More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_03250 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_03250  transposase  100 
 
 
286 aa  604  1e-172  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00459877  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15050  transposase  80.57 
 
 
285 aa  497  1e-140  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.316809  normal  0.91579 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01660  transposase  79.51 
 
 
285 aa  491  1e-138  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2913  Integrase catalytic region  75.62 
 
 
284 aa  465  1e-130  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1125  Integrase catalytic region  75.62 
 
 
284 aa  465  1e-130  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0947963  hitchhiker  1.35034e-06 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14520  transposase  72.28 
 
 
283 aa  444  1e-124  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05860  transposase  72.28 
 
 
283 aa  443  1e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.517371  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04830  transposase  70.53 
 
 
283 aa  432  1e-120  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0367242  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0405  Integrase catalytic region  69.02 
 
 
272 aa  389  1e-107  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0876667  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1436  isrso11-transposase orfb protein  39.86 
 
 
278 aa  199  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3089  isrso11-transposase orfb protein  39.86 
 
 
278 aa  199  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2408  isrso11-transposase orfb protein  39.49 
 
 
278 aa  196  5e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03360  hypothetical protein  38.91 
 
 
283 aa  195  6e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00609  hypothetical protein  38.91 
 
 
283 aa  195  6e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02652  hypothetical protein  38.91 
 
 
283 aa  195  6e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3760  IS150, transposase orfB  38.91 
 
 
283 aa  195  6e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03577  hypothetical protein  38.91 
 
 
283 aa  195  6e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00620  IS150 putative transposase  38.91 
 
 
283 aa  195  6e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03409  IS150 putative transposase  38.91 
 
 
283 aa  195  6e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0153  Integrase catalytic region  38.91 
 
 
283 aa  195  6e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04284  IS150 putative transposase  38.91 
 
 
283 aa  195  6e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04283  IS150 putative transposase  38.91 
 
 
283 aa  195  6e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2265  isrso11-transposase orfb protein  39.34 
 
 
269 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02377  hypothetical protein  38.55 
 
 
279 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02160  hypothetical protein  38.55 
 
 
279 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.604012  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02200  YadA protein  38.55 
 
 
279 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04289  transposase  38.55 
 
 
279 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3880  IS150 transposase orfB  38.91 
 
 
283 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  38.6 
 
 
267 aa  192  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0056  IS3 family transposase OrfB  38.6 
 
 
267 aa  192  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1074  IS150 transposase orfB  38.55 
 
 
283 aa  192  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.274968 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1432  integrase catalytic subunit  38.29 
 
 
270 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0298  integrase catalytic subunit  38.29 
 
 
270 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1197  IS3-family transposase, OrfB  40.65 
 
 
249 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0109  IS3-family transposase, OrfB  40.65 
 
 
249 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0514465  hitchhiker  2.45789e-06 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1068  IS861, transposase OrfB  37.91 
 
 
277 aa  185  6e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1527  IS861, transposase OrfB  37.91 
 
 
277 aa  185  7e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4860  integrase catalytic subunit  38.81 
 
 
268 aa  185  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.434054  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1975  integrase catalytic subunit  38.81 
 
 
268 aa  185  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.259629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2654  integrase catalytic subunit  38.43 
 
 
268 aa  184  2e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596052  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3317  integrase catalytic subunit  38.43 
 
 
268 aa  184  2e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.817536  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0026  transposase  39.19 
 
 
269 aa  182  5e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0307  transposase orfB, IS150-related  36.76 
 
 
269 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1359  transposase  37.63 
 
 
278 aa  180  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00136296  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3662  integrase core domain protein  36.9 
 
 
265 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3620  transposase  37.5 
 
 
265 aa  179  5e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0498053  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0124  ISPsy8, transposase OrfB  39.38 
 
 
259 aa  179  5e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0516  ISPsy8, transposase OrfB  39.38 
 
 
259 aa  179  5e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.390784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0450  ISPsy8, transposase OrfB  39.38 
 
 
259 aa  179  5e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5509  ISPsy8, transposase OrfB  39.38 
 
 
259 aa  179  5e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359281  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5066  ISPsy8, transposase OrfB  39.38 
 
 
259 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1176  integrase catalytic subunit  38.27 
 
 
278 aa  178  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.155999  normal  0.139612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4616  integrase catalytic subunit  38.27 
 
 
278 aa  178  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.698457  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4680  integrase catalytic subunit  38.27 
 
 
278 aa  178  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0592  integrase catalytic subunit  38.27 
 
 
278 aa  178  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398355  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0273  integrase catalytic subunit  38.27 
 
 
278 aa  178  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5018  ISPsy9, transposase OrfB  38.27 
 
 
278 aa  178  8e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4383  integrase core domain protein  37.5 
 
 
270 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1018  integrase core domain protein  37.5 
 
 
270 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1280  integrase core domain protein  37.5 
 
 
270 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.613069  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  35.77 
 
 
278 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  35.77 
 
 
278 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0194  transposase  39.68 
 
 
253 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501333  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1714  transposase  34.78 
 
 
278 aa  172  7e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2945  Integrase catalytic region  37.5 
 
 
277 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0817746  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0974  Integrase catalytic region  37.5 
 
 
277 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382547  normal  0.109209 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1055  integrase catalytic subunit  37.86 
 
 
252 aa  171  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1362  integrase catalytic subunit  37.86 
 
 
252 aa  171  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0397787 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1478  integrase catalytic subunit  37.86 
 
 
252 aa  171  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.168577  normal  0.117043 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1091  integrase catalytic subunit  37.86 
 
 
252 aa  171  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3208  Integrase catalytic region  37.5 
 
 
277 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.928461 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5561  integrase catalytic region  34.4 
 
 
278 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.319693 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1339  integrase catalytic region  34.4 
 
 
278 aa  169  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327623 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3939  integrase catalytic region  34.4 
 
 
278 aa  169  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997818  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0288  integrase catalytic region  34.4 
 
 
278 aa  169  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.010827  normal  0.364185 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1564  integrase catalytic subunit  36.73 
 
 
278 aa  168  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4363  transposase  40.74 
 
 
215 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267789  hitchhiker  2.99756e-22 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6205  integrase catalytic subunit  34.62 
 
 
260 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346125  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2714  integrase catalytic subunit  34.62 
 
 
278 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1446  integrase catalytic subunit  34.62 
 
 
278 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2564  integrase catalytic subunit  34.62 
 
 
278 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0814  integrase catalytic subunit  34.62 
 
 
278 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2437  integrase catalytic subunit  35.71 
 
 
261 aa  159  6e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2412  integrase catalytic subunit  35.71 
 
 
261 aa  159  6e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.714231 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2077  integrase catalytic subunit  35.71 
 
 
261 aa  159  6e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.74373  normal  0.201044 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0848  integrase catalytic subunit  35.71 
 
 
261 aa  159  6e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283499  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1577  integrase catalytic subunit  35.71 
 
 
261 aa  159  6e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.279406  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0717  integrase catalytic subunit  35.71 
 
 
261 aa  159  6e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.558663  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3346  integrase catalytic region  36.1 
 
 
248 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0096806 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4456  integrase catalytic region  36.1 
 
 
248 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2397  integrase catalytic region  36.1 
 
 
248 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.861552 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1740  integrase catalytic region  36.1 
 
 
248 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  hitchhiker  0.000236948 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1458  integrase catalytic region  36.1 
 
 
248 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31397  normal  0.395934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2938  integrase catalytic region  36.1 
 
 
248 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3912  integrase catalytic region  36.1 
 
 
248 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553017  normal  0.660901 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2727  integrase catalytic region  35.68 
 
 
248 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74831  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1417  IS861, transposase (orf2), IS3 family, truncated  39.53 
 
 
212 aa  153  4e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0006  IS3 family transposase  33.83 
 
 
261 aa  153  4e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149374 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1459  IS3 family transposase  33.83 
 
 
261 aa  152  6e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  9.14872e-05  normal  0.0630219 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0196  integrase core subunit  33.98 
 
 
261 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0350068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>