More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3180 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  100 
 
 
345 aa  714    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  78.96 
 
 
347 aa  589  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5726  aldo/keto reductase  72.46 
 
 
349 aa  521  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.2086 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  68.31 
 
 
344 aa  511  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  67.25 
 
 
343 aa  468  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  64.91 
 
 
343 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  63.13 
 
 
340 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  63.74 
 
 
344 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6644  aldo/keto reductase  62.97 
 
 
342 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000695523  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1427  aldo/keto reductase  62.94 
 
 
341 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  63.58 
 
 
344 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  63.74 
 
 
389 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3015  putative oxidoreductase, MocA  63.24 
 
 
341 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  63.16 
 
 
344 aa  443  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3210  aldo/keto reductase  61.52 
 
 
342 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255002 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  61.85 
 
 
344 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  60.35 
 
 
344 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  60.93 
 
 
345 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  58.5 
 
 
349 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  60.35 
 
 
345 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  61.95 
 
 
345 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  60.35 
 
 
345 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  60.35 
 
 
345 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  58.31 
 
 
345 aa  416  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  61.36 
 
 
345 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  60.6 
 
 
344 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3594  aldo/keto reductase  60.6 
 
 
344 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3505  aldo/keto reductase  59.1 
 
 
344 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  59.75 
 
 
343 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4249  aldo/keto reductase  62.23 
 
 
343 aa  401  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.615627  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4075  aldo/keto reductase  56.51 
 
 
342 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4151  aldo/keto reductase  56.51 
 
 
342 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4305  aldo/keto reductase  56.8 
 
 
342 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0836372  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  53.92 
 
 
349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  53.15 
 
 
352 aa  353  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  52.82 
 
 
350 aa  352  7e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  50.9 
 
 
359 aa  351  1e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  51.81 
 
 
355 aa  349  4e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  53.61 
 
 
352 aa  344  2e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  48.8 
 
 
352 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0526  aldo/keto reductase  52.89 
 
 
341 aa  342  5.999999999999999e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  49.25 
 
 
354 aa  340  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  48.8 
 
 
352 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  46.69 
 
 
351 aa  320  3e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1954  aldo/keto reductase  51.65 
 
 
349 aa  315  5e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464115  normal  0.0603236 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  45.18 
 
 
357 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  45.24 
 
 
349 aa  295  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  45.21 
 
 
338 aa  294  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  45.83 
 
 
350 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  43.45 
 
 
349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  43.15 
 
 
349 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  43.4 
 
 
358 aa  283  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  43.15 
 
 
349 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  43.54 
 
 
353 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  42.94 
 
 
346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  41.55 
 
 
338 aa  270  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1736  aldo/keto reductase  43.58 
 
 
378 aa  270  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  41.43 
 
 
370 aa  268  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  42.34 
 
 
342 aa  268  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  42.65 
 
 
338 aa  267  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  44.08 
 
 
335 aa  267  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  40.29 
 
 
348 aa  266  5e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  44.44 
 
 
341 aa  263  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  40.86 
 
 
351 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  42.06 
 
 
338 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  40.86 
 
 
351 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  40.86 
 
 
351 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  41 
 
 
345 aa  263  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0588  aldo/keto reductase  41.47 
 
 
360 aa  263  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  41.3 
 
 
339 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  40.86 
 
 
351 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  41.3 
 
 
339 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  42.26 
 
 
349 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  40.12 
 
 
361 aa  260  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  40.92 
 
 
349 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  43.98 
 
 
325 aa  255  7e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  39.88 
 
 
340 aa  249  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6423  aldo/keto reductase  39.76 
 
 
339 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251084  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  41.67 
 
 
333 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  39.25 
 
 
322 aa  242  5e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  38.27 
 
 
313 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  40.74 
 
 
333 aa  239  6.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3467  aldo/keto reductase  41.14 
 
 
361 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.648507  normal  0.107464 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  39.17 
 
 
343 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  39.45 
 
 
313 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  40.62 
 
 
334 aa  233  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  39.38 
 
 
334 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  39.63 
 
 
313 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  37.76 
 
 
327 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  39.88 
 
 
333 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  39.25 
 
 
333 aa  231  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  38.39 
 
 
326 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  39.18 
 
 
343 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1178  aldo/keto reductase  39.34 
 
 
353 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  39.41 
 
 
343 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  39.12 
 
 
343 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3379  aldo/keto reductase  39.81 
 
 
325 aa  229  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  39.75 
 
 
334 aa  229  6e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
358 aa  229  6e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  38.53 
 
 
313 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>