidine kinase  100 
 
 		 426 aa  828    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  42.32 
 
 		 420 aa  267  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.08 
 
 		 422 aa  253  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4021  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.96 
 
 		 411 aa  239  6.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185539  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2758  histidine kinase  47.08 
 
 		 389 aa  239  9e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00845914  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  40.39 
 
 		 410 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.77 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4688  histidine kinase  43.36 
 
 		 419 aa  225  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.87 
 
 		 386 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  41.53 
 
 		 429 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4726  histidine kinase  40.77 
 
 		 405 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.54 
 
 		 444 aa  206  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  40.47 
 
 		 442 aa  204  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.65 
 
 		 405 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 428 aa  199  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  37.68 
 
 		 429 aa  189  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  38.18 
 
 		 463 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  38.46 
 
 		 433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  39.64 
 
 		 433 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  35.6 
 
 		 430 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  37.22 
 
 		 383 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  46.25 
 
 		 489 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  46.7 
 
 		 416 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.06 
 
 		 508 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.3 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0375931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.54 
 
 		 417 aa  170  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  38.63 
 
 		 410 aa  169  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.21 
 
 		 403 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.75 
 
 		 395 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 586 aa  163  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  45.41 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.72 
 
 		 415 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 461 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.57 
 
 		 445 aa  160  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.81 
 
 		 375 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  45.16 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  45.38 
 
 		 435 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.38 
 
 		 435 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.38 
 
 		 435 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  35.96 
 
 		 452 aa  156  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 		 624 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 438 aa  150  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  42.61 
 
 		 435 aa  149  7e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 		 418 aa  149  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  35.05 
 
 		 442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  46.58 
 
 		 412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0262  putative signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 465 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.99 
 
 		 445 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  34.73 
 
 		 438 aa  144  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  47.25 
 
 		 434 aa  144  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  48 
 
 		 439 aa  143  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 		 466 aa  143  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  42.29 
 
 		 429 aa  142  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  47.25 
 
 		 463 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  44.95 
 
 		 476 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  41.16 
 
 		 492 aa  141  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 		 433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.51 
 
 		 621 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3516  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.8 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  44.29 
 
 		 434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.58 
 
 		 432 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3916  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 		 431 aa  136  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257994  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 417 aa  136  9e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  44.55 
 
 		 444 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 326 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  43.26 
 
 		 374 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11900  signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  35 
 
 		 580 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 		 570 aa  124  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07210  histidine kinase  39.52 
 
 		 237 aa  123  6e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35880  signal transduction histidine kinase  45.37 
 
 		 454 aa  123  8e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  32.71 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8723  Histidine kinase  44.04 
 
 		 365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3104  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.37 
 
 		 459 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.8316  hitchhiker  0.000380562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 408 aa  120  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 587 aa  119  9e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149067  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2641  histidine kinase  34.74 
 
 		 453 aa  113  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0175588  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 382 aa  112  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  37.21 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 440 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 		 725 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 408 aa  108  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 594 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1596  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310205  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  37.1 
 
 		 686 aa  103  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  38.58 
 
 		 338 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 445 aa  103  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 403 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  35.41 
 
 		 650 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 407 aa  99.8  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4245  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 595 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2603  Histidine kinase  35.16 
 
 		 720 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00739798  normal  0.140215 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  30.74 
 
 		 483 aa  95.9  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3280  histidine kinase  35.27 
 
 		 664 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 565 aa  95.5  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 618 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.227088  decreased coverage  0.00155525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  36.32 
 
 		 687 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  33.77 
 
 		 430 aa  93.6  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6491  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 576 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194722  normal  0.40327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>