115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2600 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2533  sugar isomerase (SIS)  98.45 
 
 
386 aa  785    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2600  sugar isomerase (SIS)  100 
 
 
386 aa  798    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.792182  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2699  sugar isomerase (SIS)  97.41 
 
 
386 aa  781    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1196  phosphosugar isomerase  53.59 
 
 
397 aa  398  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.570521 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3577  sugar isomerase (SIS)  46.65 
 
 
380 aa  321  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.311129  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0318  sugar isomerase (SIS)  43.72 
 
 
387 aa  313  2.9999999999999996e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500662  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03003  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  45.16 
 
 
384 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2392  sugar isomerase, AgaS family  45.16 
 
 
384 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3618  AgaS family sugar isomerase  45.16 
 
 
384 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3435  AgaS family sugar isomerase  45.16 
 
 
384 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02954  hypothetical protein  45.16 
 
 
384 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0569  sugar isomerase, AgaS family  45.16 
 
 
384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.117489  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1904  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase, putative  39.84 
 
 
395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.767502  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3328  AgaS family sugar isomerase  45.16 
 
 
384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0562  AgaS family sugar isomerase  45.16 
 
 
384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4453  putative sugar isomerase, AgaS family  45.16 
 
 
384 aa  306  3e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.24237  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1639  tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  39.58 
 
 
395 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2578  sugar isomerase AgaS  43.46 
 
 
388 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.962598  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2108  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase  39.22 
 
 
388 aa  292  7e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2961  putative sugar isomerase  38.96 
 
 
390 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2644  sugar isomerase domain-containing protein  38.7 
 
 
390 aa  285  9e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0115  phosphosugar isomerase  39.48 
 
 
388 aa  283  3.0000000000000004e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  4.6706899999999995e-20 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0075  sugar isomerase (SIS)  39.58 
 
 
377 aa  281  1e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3815  sugar isomerase (SIS)  38.54 
 
 
384 aa  270  4e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.994709  normal  0.536429 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3375  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase AgaS  40.46 
 
 
388 aa  268  8e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0941  putative tagatose-6-phosphate ketose/aldose isomerase AgaS  41.15 
 
 
388 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0993  AgaS family sugar isomerase  41.15 
 
 
388 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2758  sugar isomerase (SIS)  38.9 
 
 
376 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1062  sugar isomerase (SIS)  37.6 
 
 
388 aa  255  8e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.316402  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0147  sugar isomerase (SIS)  34.13 
 
 
384 aa  246  4e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1707  sugar isomerase (SIS)  39.84 
 
 
384 aa  242  9e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0665  sugar isomerase (SIS)  29.16 
 
 
400 aa  169  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0139  Glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  26.04 
 
 
354 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4761  sugar isomerase (SIS)  28.16 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5362  sugar isomerase (SIS)  27.74 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.56285 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0693  sugar isomerase (SIS)  29.34 
 
 
302 aa  60.1  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3243  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  27.1 
 
 
620 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0185472  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3290  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.66 
 
 
602 aa  53.1  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4598  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.44 
 
 
606 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.510403  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2658  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.38 
 
 
612 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.144051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3948  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  26.75 
 
 
614 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0194112  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5899  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.6 
 
 
639 aa  50.8  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4464  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.74 
 
 
612 aa  50.1  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.582003  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0832  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  23.53 
 
 
353 aa  48.9  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01415  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.51 
 
 
615 aa  48.5  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.411178  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1553  sugar isomerase (SIS)  23.26 
 
 
309 aa  48.1  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0323  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.21 
 
 
586 aa  48.5  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0113  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  21.68 
 
 
330 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3352  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  24.57 
 
 
595 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3414  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  24.57 
 
 
595 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.871131 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3363  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  24.57 
 
 
595 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0115  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  21.97 
 
 
330 aa  47.8  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0252  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.46 
 
 
580 aa  47.8  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0822  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.78 
 
 
616 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2822  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.23 
 
 
610 aa  47.4  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4036  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.14 
 
 
629 aa  47  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.529211 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1433  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.03 
 
 
611 aa  47  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000916025 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.71 
 
 
611 aa  46.2  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.214537 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0641  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.11 
 
 
636 aa  46.2  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325267  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0121  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.06 
 
 
609 aa  46.2  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000396759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0270  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.48 
 
 
609 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001643  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  24.33 
 
 
610 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0244363  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4463  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  25.14 
 
 
609 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0772  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.63 
 
 
608 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1512  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.36 
 
 
609 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0620  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.11 
 
 
636 aa  46.2  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4559  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.73 
 
 
613 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313422  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2759  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  25.5 
 
 
673 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202066  normal  0.017442 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0039  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.15 
 
 
610 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1676  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.01 
 
 
604 aa  45.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0125  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.73 
 
 
614 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03884  Glucosamine-fructose-6-phosphate aminotransferase  24.27 
 
 
610 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3838  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.63 
 
 
611 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3839  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.47 
 
 
609 aa  44.3  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000251004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4166  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.42 
 
 
608 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4064  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.91 
 
 
614 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1293  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.68 
 
 
606 aa  44.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.921081  normal  0.297971 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0992  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.57 
 
 
599 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.237004  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5170  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  26.6 
 
 
609 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000225496  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0095  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.85 
 
 
620 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607775 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1726  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.62 
 
 
608 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.487309  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0379  sugar isomerase (SIS)  30 
 
 
329 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1001  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.09 
 
 
626 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2584  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  25.6 
 
 
616 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.946253  normal  0.069617 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1074  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.69 
 
 
627 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0149883  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0675  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.35 
 
 
616 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1143  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  25.08 
 
 
601 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0719  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.24 
 
 
612 aa  43.9  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.12268  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0903  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.11 
 
 
602 aa  44.3  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.157355  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1727  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.57 
 
 
599 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.20079  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1224  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  24.14 
 
 
596 aa  44.3  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2323  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  22.68 
 
 
611 aa  44.3  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1910  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  25.7 
 
 
608 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0701162  normal  0.896342 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4040  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  27.01 
 
 
609 aa  43.5  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0462  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  22.47 
 
 
611 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.661359  normal  0.367239 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0808  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  23.69 
 
 
609 aa  43.9  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0131  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  27.14 
 
 
612 aa  43.9  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.533815  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1360  glutamine-fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  27.81 
 
 
343 aa  43.5  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1205  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  23.64 
 
 
621 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00831  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  24.23 
 
 
610 aa  43.5  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>