235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2413 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2413  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  526  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.163379 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  71.53 
 
 		 297 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  69.4 
 
 		 301 aa  353  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  63.7 
 
 		 299 aa  329  4e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0737  hypothetical protein  62.99 
 
 		 281 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0689  hypothetical protein  62.99 
 
 		 281 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.164127  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.64 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.97 
 
 		 314 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5965  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.28 
 
 		 328 aa  136  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.61 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2973  hypothetical protein  31.27 
 
 		 325 aa  129  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2065  hypothetical protein  40.75 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.811654 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  35.51 
 
 		 296 aa  125  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5204  hypothetical protein  41.22 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.97 
 
 		 295 aa  106  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2448  hypothetical protein  32.5 
 
 		 311 aa  105  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  28.47 
 
 		 302 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3122  hypothetical protein  30.31 
 
 		 322 aa  97.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 		 302 aa  96.3  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.23 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  25.74 
 
 		 294 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  25.74 
 
 		 294 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  30.34 
 
 		 308 aa  92.4  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  30.58 
 
 		 310 aa  92  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0090  hypothetical protein  32.51 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  31.41 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  25.74 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  25.74 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  25 
 
 		 294 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.18 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1219  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.14 
 
 		 288 aa  86.3  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  24.09 
 
 		 295 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  26.16 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.81 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0861  hypothetical protein  27.66 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2379  hypothetical protein  24.45 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  24.63 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  25.55 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2001  hypothetical protein  30.69 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  25.18 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.77 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.918526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.84 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  25.55 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.57 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2109  hypothetical protein  28.68 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0063  hypothetical protein  33.91 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1136  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.02 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4761  hypothetical protein  35.79 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  26.67 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  27.64 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  26.67 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  26.67 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  26.67 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  26.67 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  26.67 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  26.67 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0791  hypothetical protein  28.88 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0217127  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  26.3 
 
 		 303 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  26.47 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  27.86 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  25.56 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0563  hypothetical protein  28.87 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0587  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.43 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.770016  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.93 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31360  predicted protein  27.88 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000820456  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  31.15 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.1 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.484087 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2028  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  27.64 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  27.61 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.14 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  30.85 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2519  hypothetical protein  31.88 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.561835 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.06 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1442  hypothetical protein  32.73 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.231485  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  29.92 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1991  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.85 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.85 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.618176 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0816  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.27 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.221169  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.93 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0798  integral membrane protein  27.24 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.252294  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  28.36 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  25.28 
 
 		 322 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  30.36 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0097  hypothetical protein  35.88 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.54 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841785  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0748  hypothetical protein  26.05 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1193  DMT superfamily efflux pump  25.09 
 
 		 310 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.516165 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  30.34 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  29.08 
 
 		 341 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0547  hypothetical protein  33.54 
 
 		 319 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.059421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  30.08 
 
 		 286 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.55 
 
 		 293 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1038  hypothetical protein  28.1 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000348344  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  26.83 
 
 		 289 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3441  hypothetical protein  27.86 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0018566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>