229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0776 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 		 178 aa  362  1e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  66.85 
 
 		 181 aa  261  4.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  63.84 
 
 		 177 aa  244  4e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  63.84 
 
 		 178 aa  241  5e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  64.41 
 
 		 177 aa  239  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50 
 
 		 181 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.72 
 
 		 176 aa  187  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  45.45 
 
 		 183 aa  154  9e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  45.45 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.14 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  44.57 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  43.43 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  42.86 
 
 		 173 aa  134  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  40.12 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  40.12 
 
 		 390 aa  126  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  39.1 
 
 		 181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  38.95 
 
 		 180 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  39.53 
 
 		 177 aa  124  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  39.1 
 
 		 181 aa  123  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.98 
 
 		 178 aa  122  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06432  dihydrofolate reductase  77.33 
 
 		 75 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  37.79 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1910  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  38.37 
 
 		 199 aa  117  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.77 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  36.52 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  35.84 
 
 		 183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.43 
 
 		 182 aa  107  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2481  bifunctional deaminase-reductase-like  35.03 
 
 		 175 aa  106  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.295315 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  37.65 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  37.65 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5750  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.43 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5086  bifunctional deaminase-reductase-like  37.5 
 
 		 177 aa  97.8  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  40.88 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.52 
 
 		 174 aa  94.7  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.58 
 
 		 184 aa  94.7  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.18 
 
 		 177 aa  94.4  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.14 
 
 		 175 aa  92  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.46 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.07 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  34.48 
 
 		 180 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  31.46 
 
 		 175 aa  88.6  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  32.18 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  35.86 
 
 		 180 aa  87  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  34.93 
 
 		 174 aa  87  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  34.93 
 
 		 173 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3614  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.12 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  34.25 
 
 		 173 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  34.93 
 
 		 173 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  34.51 
 
 		 182 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03197  dihydrofolate reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G06820)  33.16 
 
 		 210 aa  85.1  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.245608 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  34.93 
 
 		 173 aa  85.5  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  34.93 
 
 		 173 aa  85.5  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  33.78 
 
 		 174 aa  85.5  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  34.93 
 
 		 173 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  34.93 
 
 		 173 aa  84.7  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  34.15 
 
 		 172 aa  84.3  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  34.25 
 
 		 173 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  35.03 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.33 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.35 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.4 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.92 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.67 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  30.67 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.67 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  31.33 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  30.14 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.37 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  29.94 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  29.34 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4077  dihydrofolate reductase  29.22 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  27.17 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.67 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.98 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  31.01 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.66 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  28.38 
 
 		 221 aa  64.3  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  25.67 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.07 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.03 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  25.71 
 
 		 193 aa  60.8  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.44 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.18 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  26.52 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  29.79 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  25.53 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.74 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.32 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  30.95 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.89 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  31.01 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14470  dihydrofolate reductase  27.27 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.53 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.535635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7185  RibD domain protein  28.8 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.68 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1936  dihydrofolate reductase family protein  25.62 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422248  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3848  dihydrofolate reductase family protein  28.65 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347395  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  28.65 
 
 		 175 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>