More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1461 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0565  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.28 
 
 
708 aa  777  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.486274  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2721  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.75 
 
 
714 aa  816  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2676  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  83.78 
 
 
710 aa  1162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2111  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  53.33 
 
 
714 aa  738  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.344014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1473  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  98.45 
 
 
709 aa  1422  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.451706  normal  0.0332103 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1408  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  98.59 
 
 
709 aa  1423  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.682572  hitchhiker  0.000547588 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1461  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  100 
 
 
709 aa  1442  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  7.22255e-05 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1664  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  62.13 
 
 
717 aa  883  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0455542  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2577  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.34 
 
 
715 aa  810  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.797066  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2630  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.34 
 
 
715 aa  810  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.27424e-09 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2617  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.2 
 
 
715 aa  808  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595901  normal  0.988974 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02700  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  60.28 
 
 
719 aa  847  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0436  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  49.57 
 
 
725 aa  640  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2528  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.34 
 
 
715 aa  810  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1530  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  82.65 
 
 
708 aa  1155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2742  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.2 
 
 
715 aa  807  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.269635  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3484  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  58.03 
 
 
714 aa  820  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.591904  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1598  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  93.23 
 
 
706 aa  1305  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  5.61354e-05 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3026  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  81.51 
 
 
713 aa  1157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.144673  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2500  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.75 
 
 
714 aa  819  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273227  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2167  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  82.09 
 
 
706 aa  1144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359385  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2459  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  92.24 
 
 
706 aa  1290  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.740158  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2881  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.56 
 
 
715 aa  816  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.452872  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2780  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  93.09 
 
 
706 aa  1302  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2425  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  81.1 
 
 
706 aa  1128  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0429778 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4162  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  49.65 
 
 
723 aa  637  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180685 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1400  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  58.26 
 
 
747 aa  819  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.770101  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03120  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.91 
 
 
704 aa  794  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2760  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  92.81 
 
 
706 aa  1295  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2492  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.75 
 
 
714 aa  842  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2637  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  58.03 
 
 
714 aa  822  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1629  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  85.15 
 
 
715 aa  1192  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.895951  normal  0.0132209 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3378  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  58.56 
 
 
721 aa  822  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2598  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  85.33 
 
 
706 aa  1191  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2855  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  92.81 
 
 
706 aa  1297  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112622 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0382  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  58.4 
 
 
775 aa  820  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1509  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  58.4 
 
 
774 aa  821  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.807341  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1312  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.61 
 
 
714 aa  815  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.474156  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0408  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  49.71 
 
 
724 aa  637  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02265  fused enoyl-CoA hydratase and epimerase and isomerase/3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  57.75 
 
 
714 aa  816  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002857  fatty oxidation complex alpha subunit FadJ  57.49 
 
 
703 aa  788  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1733  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  47.04 
 
 
744 aa  668  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.535937  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02226  hypothetical protein  57.75 
 
 
714 aa  816  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1316  fatty acid oxidation complex, alpha subunit FadJ  57.61 
 
 
714 aa  816  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1444  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.31 
 
 
727 aa  790  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3156  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  60.5 
 
 
764 aa  851  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0879697  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3456  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  48.98 
 
 
752 aa  704  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0405944 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2597  fatty acid oxidation complex, alpha subunit FadJ  53.3 
 
 
714 aa  714  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2821  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.59 
 
 
727 aa  803  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3088  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  96.75 
 
 
707 aa  1346  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1341  fatty acid oxidation complex, alpha subunit FadJ  53.66 
 
 
732 aa  714  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0437  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  49.43 
 
 
725 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35240  predicted protein  45.01 
 
 
684 aa  541  1e-152  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2453  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  41.36 
 
 
702 aa  520  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889679  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2604  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  38.39 
 
 
724 aa  480  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110209  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0465  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.76 
 
 
750 aa  443  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0021  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.3 
 
 
740 aa  439  1e-122  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4031  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.8 
 
 
738 aa  441  1e-122  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3565  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.31 
 
 
733 aa  441  1e-122  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.38918  normal  0.164107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3241  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.18 
 
 
733 aa  440  1e-122  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.736069  normal  0.0839806 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0543  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  37.86 
 
 
736 aa  437  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247405  normal  0.0940574 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2100  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.97 
 
 
719 aa  438  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.937609  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3437  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.04 
 
 
733 aa  438  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.218368  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3281  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.98 
 
 
733 aa  438  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.740895  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3879  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  39 
 
 
715 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5242  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.2 
 
 
733 aa  435  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.327614  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0793  fatty oxidation complex, alpha subunit  36.25 
 
 
738 aa  433  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0125  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.28 
 
 
732 aa  434  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.515354  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4929  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.89 
 
 
708 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.504064 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3852  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.89 
 
 
708 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1578  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  35.83 
 
 
716 aa  431  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0281049 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4604  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  35.55 
 
 
738 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0744  fatty oxidation complex, alpha subunit  36.11 
 
 
738 aa  427  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0144  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.03 
 
 
736 aa  428  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.258925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1676  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.9 
 
 
715 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.281306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0887  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.4 
 
 
738 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.703103  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1144  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.98 
 
 
715 aa  429  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00169331  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2136  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.76 
 
 
715 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.434411  normal  0.123544 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0062  fatty oxidation complex, alpha subunit  37.73 
 
 
707 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3606  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.76 
 
 
715 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.28427 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0597  enoyl-CoA hydratase  35.49 
 
 
737 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1652  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.9 
 
 
715 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0807  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.88 
 
 
738 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.35193 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0244  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.3 
 
 
737 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3517  fatty oxidation complex, alpha subunit  37.21 
 
 
721 aa  422  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.330047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3290  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.34 
 
 
721 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0906182  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2982  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.76 
 
 
687 aa  419  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0217709  normal  0.0895723 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0735  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.78 
 
 
738 aa  417  1e-115  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211682 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2145  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  38.02 
 
 
715 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1580  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.31 
 
 
715 aa  413  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120976  normal  0.369795 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7186  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase / short chain enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 
715 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713026  normal  0.0336764 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0216  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.98 
 
 
737 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.97632  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0817  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  34.78 
 
 
737 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.85082 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25080  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  38.16 
 
 
715 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2227  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.07 
 
 
719 aa  413  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.157298 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1934  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.17 
 
 
719 aa  414  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.615527 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3485  fatty oxidation complex, alpha subunit  37.15 
 
 
707 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0073  putative 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  37.29 
 
 
707 aa  412  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1822  fatty acid oxidation complex alpha subunit  37.15 
 
 
707 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.86873  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0287  fatty oxidation complex, alpha subunit  37.29 
 
 
707 aa  412  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>