172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1552 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  100 
 
 		 458 aa  918    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  61.62 
 
 		 456 aa  579  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  61.4 
 
 		 456 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1895  ABC transporter substrate binding protein  58.77 
 
 		 455 aa  522  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1542  hypothetical protein  43.45 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.133417  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0988  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.66 
 
 		 331 aa  210  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  39.68 
 
 		 331 aa  207  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  41.73 
 
 		 331 aa  203  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  30.63 
 
 		 360 aa  169  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  28.45 
 
 		 360 aa  163  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  28.23 
 
 		 360 aa  161  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  27.59 
 
 		 360 aa  158  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3670  hypothetical protein  34.7 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0456409 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2805  Mammalian cell entry related domain protein  31.18 
 
 		 357 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1629  hypothetical protein  31.49 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.232196 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  33.64 
 
 		 369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4935  hypothetical protein  34.01 
 
 		 359 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.704687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4963  Mammalian cell entry related domain protein  26.64 
 
 		 359 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5555  ABC transporter periplasmic-binding protein  32.52 
 
 		 292 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99193  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  33.33 
 
 		 302 aa  118  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1317  hypothetical protein  30.59 
 
 		 293 aa  117  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  33.78 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4483  Mammalian cell entry related domain protein  30.45 
 
 		 297 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1638  hypothetical protein  32.94 
 
 		 317 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  27.76 
 
 		 313 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  32.34 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  30.68 
 
 		 312 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  34.45 
 
 		 367 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  29.73 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  31.62 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1454  hypothetical protein  29.02 
 
 		 289 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4115  hypothetical protein  29.83 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0544388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  31.62 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.49 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  27.49 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  28.17 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  32.26 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  33.03 
 
 		 312 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  27.82 
 
 		 312 aa  106  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  31.34 
 
 		 390 aa  106  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  32.55 
 
 		 312 aa  106  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  29.76 
 
 		 308 aa  103  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  29.2 
 
 		 306 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  26.96 
 
 		 312 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  25.08 
 
 		 307 aa  103  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  36.02 
 
 		 321 aa  103  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  33.33 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  35.48 
 
 		 321 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  27 
 
 		 312 aa  100  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  26.05 
 
 		 433 aa  98.2  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  25.68 
 
 		 579 aa  98.2  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  26.5 
 
 		 305 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0376  Mammalian cell entry related domain protein  32.06 
 
 		 295 aa  97.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  32.22 
 
 		 313 aa  97.1  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  32.72 
 
 		 378 aa  95.5  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  28.22 
 
 		 296 aa  95.5  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  24.72 
 
 		 321 aa  94  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  24.75 
 
 		 307 aa  93.2  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  24.82 
 
 		 307 aa  92.8  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04760  MCE domain protein  26.85 
 
 		 312 aa  91.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  23.15 
 
 		 312 aa  92  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.87 
 
 		 296 aa  91.3  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.87 
 
 		 296 aa  90.1  7e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  29.44 
 
 		 310 aa  89  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2002  hypothetical protein  31.47 
 
 		 316 aa  88.6  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  27.27 
 
 		 316 aa  89  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  25.54 
 
 		 334 aa  85.9  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1435  hypothetical protein  24.05 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  27.22 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.66 
 
 		 275 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  24.91 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2275  Mammalian cell entry related domain protein  38.05 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0090  mce related protein  25.82 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  32.76 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2843  hypothetical protein  27.24 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0178  Mammalian cell entry related domain protein  23.31 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1526  hypothetical protein  27.78 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0265226  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1983  hypothetical protein  25.86 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0315  signal peptide protein  26.07 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0575  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  25.21 
 
 		 288 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0172  Mce family protein  26.33 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0099  hypothetical protein  23.99 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447004  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2368  hypothetical protein  24.65 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.709282  normal  0.77833 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0475  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  33.05 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.848355  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0661  hypothetical protein  28.46 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.350173 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0252  hypothetical protein  24.81 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0686058 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0246  Mammalian cell entry related domain protein  24.81 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0070  hypothetical protein  24.83 
 
 		 313 aa  66.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  26.28 
 
 		 315 aa  66.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0170  Mammalian cell entry related domain protein  23.93 
 
 		 322 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1794  Mammalian cell entry related domain protein  25.62 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0375  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25 
 
 		 309 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.747955  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2135  mce-related protein  25.62 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0177  Mammalian cell entry related domain protein  24.35 
 
 		 322 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0405  hypothetical protein  25.74 
 
 		 309 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0144565 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0308  hypothetical protein  28.7 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0064  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.25 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.702785  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0614  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.25 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399104  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  29 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3199  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.25 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>