204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3337 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3337  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  580  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.491654 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3644  hypothetical protein  72.95 
 
 		 293 aa  428  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0682  hypothetical protein  76.55 
 
 		 299 aa  418  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.095942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003645  permease  70 
 
 		 295 aa  384  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.436376  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02200  hypothetical protein  69.66 
 
 		 294 aa  383  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3565  DMT family permease  58.16 
 
 		 291 aa  299  3e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2433  hypothetical protein  58.22 
 
 		 294 aa  289  4e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21912  normal  0.079185 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  33.9 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3499  hypothetical protein  34.19 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4245  hypothetical protein  33.58 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000122262  hitchhiker  0.00219233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4124  hypothetical protein  33.58 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0213  hypothetical protein  33.58 
 
 		 285 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223398  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0215  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.21 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000175088  normal  0.378069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  31.23 
 
 		 303 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3735  hypothetical protein  32.84 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486754 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3806  hypothetical protein  32.84 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.305382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.3 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4527  integral membrane domain-containing protein  32.47 
 
 		 284 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  30.74 
 
 		 293 aa  99.4  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3933  hypothetical protein  32.35 
 
 		 284 aa  99.4  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000367698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  30.94 
 
 		 335 aa  99  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  30.85 
 
 		 299 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  29.97 
 
 		 324 aa  97.4  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  32.98 
 
 		 318 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25270  predicted permease, DMT superfamily  32.44 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  30.94 
 
 		 290 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.81 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.8 
 
 		 317 aa  87  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  27.8 
 
 		 294 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  27.8 
 
 		 294 aa  85.9  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.68 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.26 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  29.43 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2764  hypothetical protein  32.22 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.876324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  28.83 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0070  carboxylate/amino acid/amine transporter  30.63 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0151  putative transmembrane protein  35.21 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0551496  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0619  hypothetical protein  27.85 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2455  hypothetical protein  27.2 
 
 		 272 aa  75.5  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1451  hypothetical protein  29.5 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.680814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  26.48 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  26.48 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  26.48 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  28.28 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0088  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.08 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.529373  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.91 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3677  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.35 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  27.91 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  27.91 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  27.61 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01886  hypothetical protein  27.97 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2376  hypothetical protein  27.87 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0391  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.18 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598398  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  27.87 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  25.68 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  25.68 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.6 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.18 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  33.33 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  25.94 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  31.41 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.02 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4599  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4465  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164822  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3425  hypothetical protein  27.84 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2612  hypothetical protein  24.71 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2483  hypothetical protein  24.71 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0867101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  24.14 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  28.68 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  26.6 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  27.46 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2455  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.43 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.18 
 
 		 367 aa  55.8  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.78 
 
 		 349 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  23.84 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  26.39 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  25.7 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.42 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  26.39 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  26.39 
 
 		 292 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  25.45 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  23.47 
 
 		 296 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.44 
 
 		 317 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.87 
 
 		 321 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  25.44 
 
 		 294 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  25.44 
 
 		 294 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  27.69 
 
 		 301 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  24.06 
 
 		 306 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.69 
 
 		 301 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  26.94 
 
 		 301 aa  52.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  27.69 
 
 		 301 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  27.69 
 
 		 301 aa  52.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  27.69 
 
 		 301 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3459  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 		 295 aa  52.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  27.69 
 
 		 301 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  25.45 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>