162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0082 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0078  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
136 aa  285  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0082  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
136 aa  285  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.691992 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0080  thioesterase superfamily protein  99.26 
 
 
136 aa  281  2e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0080  thioesterase superfamily protein  96.32 
 
 
136 aa  277  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0077  thioesterase superfamily protein  96.32 
 
 
136 aa  278  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0082  thioesterase superfamily protein  95.59 
 
 
136 aa  275  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4272  thioesterase superfamily protein  96.3 
 
 
136 aa  276  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  94.12 
 
 
136 aa  271  2e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0077  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  92.48 
 
 
138 aa  261  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4185  thioesterase superfamily protein  70.9 
 
 
134 aa  204  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4859  thioesterase superfamily protein  68.42 
 
 
134 aa  200  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0073  thioesterase superfamily protein  64.93 
 
 
135 aa  195  2e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  64.18 
 
 
134 aa  195  2e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3570  thioesterase superfamily protein  71.32 
 
 
132 aa  194  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4458  thioesterase superfamily protein  62.69 
 
 
134 aa  192  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.913504 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3970  thioesterase superfamily protein  64.39 
 
 
155 aa  191  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1855  hypothetical protein  49.19 
 
 
133 aa  137  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.087646  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00219  thioesterase family protein  52.54 
 
 
139 aa  136  8e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0145  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 
135 aa  128  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1040  hypothetical protein  45.45 
 
 
135 aa  122  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0326  hypothetical protein  45.45 
 
 
135 aa  122  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  41.73 
 
 
147 aa  122  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1586  hypothetical protein  45.45 
 
 
135 aa  122  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.689627  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3038  thioesterase superfamily protein  42.4 
 
 
136 aa  122  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461873  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0929  thioesterase family protein  42.28 
 
 
131 aa  122  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  43.09 
 
 
137 aa  120  6e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  43.2 
 
 
129 aa  117  4e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1443  hypothetical protein  43.33 
 
 
135 aa  116  8e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 
133 aa  111  4e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1939  thioesterase superfamily protein  37.4 
 
 
145 aa  97.1  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3185  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 
140 aa  91.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
149 aa  75.5  2e-13  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  1.87556e-06  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 
131 aa  73.6  9e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 
139 aa  68.2  3e-11  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
132 aa  67.8  5e-11  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
162 aa  67  7e-11  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
148 aa  65.1  3e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  29.5 
 
 
147 aa  64.7  4e-10  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  29.5 
 
 
147 aa  64.3  6e-10  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  24.82 
 
 
149 aa  63.9  7e-10  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 
136 aa  62.8  2e-09  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0257  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
142 aa  60.5  9e-09  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 
134 aa  59.7  1e-08  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  6.86795e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
139 aa  58.9  2e-08  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
140 aa  58.2  4e-08  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 
145 aa  58.2  4e-08  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2608  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
141 aa  56.6  1e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
144 aa  54.7  4e-07  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 
140 aa  54.3  6e-07  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
132 aa  53.9  7e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  28.36 
 
 
130 aa  53.1  1e-06  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  29.92 
 
 
147 aa  53.1  1e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
145 aa  52.4  2e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 
147 aa  51.6  3e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  25.78 
 
 
133 aa  51.6  3e-06  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
136 aa  51.6  3e-06  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  25.95 
 
 
130 aa  52  3e-06  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 
147 aa  51.6  4e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  26.27 
 
 
130 aa  51.6  4e-06  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 
136 aa  51.6  4e-06  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
133 aa  51.6  4e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  24.06 
 
 
133 aa  50.8  6e-06  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  23.81 
 
 
151 aa  50.8  6e-06  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
163 aa  50.8  6e-06  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3476  thioesterase superfamily protein  25.98 
 
 
141 aa  50.8  7e-06  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  28.46 
 
 
145 aa  50.4  8e-06  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.12 
 
 
148 aa  49.7  1e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3257  esterase  24.41 
 
 
142 aa  49.3  2e-05  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.599162  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  26.67 
 
 
134 aa  48.9  2e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1413  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
145 aa  48.9  2e-05  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364047  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4623  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.34 
 
 
148 aa  49.3  2e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.69926  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.34 
 
 
148 aa  48.5  3e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.34 
 
 
148 aa  48.5  3e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 
137 aa  48.9  3e-05  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0960  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.19 
 
 
126 aa  48.5  3e-05  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.34 
 
 
148 aa  48.5  3e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  27.34 
 
 
148 aa  48.5  3e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.34 
 
 
148 aa  48.5  3e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.34 
 
 
148 aa  48.5  3e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1807  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 
138 aa  48.1  4e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3023  thioesterase superfamily protein  28.36 
 
 
140 aa  48.1  4e-05  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  25.98 
 
 
283 aa  47.8  6e-05  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02013  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  29.41 
 
 
136 aa  47.4  7e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1972  thioesterase superfamily protein  24.44 
 
 
162 aa  47  8e-05  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3335  esterase  25 
 
 
118 aa  47  9e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  26.19 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1696  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.66 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154661  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.82 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  30.15 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0934  thioesterase superfamily protein  27.15 
 
 
181 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  27.61 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0557  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family protein  24.22 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  25 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  27.61 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1681  putative Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  23.31 
 
 
163 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  0.0917493 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  25.98 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>