72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1271 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1271  pili assembly chaperone  100 
 
 		 244 aa  478  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01137  pili assembly chaperone  49.78 
 
 		 235 aa  219  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0327551  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1922  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  44.21 
 
 		 242 aa  191  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1830  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  43.89 
 
 		 254 aa  156  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2474  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  41.27 
 
 		 237 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.631121  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1801  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  35.71 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.109168  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1961  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  36.67 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2361  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  36.51 
 
 		 264 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.200412  normal  0.497633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3334  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  36.51 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2340  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  41.27 
 
 		 237 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.200473 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5758  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  40.96 
 
 		 236 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1269  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  38.94 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0558339  normal  0.0398715 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3670  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  35.42 
 
 		 260 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.295639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4396  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  36.32 
 
 		 239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1070  putative pilus assembly chaperone  38.1 
 
 		 236 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1222  hypothetical protein  38.1 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0849986  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1606  hypothetical protein  38.1 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0722  hypothetical protein  38.1 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278946  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2993  hypothetical protein  38.1 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.810791  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2293  hypothetical protein  38.1 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1063  P pilus assembly protein, chaperone PapD  38.1 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61530  putative pili assembly chaperone  37.2 
 
 		 262 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.223638 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1447  putative fimbrial chaperone  34.29 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5300  putative pili assembly chaperone  36.71 
 
 		 262 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0866  hypothetical protein  36.92 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00391209  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2818  putative fimbrial chaperone  35.21 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2460  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  34.04 
 
 		 253 aa  122  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1613  type I pilus usher pathway chaperone CsuC  34.48 
 
 		 279 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1792  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  34.48 
 
 		 279 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1635  fimbrial chaperone protein  34.48 
 
 		 279 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1398  putative fimbrial assembly chaperone  33.62 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0478  putative fimbrial assembly chaperone  33.62 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.621456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0680  putative fimbrial assembly chaperone  33.62 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902912  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0875  fimbrial assembly chaperone, putative  33.62 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2109  putative chaperone protein  33.62 
 
 		 254 aa  119  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0024073 
 
 
-
 
NC_003296  RS03042  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  41.3 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168941  normal  0.259112 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4689  putataive fimbrial chaperone protein  37.31 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192366  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2678  fimbrial assembly chaperone, putative  33.62 
 
 		 279 aa  115  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4601  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  33.73 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1664  pilus assembly chaperone  30.08 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.74351  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2670  pilus assembly chaperone  30.08 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0194825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1775  chaperone protein  30.08 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241363  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1267  pili assembly chaperone  35.07 
 
 		 237 aa  108  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.475835 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001217  pilus assembly protein chaperone PapD  27.27 
 
 		 252 aa  105  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01133  pili assembly chaperone  34.05 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0694484  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2694  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  33.33 
 
 		 253 aa  95.5  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.25409 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0006  pilus chaperone protein, putative  29.46 
 
 		 247 aa  89  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0451749  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0007  chaperone protein EcpD  29.46 
 
 		 247 aa  89  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0410847  hitchhiker  0.00437464 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0343  putative pilus assembly protein chaperone PapD  28.71 
 
 		 241 aa  88.2  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0779  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  31.66 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.765293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0611  chaperone protein PmfD, putative  29.86 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000224808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5510  putative fimbrial chaperone protein  31.42 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2058  putative P pilus assembly protein, chaperone PapD  28.66 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.62462e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0305  chaperone protein pmfD, putative  26.7 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3666  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  36.21 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.486976  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0145  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  30.77 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.195396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  24.89 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3600  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  35.34 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0536  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  26.97 
 
 		 251 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3741  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  35.09 
 
 		 250 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  25.24 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  27.93 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0762  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.3 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0172596 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  26.05 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03366  hypothetical protein  24.62 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3810  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.15 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.124157 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3923  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.15 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.358656  normal  0.566628 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1754  putative periplasmic chaperone protein  30.92 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6325  putative periplasmic chaperone protein  30.92 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.997215  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2449  pili assembly chaperone  22.83 
 
 		 228 aa  42  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0615  chaperone protein PapD  25.49 
 
 		 239 aa  42.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  25 
 
 		 227 aa  42  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>