52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2535 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2535  tetraheme cytochrome c, putative  100 
 
 		 122 aa  254  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.091656  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0300  tetraheme cytochrome c, putative  87.16 
 
 		 123 aa  204  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42786  normal  0.0669072 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1413  tetraheme cytochrome c, putative  85.32 
 
 		 123 aa  201  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0324  tetraheme cytochrome c, putative  80.33 
 
 		 122 aa  197  6e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0275  tetraheme cytochrome c, putative  77.87 
 
 		 122 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173309 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4185  tetraheme cytochrome c, putative  77.67 
 
 		 122 aa  177  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.17754 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2402  tetraheme cytochrome c, putative  37.5 
 
 		 122 aa  87.4  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3623  tetraheme cytochrome c  33.04 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4179  tetraheme cytochrome c  32.76 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0276  tetraheme cytochrome c  32.14 
 
 		 117 aa  67  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3938  tetraheme cytochrome c  32.11 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0339  cytochrome c  32.1 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2229  tetraheme cytochrome c  31.09 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2152  tetraheme cytochrome c  31.67 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738839  normal  0.0741814 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3535  tetraheme cytochrome c  33.9 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0274  tetraheme cytochrome c  29.91 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3896  tetraheme cytochrome c  34.74 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486536  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  30.33 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3300  cytochrome c  34.57 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  33.61 
 
 		 593 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0255  tetraheme cytochrome c  35.63 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0257  tetraheme cytochrome c  34.74 
 
 		 117 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  28.36 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2430  tetraheme cytochrome c  31.3 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.439789  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  29.63 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  37.35 
 
 		 597 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  37.35 
 
 		 596 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  37.35 
 
 		 596 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  37.35 
 
 		 596 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1830  flavocytochrome c heme subunit  27.07 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  36.14 
 
 		 596 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  36.14 
 
 		 596 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  36.14 
 
 		 596 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  36.14 
 
 		 596 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  36.14 
 
 		 596 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  29.87 
 
 		 596 aa  47.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  26.5 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3370  tetraheme cytochrome c  26.4 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1445  flavocytochrome c heme subunit  35.06 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1158  hypothetical protein  26.5 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  35.8 
 
 		 589 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0342  tetraheme cytochrome c  31.76 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2786  hypothetical protein  27.5 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  30.26 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2085  flavocytochrome c heme subunit  28.74 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.952774  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  30.12 
 
 		 588 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  32.1 
 
 		 596 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1004  hypothetical protein  34.62 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2279  tetraheme cytochrome c  32.56 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0855381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0942  hypothetical protein  34.62 
 
 		 172 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1577  cytochrome c family protein  33.7 
 
 		 372 aa  40  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3769  hypothetical protein  28.75 
 
 		 155 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>