More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_29550 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_29550  LSU ribosomal protein L15P  100 
 
 		 210 aa  407  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0646  ribosomal protein L15  89.51 
 
 		 163 aa  263  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2640  ribosomal protein L15  84.46 
 
 		 243 aa  254  7e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0606  ribosomal protein L15  83.1 
 
 		 158 aa  240  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0645058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0707  50S ribosomal protein L15  80.28 
 
 		 152 aa  240  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.226729 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3124  ribosomal protein L15  75.82 
 
 		 177 aa  228  7e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0950  ribosomal protein L15  76.92 
 
 		 146 aa  227  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23610  LSU ribosomal protein L15P  75.69 
 
 		 152 aa  226  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.947498  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2957  50S ribosomal protein L15P  76.67 
 
 		 164 aa  219  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0257163  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16980  LSU ribosomal protein L15P  76.6 
 
 		 150 aa  215  4e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000603735  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3886  50S ribosomal protein L15  71.13 
 
 		 146 aa  214  7e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2669  ribosomal protein L15  76.92 
 
 		 161 aa  211  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6030  ribosomal protein L15  68.35 
 
 		 164 aa  208  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0601  50S ribosomal protein L15  70.07 
 
 		 176 aa  207  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20680  LSU ribosomal protein L15P  69.01 
 
 		 162 aa  206  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3687  ribosomal protein L15  67.83 
 
 		 146 aa  205  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000433235  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0325  50S ribosomal protein L15P  69.44 
 
 		 164 aa  204  8e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000824445 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2627  50S ribosomal protein L15  70.83 
 
 		 149 aa  201  9e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153317  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10737  50S ribosomal protein L15  67.13 
 
 		 146 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000257379  normal  0.525203 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3398  ribosomal protein L15  68.06 
 
 		 152 aa  200  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.943423  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6595  ribosomal protein L15  69.23 
 
 		 147 aa  199  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5028  50S ribosomal protein L15  67.13 
 
 		 148 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000374852  normal  0.187727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1063  50S ribosomal protein L15  65.73 
 
 		 149 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00432463  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1034  50S ribosomal protein L15  65.73 
 
 		 149 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000123814  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1051  50S ribosomal protein L15  65.73 
 
 		 149 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00689319  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4302  ribosomal protein L15  71.03 
 
 		 153 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1105  ribosomal protein L15  68.06 
 
 		 151 aa  194  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1204  50S ribosomal protein L15  67.38 
 
 		 151 aa  194  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04170  LSU ribosomal protein L15P  66.9 
 
 		 148 aa  192  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3904  50S ribosomal protein L15  65.97 
 
 		 147 aa  192  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.196283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4296  50S ribosomal protein L15  66.67 
 
 		 147 aa  192  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1341  50S ribosomal protein L15  65.03 
 
 		 147 aa  190  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00428726  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5143  ribosomal protein L15  68.06 
 
 		 154 aa  188  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66888 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1726  50S ribosomal protein L15  64.34 
 
 		 150 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000205453  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1142  ribosomal protein L15  65.52 
 
 		 147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.594026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0270  ribosomal protein L15  64.34 
 
 		 151 aa  182  3e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0581  50S ribosomal protein L15  64.58 
 
 		 151 aa  179  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4488  ribosomal protein L15  63.19 
 
 		 147 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  53.79 
 
 		 152 aa  144  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1633  50S ribosomal protein L15  54 
 
 		 161 aa  129  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0185879  normal  0.0637021 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  48.95 
 
 		 152 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09810  LSU ribosomal protein L15P  52.41 
 
 		 149 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0846946  hitchhiker  0.0000267286 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  45.89 
 
 		 153 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  45.89 
 
 		 153 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0417  ribosomal protein L15  55.24 
 
 		 166 aa  124  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  44.52 
 
 		 153 aa  122  4e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 		 147 aa  121  6e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0786  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 150 aa  121  7e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000129799  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  46.85 
 
 		 149 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  52.45 
 
 		 146 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  53.47 
 
 		 149 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  50.7 
 
 		 176 aa  118  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 153 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2755  ribosomal protein L15  47.33 
 
 		 160 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0991821  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf422  50S ribosomal protein L15  45.52 
 
 		 145 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  50 
 
 		 150 aa  116  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1142  ribosomal protein L15  51.03 
 
 		 148 aa  117  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000449259  normal  0.0114538 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  52.45 
 
 		 146 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  45.77 
 
 		 148 aa  116  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0334  50S ribosomal protein L15  50.66 
 
 		 162 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  48.28 
 
 		 147 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0734  ribosomal protein L15  51.95 
 
 		 153 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1927  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 162 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  46.9 
 
 		 149 aa  113  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4779  50S ribosomal protein L15  49.33 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000514125 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  48.3 
 
 		 147 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 146 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  46.85 
 
 		 147 aa  112  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  43.66 
 
 		 148 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  46.26 
 
 		 152 aa  111  8.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 146 aa  111  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  48.97 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  48.97 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  48.97 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  48.97 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  48.97 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  48.97 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  48.97 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2145  50S ribosomal protein L15  49.33 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  47.59 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  47.59 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  48.97 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0304  50S ribosomal protein L15  48.67 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1373  50S ribosomal protein L15  46 
 
 		 160 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.131365 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2210  50S ribosomal protein L15  45.03 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000039304  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2460  50S ribosomal protein L15  48.67 
 
 		 169 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.907941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2182  50S ribosomal protein L15  48.67 
 
 		 169 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.34852 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0779  50S ribosomal protein L15  48.67 
 
 		 161 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  48.97 
 
 		 146 aa  109  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 		 146 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0561  50S ribosomal protein L15  48.32 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2888  ribosomal protein L15  49.32 
 
 		 163 aa  108  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.467905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0861  ribosomal protein L15  46.71 
 
 		 153 aa  108  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.778945  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3005  50S ribosomal protein L15  46.58 
 
 		 170 aa  108  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  hitchhiker  0.00861224 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  48.28 
 
 		 146 aa  107  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0274  50S ribosomal protein L15  47.02 
 
 		 156 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0537991  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  49.31 
 
 		 146 aa  106  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>