More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1081 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3084  threonine synthase  77.28 
 
 		 427 aa  677    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.823168  hitchhiker  0.00247535 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3413  threonine synthase  78.69 
 
 		 427 aa  694    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1272  threonine synthase  78.4 
 
 		 426 aa  690    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1068  threonine synthase  78.45 
 
 		 428 aa  691    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2733  threonine synthase  77 
 
 		 427 aa  678    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1306  threonine synthase  76.53 
 
 		 427 aa  673    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2738  threonine synthase  71.66 
 
 		 426 aa  635    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00144538  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1177  threonine synthase  80.52 
 
 		 426 aa  710    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.300194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1229  threonine synthase  77 
 
 		 427 aa  675    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1140  threonine synthase  78.69 
 
 		 427 aa  690    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1211  threonine synthase  78.69 
 
 		 427 aa  691    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2904  threonine synthase  76.06 
 
 		 427 aa  660    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.869101  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1273  threonine synthase  77 
 
 		 427 aa  675    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270121  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1081  threonine synthase  100 
 
 		 427 aa  875    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.301795 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1141  threonine synthase  77.99 
 
 		 427 aa  689    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.212689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0907  threonine synthase  76.76 
 
 		 428 aa  661    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3578  threonine synthase  62.3 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1212  threonine synthase  60.38 
 
 		 425 aa  538  9.999999999999999e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.13484  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0685  threonine synthase  61.08 
 
 		 429 aa  519  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0750067  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004455  threonine synthase  59.19 
 
 		 426 aa  515  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.892545  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03326  threonine synthase  59.39 
 
 		 427 aa  513  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00941  threonine synthase  58.95 
 
 		 426 aa  513  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1941  threonine synthase  58.29 
 
 		 426 aa  508  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0392149  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1277  threonine synthase  58.53 
 
 		 425 aa  511  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.507773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2554  threonine synthase  58.1 
 
 		 427 aa  505  9.999999999999999e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0806  threonine synthase  59.2 
 
 		 426 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3602  threonine synthase  59.2 
 
 		 429 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3474  threonine synthase  58.96 
 
 		 429 aa  502  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00004  threonine synthase  60.33 
 
 		 428 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.863935  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3592  threonine synthase  60.33 
 
 		 428 aa  497  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0004  threonine synthase  60.33 
 
 		 428 aa  497  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.412725  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0005  threonine synthase  60.33 
 
 		 428 aa  496  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.674616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0003  threonine synthase  60.33 
 
 		 428 aa  496  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3651  threonine synthase  60.33 
 
 		 428 aa  496  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0004  threonine synthase  59.62 
 
 		 428 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0003  threonine synthase  60.33 
 
 		 428 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0566  threonine synthase  58.67 
 
 		 428 aa  496  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00004  hypothetical protein  60.33 
 
 		 428 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.902262  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0004  threonine synthase  59.38 
 
 		 428 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0004  threonine synthase  59.38 
 
 		 428 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.70048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0574  threonine synthase  58.02 
 
 		 429 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3861  threonine synthase  58.49 
 
 		 429 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0005  threonine synthase  60.1 
 
 		 428 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.817747  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0004  threonine synthase  59.38 
 
 		 428 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.153937  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0004  threonine synthase  59.38 
 
 		 428 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3666  threonine synthase  58.73 
 
 		 429 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4289  threonine synthase  56.81 
 
 		 434 aa  490  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0535  threonine synthase  57.04 
 
 		 429 aa  489  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0075  threonine synthase  44.19 
 
 		 434 aa  347  3e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2573  threonine synthase  44.14 
 
 		 429 aa  345  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.965745  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3802  threonine synthase  42.3 
 
 		 439 aa  335  7e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0260  threonine synthase  41.71 
 
 		 438 aa  335  9e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07410  threonine synthase  41.24 
 
 		 453 aa  333  4e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3806  threonine synthase  41.88 
 
 		 435 aa  332  6e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0398302  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2707  threonine synthase  40.42 
 
 		 438 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.207551  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5431  threonine synthase  40.92 
 
 		 435 aa  323  5e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418256  normal  0.890668 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0295  threonine synthase  40.42 
 
 		 439 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.212464 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2334  threonine synthase  41.12 
 
 		 437 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2546  threonine synthase  41.57 
 
 		 438 aa  318  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.229703  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0138  threonine synthase  40.32 
 
 		 439 aa  317  2e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135778  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1987  threonine synthase  41.3 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5522  threonine synthase  40.5 
 
 		 435 aa  305  9.000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000125532  normal  0.439141 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1263  threonine synthase  41.13 
 
 		 436 aa  298  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2402  threonine synthase  42.86 
 
 		 432 aa  291  2e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1587  threonine synthase  38.01 
 
 		 448 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.34277  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1360  threonine synthase  41.75 
 
 		 428 aa  279  8e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489161  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0457  L-threonine synthase  36.36 
 
 		 447 aa  276  7e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1751  threonine synthase  36.66 
 
 		 428 aa  256  6e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.182156 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  33.55 
 
 		 463 aa  256  7e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1356  threonine synthase  37.05 
 
 		 433 aa  250  4e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  35.36 
 
 		 473 aa  250  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  34.37 
 
 		 470 aa  249  7e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  34.43 
 
 		 470 aa  247  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  34.15 
 
 		 470 aa  246  8e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  33.55 
 
 		 461 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1423  threonine synthase  35.99 
 
 		 433 aa  245  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  33.7 
 
 		 461 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  34.8 
 
 		 463 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  35.54 
 
 		 470 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  34.8 
 
 		 463 aa  243  5e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  34.88 
 
 		 470 aa  242  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  35.19 
 
 		 471 aa  240  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  34.07 
 
 		 471 aa  240  4e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  32.46 
 
 		 465 aa  239  6.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00822  threonine synthase  38.26 
 
 		 434 aa  239  6.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00943473  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  32.9 
 
 		 461 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  34.71 
 
 		 471 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  32.68 
 
 		 461 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0459  threonine synthase  35.1 
 
 		 459 aa  238  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  32.25 
 
 		 469 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  32.47 
 
 		 469 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  32.97 
 
 		 465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  32.26 
 
 		 463 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1613  threonine synthase  34.79 
 
 		 424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0308  threonine synthase  33.33 
 
 		 465 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00604196 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  32.24 
 
 		 462 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  32.25 
 
 		 467 aa  233  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  32.73 
 
 		 468 aa  233  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  33.19 
 
 		 465 aa  233  7.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1383  threonine synthase  34.46 
 
 		 422 aa  232  8.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>