68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4725 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4725  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  100 
 
 		 272 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045977 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  59.4 
 
 		 286 aa  344  7e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  53.87 
 
 		 328 aa  325  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  55.38 
 
 		 286 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0266  hypothetical protein  42.8 
 
 		 263 aa  241  1e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1653  hypothetical protein  30.35 
 
 		 500 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0144  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  29.27 
 
 		 275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4003  hypothetical protein  30.98 
 
 		 906 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6511  hypothetical protein  28.08 
 
 		 497 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0138  hypothetical protein  31.88 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.650511  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0142  hypothetical protein  31.2 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0156  hypothetical protein  31.9 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0145  hypothetical protein  31.03 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  25.37 
 
 		 632 aa  75.1  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  27.16 
 
 		 480 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  27.16 
 
 		 511 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  28.91 
 
 		 479 aa  74.7  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  26.24 
 
 		 477 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0345  hypothetical protein  29.41 
 
 		 474 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  26.96 
 
 		 484 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  25 
 
 		 481 aa  68.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  25 
 
 		 476 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  26.17 
 
 		 511 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  25.65 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  23.85 
 
 		 441 aa  62.8  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5662  hypothetical protein  28.44 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3403  hypothetical protein  23.4 
 
 		 532 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00805318  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5659  hypothetical protein  26.48 
 
 		 1319 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3377  phage protein  30.17 
 
 		 516 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00845273  hitchhiker  0.00000000000000133815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  23.02 
 
 		 541 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  24.64 
 
 		 482 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0033  hypothetical protein  26.83 
 
 		 603 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0025  hypothetical protein  26.83 
 
 		 603 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1068  hypothetical protein  32.73 
 
 		 480 aa  55.5  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004333  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1199 aa  55.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330356  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  27.14 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0550  hypothetical protein  26.1 
 
 		 537 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6364  hypothetical protein  25.48 
 
 		 606 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.038941  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2750  hypothetical protein  29.91 
 
 		 305 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.595373  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1992  hypothetical protein  23.65 
 
 		 518 aa  52.4  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2752  hypothetical protein  30.92 
 
 		 1160 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.923311  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2355  hypothetical protein  26.45 
 
 		 534 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.750444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0072  hypothetical protein  24.89 
 
 		 838 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.661071  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  25 
 
 		 514 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2699  hypothetical protein  30.29 
 
 		 1170 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0019  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1320 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.831079  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2265  hypothetical protein  26.48 
 
 		 540 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0029  hypothetical protein  23.19 
 
 		 377 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2961  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1160 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2958  hypothetical protein  30.29 
 
 		 1160 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000406417 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2999  hypothetical protein  30.24 
 
 		 1161 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128545  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2678  hypothetical protein  30.29 
 
 		 1170 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3005  hypothetical protein  30.29 
 
 		 1160 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386641  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2487  hypothetical protein  24.9 
 
 		 436 aa  49.7  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0438109  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2279  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1160 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522466 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3327  hypothetical protein  20.64 
 
 		 435 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000506493  hitchhiker  9.65434e-22 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2015  hypothetical protein  29.44 
 
 		 1166 aa  47.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6572  hypothetical protein  32.03 
 
 		 358 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102603  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0454  phage protein  30 
 
 		 538 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267672  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2653  phage protein  30 
 
 		 538 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0687  hypothetical protein  24.29 
 
 		 519 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0836  hypothetical protein  24.29 
 
 		 613 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.715517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0100  hypothetical protein  33.33 
 
 		 541 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535772  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2928  hypothetical protein  27.36 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01367  hypothetical protein  29.41 
 
 		 459 aa  43.5  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.667542  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1324  hypothetical protein  31.48 
 
 		 716 aa  43.5  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.772779 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0957  hypothetical protein  29.25 
 
 		 452 aa  43.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3532  hypothetical protein  25.37 
 
 		 792 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.263961 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>