More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1488 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  100 
 
 
305 aa  641    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  73.36 
 
 
301 aa  479  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  68.42 
 
 
301 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  68.42 
 
 
301 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  69.1 
 
 
301 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  68.44 
 
 
301 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  68.09 
 
 
302 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  68.44 
 
 
301 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  68.09 
 
 
301 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  68.11 
 
 
301 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  67.11 
 
 
301 aa  441  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  65.13 
 
 
301 aa  432  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  64.47 
 
 
305 aa  424  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1991  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  65.7 
 
 
309 aa  412  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2506  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  64.14 
 
 
300 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.55 
 
 
290 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.83 
 
 
338 aa  301  8.000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.7 
 
 
334 aa  296  4e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.7 
 
 
333 aa  294  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.31 
 
 
284 aa  292  5e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50 
 
 
287 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.31 
 
 
334 aa  287  1e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0746  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.41 
 
 
286 aa  273  4.0000000000000004e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000037264  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  45.3 
 
 
351 aa  267  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0012  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.6 
 
 
306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2825  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.7 
 
 
289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.32 
 
 
284 aa  243  3.9999999999999997e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1456  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.32 
 
 
284 aa  242  7e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0102824  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2977  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  42.35 
 
 
289 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
208 aa  204  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  51.7 
 
 
181 aa  200  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  52.3 
 
 
184 aa  199  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  47.45 
 
 
228 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  49.43 
 
 
197 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  48.26 
 
 
266 aa  196  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  53.49 
 
 
178 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
183 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7117  peptide methionine sulfoxide reductase  51.74 
 
 
204 aa  193  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  49.14 
 
 
180 aa  192  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  49.18 
 
 
186 aa  192  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  49.12 
 
 
190 aa  192  6e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  51.81 
 
 
178 aa  192  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
182 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  45.74 
 
 
209 aa  189  5e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  48.02 
 
 
182 aa  188  9e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  46.82 
 
 
179 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
184 aa  188  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  49.42 
 
 
186 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0897  methionine-S-sulfoxide reductase  44.74 
 
 
287 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0900  methionine-S-sulfoxide reductase  44.97 
 
 
299 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0413553  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  35.45 
 
 
311 aa  186  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0655  peptide methionine sulfoxide reductase  44.97 
 
 
287 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461756  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  49.7 
 
 
176 aa  186  4e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  48.62 
 
 
184 aa  186  4e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  48.84 
 
 
178 aa  186  5e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  46.86 
 
 
186 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  46.86 
 
 
186 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  48.6 
 
 
182 aa  185  9e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  47.43 
 
 
186 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  43.78 
 
 
186 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  47.43 
 
 
186 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  47.13 
 
 
176 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  51.46 
 
 
180 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5903  protein-methionine-S-oxide reductase  46.29 
 
 
199 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  47.31 
 
 
185 aa  183  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1058  peptide methionine sulfoxide reductase  45.11 
 
 
293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  46.11 
 
 
186 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  48.55 
 
 
182 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  44.25 
 
 
180 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  49.42 
 
 
178 aa  182  7e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  50.9 
 
 
182 aa  182  7e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0356  peptide methionine sulfoxide reductase  46.11 
 
 
185 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0154323  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2491  peptide methionine sulfoxide reductase  46.11 
 
 
185 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137451  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0103  peptide methionine sulfoxide reductase  46.11 
 
 
185 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127961  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2595  peptide methionine sulfoxide reductase  46.29 
 
 
186 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3045  peptide methionine sulfoxide reductase  46.86 
 
 
186 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735862  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0764  methionine sulfoxide reductase A  46.74 
 
 
191 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0847  methionine sulfoxide reductase A  50.57 
 
 
177 aa  180  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242718  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0714  peptide methionine sulfoxide reductase  43.39 
 
 
277 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168728  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  45.2 
 
 
181 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  45.2 
 
 
181 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  49.11 
 
 
175 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  45.35 
 
 
201 aa  179  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0784  methionine sulfoxide reductase A  47.87 
 
 
195 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650631  normal  0.421282 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  47.7 
 
 
181 aa  178  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  44.25 
 
 
179 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  48.33 
 
 
186 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3095  peptide methionine sulfoxide reductase  49.71 
 
 
178 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  48.02 
 
 
183 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  34.47 
 
 
322 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  43.35 
 
 
211 aa  177  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1032  peptide methionine sulfoxide reductase  48.55 
 
 
189 aa  176  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0074  peptide methionine sulfoxide reductase  50.29 
 
 
177 aa  176  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  45.86 
 
 
182 aa  176  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  46.24 
 
 
182 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  47.09 
 
 
180 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  47.98 
 
 
228 aa  176  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  46.02 
 
 
179 aa  176  6e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  47.65 
 
 
177 aa  176  6e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2923  peptide methionine sulfoxide reductase  45.05 
 
 
191 aa  175  7e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>