More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2972 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  88.26 
 
 		 426 aa  782    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  88.5 
 
 		 426 aa  787    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  88.24 
 
 		 426 aa  785    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  88.03 
 
 		 426 aa  782    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 427 aa  875    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  88.26 
 
 		 426 aa  782    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  87.56 
 
 		 426 aa  780    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2905  4-aminobutyrate aminotransferase  98.83 
 
 		 427 aa  867    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  88.03 
 
 		 426 aa  783    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2989  4-aminobutyrate aminotransferase  99.06 
 
 		 427 aa  867    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0883038 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  73.93 
 
 		 440 aa  665    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  72.51 
 
 		 426 aa  656    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  72.75 
 
 		 426 aa  657    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  99.53 
 
 		 427 aa  870    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  88.03 
 
 		 426 aa  783    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  73.7 
 
 		 425 aa  631  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  72.51 
 
 		 425 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  72.27 
 
 		 425 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  72.27 
 
 		 425 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0090  4-aminobutyrate aminotransferase  74.17 
 
 		 426 aa  616  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0301  4-aminobutyrate aminotransferase  74.41 
 
 		 426 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  72.27 
 
 		 425 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46670  4-aminobutyrate transaminase  71.56 
 
 		 426 aa  602  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2636  4-aminobutyrate aminotransferase  69.05 
 
 		 425 aa  593  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1100  4-aminobutyrate aminotransferase  70.31 
 
 		 425 aa  590  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.840531  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1205  4-aminobutyrate aminotransferase  69.83 
 
 		 425 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.60622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0910  4-aminobutyrate aminotransferase  69.19 
 
 		 425 aa  587  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000169324  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1172  4-aminobutyrate aminotransferase  69.6 
 
 		 425 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.408586  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1114  4-aminobutyrate aminotransferase  69.83 
 
 		 425 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3186  4-aminobutyrate aminotransferase  69.83 
 
 		 425 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.365354  normal  0.0629171 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0952  4-aminobutyrate aminotransferase  68.72 
 
 		 425 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3003  4-aminobutyrate aminotransferase  67.86 
 
 		 424 aa  580  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48796  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  70.07 
 
 		 425 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.51273  normal  0.448199 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2994  4-aminobutyrate aminotransferase  70.07 
 
 		 425 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.235499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3091  4-aminobutyrate aminotransferase  69.6 
 
 		 425 aa  570  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0318031  normal  0.465218 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1276  4-aminobutyrate aminotransferase  69.6 
 
 		 425 aa  567  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  63.74 
 
 		 430 aa  553  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  63.66 
 
 		 430 aa  548  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  61.48 
 
 		 432 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  63.25 
 
 		 430 aa  536  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2002  4-aminobutyrate aminotransferase  59.2 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607298 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0429  4-aminobutyrate aminotransferase  59.51 
 
 		 433 aa  483  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.286831  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1978  4-aminobutyrate aminotransferase  55.63 
 
 		 425 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  55.02 
 
 		 420 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  55.9 
 
 		 421 aa  469  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  54.25 
 
 		 429 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  54.25 
 
 		 446 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  53.77 
 
 		 429 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  54.01 
 
 		 429 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  54.05 
 
 		 427 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  51.66 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  54.01 
 
 		 429 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  53.81 
 
 		 427 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2233  4-aminobutyrate aminotransferase  54.31 
 
 		 421 aa  455  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4744  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  49.88 
 
 		 430 aa  451  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7694  4-aminobutyrate aminotransferase  55.98 
 
 		 426 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.788415  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  54.89 
 
 		 426 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  54.65 
 
 		 426 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  54.63 
 
 		 422 aa  451  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4026  4-aminobutyrate aminotransferase  55.06 
 
 		 426 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4356  4-aminobutyrate aminotransferase  54.82 
 
 		 426 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363071 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  52.62 
 
 		 427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1784  4-aminobutyrate aminotransferase  55.42 
 
 		 421 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2545  4-aminobutyrate aminotransferase  52.86 
 
 		 421 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4677  4-aminobutyrate aminotransferase  54.63 
 
 		 422 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300302  normal  0.0763833 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  52.47 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4414  4-aminobutyrate aminotransferase  55.69 
 
 		 426 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  51.68 
 
 		 428 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  52.61 
 
 		 427 aa  443  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4306  4-aminobutyrate aminotransferase  54.07 
 
 		 421 aa  442  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01279  GABA aminotransferase, PLP-dependent  53.44 
 
 		 421 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2344  4-aminobutyrate aminotransferase  53.44 
 
 		 421 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00720647  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0029  4-aminobutyrate aminotransferase protein  54.18 
 
 		 426 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2323  4-aminobutyrate transaminase  53.44 
 
 		 421 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01290  hypothetical protein  53.44 
 
 		 421 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0809  4-aminobutyrate aminotransferase  51.08 
 
 		 419 aa  440  9.999999999999999e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.615332  normal  0.0671712 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1867  4-aminobutyrate aminotransferase  53.22 
 
 		 421 aa  438  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1910  4-aminobutyrate aminotransferase  51.17 
 
 		 426 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.692445  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3070  4-aminobutyrate aminotransferase  54.65 
 
 		 433 aa  441  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0819  4-aminobutyrate aminotransferase  50.84 
 
 		 446 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.798552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3262  4-aminobutyrate aminotransferase  55.19 
 
 		 425 aa  438  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.129895 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1512  4-aminobutyrate transaminase  53.44 
 
 		 421 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4519  4-aminobutyrate aminotransferase  52.26 
 
 		 427 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3137  4-aminobutyrate aminotransferase  54.5 
 
 		 424 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.213623 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1417  4-aminobutyrate transaminase  53.21 
 
 		 421 aa  436  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1820  4-aminobutyrate transaminase  53.21 
 
 		 421 aa  435  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144249 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6300  4-aminobutyrate aminotransferase  53.08 
 
 		 426 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  50.6 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2567  4-aminobutyrate aminotransferase  54.03 
 
 		 424 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78639  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1538  4-aminobutyrate transaminase  53.21 
 
 		 421 aa  433  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.535334  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1944  4-aminobutyrate transaminase  53.98 
 
 		 421 aa  431  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.991898 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2259  4-aminobutyrate aminotransferase  53.11 
 
 		 426 aa  431  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.418729  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3494  4-aminobutyrate aminotransferase  54.98 
 
 		 424 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.782932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2371  4-aminobutyrate aminotransferase  52.72 
 
 		 440 aa  429  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0827884  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4167  4-aminobutyrate aminotransferase  51.42 
 
 		 434 aa  429  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.207789 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0848  4-aminobutyrate aminotransferase  52.94 
 
 		 425 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  51.54 
 
 		 426 aa  426  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  52.25 
 
 		 427 aa  428  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
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NC_003910  CPS_4664  4-aminobutyrate aminotransferase  52.13 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3106  4-aminobutyrate aminotransferase  49.41 
 
 		 429 aa  421  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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