265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3642 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3642  flagellar hook-associated protein  100 
 
 		 457 aa  914    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  70.02 
 
 		 457 aa  629  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  69.8 
 
 		 457 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  62.58 
 
 		 457 aa  558  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  57.99 
 
 		 457 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  38.04 
 
 		 457 aa  311  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  38.48 
 
 		 457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  35.23 
 
 		 454 aa  269  8e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0272  lateral flagellar hook associated protein 1  35.87 
 
 		 458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3362  flagellar hook-associated protein FlgK  35.65 
 
 		 458 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0218  flagellar hook-associated protein FlgK  32.97 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0648  flagellar hook-associated protein FlgK  32.68 
 
 		 453 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0246  flagellar hook-associated protein FlgK  32.2 
 
 		 452 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0193  flagellar hook-associated protein FlgK  31.55 
 
 		 452 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.363354  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0215  flagellar hook-associated protein FlgK  32.54 
 
 		 455 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4680  flagellar hook-associated protein FlgK  29.41 
 
 		 429 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296928 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  30.21 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  29.24 
 
 		 477 aa  159  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  27.66 
 
 		 464 aa  151  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  32.07 
 
 		 686 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  30.59 
 
 		 688 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  27.67 
 
 		 478 aa  144  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3471  flagellar hook-associated protein FlgK  32.07 
 
 		 686 aa  143  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  30.61 
 
 		 683 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  32.52 
 
 		 682 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  31.19 
 
 		 681 aa  139  7e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  31.56 
 
 		 637 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  30.58 
 
 		 682 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  31.83 
 
 		 680 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  26.92 
 
 		 458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  31.31 
 
 		 680 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  26.56 
 
 		 471 aa  130  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  29.57 
 
 		 631 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1606  flagellar hook-associated protein FlgK  28.45 
 
 		 637 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0566107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1330  flagellar hook-associated protein FlgK  29.34 
 
 		 641 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493477  normal  0.0693976 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1349  flagellar hook-associated protein FlgK  30.63 
 
 		 640 aa  127  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  28.11 
 
 		 631 aa  127  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1338  flagellar hook-associated protein FlgK  28.77 
 
 		 641 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  26.27 
 
 		 640 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2588  flagellar hook-associated protein FlgK  28.29 
 
 		 641 aa  124  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  29.79 
 
 		 676 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239.3  flagellar hook-associated protein  28.49 
 
 		 386 aa  123  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  25.96 
 
 		 480 aa  123  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1268  flagellar hook-associated protein FlgK  28.29 
 
 		 641 aa  123  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  29.31 
 
 		 647 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  28.12 
 
 		 638 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  30.07 
 
 		 920 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1354  flagellar hook-associated protein FlgK  27.68 
 
 		 638 aa  121  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2938  flagellar hook-associated protein FlgK  27.49 
 
 		 641 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  30.67 
 
 		 652 aa  120  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  28.32 
 
 		 641 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.348969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1425  flagellar hook-associated protein FlgK  28.32 
 
 		 641 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02919  Flagellar hook-associated protein  29.14 
 
 		 680 aa  119  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0013  flagellar hook-associated protein FlgK  26.14 
 
 		 475 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2953  flagellar hook-associated protein FlgK  26.9 
 
 		 641 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  30.6 
 
 		 640 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  28.89 
 
 		 645 aa  118  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  27.48 
 
 		 653 aa  118  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  28.53 
 
 		 541 aa  117  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  24.32 
 
 		 465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  25.21 
 
 		 456 aa  114  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  27.64 
 
 		 657 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3574  flagellar hook-associated protein FlgK  29.39 
 
 		 658 aa  113  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  27.56 
 
 		 847 aa  112  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01003  flagellar hook-associated protein FlgK  27.55 
 
 		 624 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163579  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06163  flagellar hook-associated protein FlgK  27.55 
 
 		 624 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.557443  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  26.28 
 
 		 547 aa  111  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1486  flagellar hook-associated protein  28.53 
 
 		 665 aa  111  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  26.28 
 
 		 547 aa  111  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  26.28 
 
 		 547 aa  111  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  26.28 
 
 		 547 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  27.79 
 
 		 553 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  26.48 
 
 		 547 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  27.79 
 
 		 553 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  27.79 
 
 		 553 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  26.28 
 
 		 547 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  26.48 
 
 		 547 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  27.42 
 
 		 695 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  27.79 
 
 		 553 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  27.79 
 
 		 553 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  26.48 
 
 		 547 aa  110  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 		 685 aa  110  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  29.46 
 
 		 629 aa  110  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1506  flagellar hook-associated protein FlgK  31.44 
 
 		 681 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  26.28 
 
 		 547 aa  110  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  26.51 
 
 		 619 aa  109  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2529  hypothetical protein  24.42 
 
 		 452 aa  108  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  31.23 
 
 		 623 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1312  flagellar hook-associated protein  27.27 
 
 		 639 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  23.75 
 
 		 489 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  28.48 
 
 		 539 aa  107  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  25.59 
 
 		 464 aa  107  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  28.96 
 
 		 549 aa  106  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2309  flagellar hook-associated protein  25.3 
 
 		 638 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.133958 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3000  flagellar hook-associated protein FlgK  25.89 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000379276 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1170  flagellar hook-associated protein FlgK  26.29 
 
 		 642 aa  105  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.793737  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  27.13 
 
 		 546 aa  103  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  28.54 
 
 		 623 aa  103  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3060  flagellar hook-associated protein FlgK  28.49 
 
 		 665 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2925  flagellar hook-associated protein FlgK  28.49 
 
 		 665 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.719396 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>