More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3982 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3982  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 368 aa  739    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6451  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.84 
 
 		 377 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6274  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.84 
 
 		 377 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1159  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.26 
 
 		 377 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.314153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1464  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.43 
 
 		 375 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8128  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.43 
 
 		 375 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3057  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.66 
 
 		 373 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0713063 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3412  Iron-containing alcohol dehydrogenase  53.39 
 
 		 392 aa  362  4e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 		 397 aa  276  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0521  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.01 
 
 		 383 aa  242  7e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118982 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4943  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  41.98 
 
 		 385 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375402  normal  0.972058 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  42.19 
 
 		 385 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4360  alcohol dehydrogenase  44.07 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4006  alcohol dehydrogenase  44.07 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3517  alcohol dehydrogenase  43.73 
 
 		 385 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.304175 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3919  alcohol dehydrogenase  43.24 
 
 		 385 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0768529  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.39 
 
 		 385 aa  220  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3412  alcohol dehydrogenase  41.38 
 
 		 385 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.117335 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2049  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.68 
 
 		 387 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3692  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 		 387 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4319  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.18 
 
 		 389 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4429  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.18 
 
 		 389 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240363  normal  0.58487 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.25 
 
 		 387 aa  209  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  39.51 
 
 		 388 aa  208  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  39.81 
 
 		 388 aa  208  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 		 392 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.98 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5929  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  45.03 
 
 		 387 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.293449  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1409  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.99 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802441  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2947  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.39 
 
 		 402 aa  205  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.581281  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.51 
 
 		 391 aa  203  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68500  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  44.44 
 
 		 387 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.354692 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  40 
 
 		 380 aa  202  6e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.51 
 
 		 392 aa  202  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.15 
 
 		 388 aa  202  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.17 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0381  alcohol dehydrogenase  42.99 
 
 		 387 aa  197  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4452  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.25 
 
 		 379 aa  197  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0907  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.24 
 
 		 387 aa  195  8.000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0853  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 		 387 aa  194  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346156 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3537  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.97 
 
 		 378 aa  192  7e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3147  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.3 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.55 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3708  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.97 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0259556  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7023  hypothetical protein  37.54 
 
 		 392 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175699  normal  0.696509 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0647  iron-containing alcohol dehydrogenase  36 
 
 		 378 aa  190  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2729  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.61 
 
 		 384 aa  189  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0242  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.05 
 
 		 418 aa  189  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.88 
 
 		 389 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 		 384 aa  186  4e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.2 
 
 		 388 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.54 
 
 		 388 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.54 
 
 		 388 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.71 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0690  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 		 378 aa  182  7e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0244926  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0105  alcohol dehydrogenase  33.67 
 
 		 408 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.535582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5965  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.64 
 
 		 388 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0415  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.68 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00838464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2211  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.27 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0883961  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.82 
 
 		 410 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 383 aa  180  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 		 393 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1237  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.76 
 
 		 412 aa  180  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0425  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.97 
 
 		 386 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.2 
 
 		 383 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4998  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.6 
 
 		 409 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.81 
 
 		 381 aa  179  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.02 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.6 
 
 		 386 aa  178  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34 
 
 		 400 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1431  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.23 
 
 		 386 aa  176  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  34 
 
 		 400 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4594  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.83 
 
 		 384 aa  176  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3348  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 		 386 aa  176  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.478769 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  34 
 
 		 400 aa  176  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  34 
 
 		 392 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34 
 
 		 400 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34 
 
 		 400 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.9 
 
 		 398 aa  175  9e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.33 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 		 382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.98 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.28 
 
 		 395 aa  172  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.03 
 
 		 388 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  32.62 
 
 		 381 aa  172  9e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.33 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2525  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.94 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2606  ethanolamine utilization protein EutG  34.83 
 
 		 395 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2721  ethanolamine utilization protein EutG  34.83 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2695  ethanolamine utilization protein EutG  34.83 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2654  ethanolamine utilization protein EutG  34.83 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0517138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 		 382 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.95 
 
 		 388 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2828  ethanolamine utilization protein EutG  34.83 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  32 
 
 		 385 aa  170  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.32 
 
 		 382 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  30.84 
 
 		 382 aa  169  7e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  33.23 
 
 		 382 aa  169  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>