More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2630 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02265  fused enoyl-CoA hydratase and epimerase and isomerase/3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  86.38 
 
 
714 aa  1244    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1341  fatty acid oxidation complex, alpha subunit FadJ  61.2 
 
 
732 aa  789    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1316  fatty acid oxidation complex, alpha subunit FadJ  86.24 
 
 
714 aa  1244    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2881  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  81.68 
 
 
715 aa  1190    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.452872  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3156  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.91 
 
 
764 aa  791    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0879697  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3088  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.3 
 
 
707 aa  794    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1598  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.08 
 
 
706 aa  795    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.0000561354 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1312  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  86.1 
 
 
714 aa  1242    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.474156  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2528  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  100 
 
 
715 aa  1458    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2630  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  100 
 
 
715 aa  1458    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227424 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002857  fatty oxidation complex alpha subunit FadJ  56.64 
 
 
703 aa  792    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3378  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  67.89 
 
 
721 aa  942    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2598  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.17 
 
 
706 aa  773    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0565  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  55.84 
 
 
708 aa  776    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.486274  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0382  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  64.83 
 
 
775 aa  915    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1733  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  47.28 
 
 
744 aa  661    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.535937  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2617  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  99.58 
 
 
715 aa  1456    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595901  normal  0.988974 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2167  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.53 
 
 
706 aa  790    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359385  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1400  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  64.83 
 
 
747 aa  914    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.770101  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1509  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  64.69 
 
 
774 aa  913    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.807341  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02700  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.52 
 
 
719 aa  811    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2760  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.94 
 
 
706 aa  789    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2492  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  86.38 
 
 
714 aa  1273    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2597  fatty acid oxidation complex, alpha subunit FadJ  57.75 
 
 
714 aa  758    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2780  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.94 
 
 
706 aa  793    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2855  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.94 
 
 
706 aa  790    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112622 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1530  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.77 
 
 
708 aa  808    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2459  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.8 
 
 
706 aa  784    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.740158  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3456  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  48.39 
 
 
752 aa  679    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0405944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2577  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  99.86 
 
 
715 aa  1457    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.797066  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2742  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  99.72 
 
 
715 aa  1454    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.269635  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2637  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  86.24 
 
 
714 aa  1244    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2425  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  58.07 
 
 
706 aa  787    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0429778 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2821  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  62.08 
 
 
727 aa  870    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3484  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  86.38 
 
 
714 aa  1246    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.591904  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1664  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  59.38 
 
 
717 aa  833    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0455542  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1629  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.12 
 
 
715 aa  782    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.895951  normal  0.0132209 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3026  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  55.29 
 
 
713 aa  762    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.144673  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1408  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.69 
 
 
709 aa  794    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.682572  hitchhiker  0.000547588 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1473  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.69 
 
 
709 aa  796    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.451706  normal  0.0332103 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2111  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  53.42 
 
 
714 aa  731    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.344014 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2676  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.46 
 
 
710 aa  801    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1444  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  61.76 
 
 
727 aa  863    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2500  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  86.24 
 
 
714 aa  1244    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273227  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03120  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  55.51 
 
 
704 aa  778    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2721  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  86.1 
 
 
714 aa  1241    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1461  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.55 
 
 
709 aa  793    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722255 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02226  hypothetical protein  86.38 
 
 
714 aa  1244    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4162  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  50.07 
 
 
723 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180685 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0436  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  48.78 
 
 
725 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0408  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  48.35 
 
 
724 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0437  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  48.64 
 
 
725 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2453  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  43.02 
 
 
702 aa  521  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889679  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2604  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  39.1 
 
 
724 aa  514  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110209  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35240  predicted protein  41.48 
 
 
684 aa  490  1e-137  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0465  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.6 
 
 
750 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1578  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.01 
 
 
716 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0281049 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1144  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.79 
 
 
715 aa  421  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00169331  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3565  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.36 
 
 
733 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.38918  normal  0.164107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3241  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.22 
 
 
733 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.736069  normal  0.0839806 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3281  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.79 
 
 
733 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.740895  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3437  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.61 
 
 
733 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.218368  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4031  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.9 
 
 
738 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0793  fatty oxidation complex, alpha subunit  34.9 
 
 
738 aa  412  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5242  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.2 
 
 
733 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.327614  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0021  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.34 
 
 
740 aa  411  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0543  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.28 
 
 
736 aa  412  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247405  normal  0.0940574 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0062  fatty oxidation complex, alpha subunit  39.72 
 
 
707 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0597  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 
737 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0744  fatty oxidation complex, alpha subunit  34.34 
 
 
738 aa  404  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2490  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.51 
 
 
716 aa  405  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305036  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4929  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  37.96 
 
 
708 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.504064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3879  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.48 
 
 
715 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3852  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  37.96 
 
 
708 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3517  fatty oxidation complex, alpha subunit  36.17 
 
 
721 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.330047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3290  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.12 
 
 
721 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0906182  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0144  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.94 
 
 
736 aa  399  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.258925 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  35.84 
 
 
723 aa  392  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.693496 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2100  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  35.57 
 
 
719 aa  393  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.937609  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0887  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.6 
 
 
738 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.703103  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2393  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.86 
 
 
727 aa  393  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1185  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.02 
 
 
723 aa  394  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0075  putative 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  39.17 
 
 
707 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0287  fatty oxidation complex, alpha subunit  39.17 
 
 
707 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14440  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.02 
 
 
715 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.308219  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0244  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.47 
 
 
737 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2977  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  34.16 
 
 
733 aa  391  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.271442  normal  0.337869 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1822  fatty acid oxidation complex alpha subunit  39.03 
 
 
707 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.86873  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0073  putative 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  39.17 
 
 
707 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2730  fatty oxidation complex, alpha subunit  39.03 
 
 
707 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3485  fatty oxidation complex, alpha subunit  39.03 
 
 
707 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2145  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.82 
 
 
715 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25080  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.68 
 
 
715 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2136  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.43 
 
 
715 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.434411  normal  0.123544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4604  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  33.29 
 
 
738 aa  389  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3606  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.43 
 
 
715 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.28427 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0807  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.47 
 
 
738 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.35193 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0835  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.52 
 
 
737 aa  386  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0016  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.32 
 
 
716 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.283529  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1652  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.43 
 
 
715 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>