110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2319 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2319  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  100 
 
 		 127 aa  262  8.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.622069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2524  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  61.33 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0379048  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4745  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  60 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.693896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2184  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  58.9 
 
 		 102 aa  87.4  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446782 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0091  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  53.52 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0089  DNA-binding protein, putative  53.52 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1291  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2505  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000574166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3008  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.67 
 
 		 104 aa  67  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1590  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.77 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0352422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42030  antitoxin protein  44.87 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1677  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.21 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1062  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000765045 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0571  XRE family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2491  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.16 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.289319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2889  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.67 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.955801  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2499  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.47 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0881387  normal  0.214118 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2469  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.04 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3083  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.04 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3101  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.04 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768418 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2779  plasmid maintenance system antidote protein  35.63 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.48213  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1105  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.06 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912318  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6433  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.04 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6998  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  36.59 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337811  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0422  virulence-associated protein, putative  37.78 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3241  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.47 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0714927  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1105  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  37.97 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0903859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1123  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  47.62 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000109926  normal  0.590059 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2430  plasmid maintenance system antidote protein  36.59 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216096  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  38.67 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0899701  normal  0.785699 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3836  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.74 
 
 		 96 aa  52  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3765  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.53 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1455  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.077029  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0023  plasmid maintenance system antidote protein HigA  38.67 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0227137  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3858  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.97 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0437  plasmid maintenance system antidote protein  36.84 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494996  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0415  putative plasmid maintenance system antidote protein VapI  44.83 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4040  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.33 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3818  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.5 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00442118  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3643  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.25 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0160538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1633  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  35.06 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.110422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4141  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.06 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1963  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.18 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0393563 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2823  putative plasmid maintenance system antidote protein  34.62 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2571  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.67 
 
 		 109 aa  49.7  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0697  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.99 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3616  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.99 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322775  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2031  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.21 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.65469  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2972  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.62 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0578  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0417  XRE family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3236  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.36 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5444  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.23 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.26731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4828  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.62 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4148  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.94 
 
 		 101 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4678  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.21 
 
 		 98 aa  47.4  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2319  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.15 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1484  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.75 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5380  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.16 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.031339  hitchhiker  0.000847786 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2342  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.18 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0405  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.3 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1144  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.3 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2881  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.68 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.516447  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0533  virulence-associated protein I  35.21 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.888429  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1669  addiction module antidote protein  35.21 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2927  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.78 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0608  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.7 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1669  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.78 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0043  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.73 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4500  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.77 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3068  plasmid maintenance system antidote protein  39.44 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959159  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1385  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  29.79 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4192  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.62 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0947  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.49 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2644  putative addiction module  35.21 
 
 		 1365 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3225  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.99 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.114466 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0834  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.88 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2894  addiction module antidote protein, HigA family  30.23 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1585  antidote protein, putative  36.62 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4449  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.16 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0361  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.23 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0372  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.25 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0403  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.75 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1142  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  31.75 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1211  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.21 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1125  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.39 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5378  addiction module antidote protein  36.76 
 
 		 101 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1065  plasmid maintenance system antidote protein  31.08 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61840  putative virulence-associated protein  36.76 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4180  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.36 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1672  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.1 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0412  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.21 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3001  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.8 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.770477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1256  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0149882 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2829  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.14 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0896969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4131  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.78 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0937778  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0431  hypothetical protein  29.73 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3935  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.33 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2764  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.71 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>