More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3378 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  100 
 
 
225 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  66.21 
 
 
223 aa  294  6e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0437  2-deoxyglucose-6-phosphatase  60.71 
 
 
221 aa  288  4e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000647119  hitchhiker  0.00000756317 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0381  2-deoxyglucose-6-phosphatase  63.64 
 
 
221 aa  286  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0071153  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3593  2-deoxyglucose-6-phosphatase  63.18 
 
 
218 aa  284  8e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  62.73 
 
 
218 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0432  2-deoxyglucose-6-phosphatase  62.27 
 
 
218 aa  279  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000498152  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0424  2-deoxyglucose-6-phosphatase  62.27 
 
 
222 aa  278  4e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  60.91 
 
 
218 aa  275  6e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000024214  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  60.45 
 
 
217 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  60.91 
 
 
217 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4047  2-deoxyglucose-6-phosphatase  61.82 
 
 
219 aa  268  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000965281  normal  0.234971 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3906  2-deoxyglucose-6-phosphatase  60.91 
 
 
219 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000443869  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3926  2-deoxyglucose-6-phosphatase  60.45 
 
 
219 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238408  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0284  2-deoxyglucose-6-phosphatase  60.27 
 
 
221 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458991 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3849  2-deoxyglucose-6-phosphatase  59.09 
 
 
219 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184484  hitchhiker  0.000000000456944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2445  2-deoxyglucose-6-phosphatase  42.25 
 
 
222 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1972  2-deoxyglucose-6-phosphatase  42.25 
 
 
222 aa  188  5.999999999999999e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1464  2-deoxyglucose-6-phosphatase  42.25 
 
 
222 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1947  2-deoxyglucose-6-phosphatase  42.25 
 
 
222 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.504113  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1912  2-deoxyglucose-6-phosphatase  43.52 
 
 
223 aa  188  5.999999999999999e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01696  predicted hydrolase  42.25 
 
 
222 aa  187  9e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1915  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.25 
 
 
222 aa  187  9e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.752357  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1905  2-deoxyglucose-6-phosphatase  42.25 
 
 
222 aa  187  9e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.798501  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01684  hypothetical protein  42.25 
 
 
222 aa  187  9e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  42.25 
 
 
222 aa  187  9e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.305682  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2205  2-deoxyglucose-6-phosphatase  43.06 
 
 
221 aa  187  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100097  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1419  2-deoxyglucose-6-phosphatase  43.66 
 
 
222 aa  184  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  hitchhiker  0.00259415 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1451  2-deoxyglucose-6-phosphatase  43.66 
 
 
222 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.913842  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1849  2-deoxyglucose-6-phosphatase  43.66 
 
 
222 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0029739  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2022  2-deoxyglucose-6-phosphatase  43.66 
 
 
222 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  43.66 
 
 
222 aa  184  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.905236  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1697  2-deoxyglucose-6-phosphatase  44.34 
 
 
221 aa  178  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  44.34 
 
 
221 aa  178  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.417032  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.23 
 
 
217 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.022243  hitchhiker  0.00896914 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1717  2-deoxyglucose-6-phosphatase  39.44 
 
 
223 aa  174  7e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2125  2-deoxyglucose-6-phosphatase  42.33 
 
 
221 aa  171  7.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0177126  hitchhiker  0.00144451 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  38.03 
 
 
218 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  38.71 
 
 
220 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0674  phosphatase  38.19 
 
 
215 aa  154  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.71 
 
 
226 aa  149  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281035  normal  0.462582 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  35.55 
 
 
221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4825  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.67 
 
 
224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
221 aa  115  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.74 
 
 
238 aa  108  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39300  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  31.11 
 
 
218 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1058  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.38 
 
 
217 aa  103  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  32.13 
 
 
213 aa  102  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.63 
 
 
227 aa  101  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  35.05 
 
 
456 aa  101  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  34.17 
 
 
456 aa  101  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  28.84 
 
 
248 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  28.71 
 
 
226 aa  99.8  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  31.55 
 
 
228 aa  99.4  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.96 
 
 
222 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2048  HAD family hydrolase  30.41 
 
 
238 aa  96.7  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539587  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  27.75 
 
 
227 aa  96.7  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.89 
 
 
217 aa  96.3  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  27.39 
 
 
223 aa  95.9  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  33 
 
 
456 aa  94.7  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.32 
 
 
235 aa  94.7  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.95 
 
 
213 aa  94.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4356  HAD family hydrolase  30.9 
 
 
233 aa  94.4  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.582602 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4107  HAD superfamily hydrolase  30.93 
 
 
221 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4427  HAD superfamily hydrolase  30.93 
 
 
221 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  31.58 
 
 
396 aa  93.2  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.58 
 
 
227 aa  92.8  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.28 
 
 
224 aa  92.8  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.57 
 
 
233 aa  92.8  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1509  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.88 
 
 
231 aa  92.4  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193428 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  28.24 
 
 
216 aa  92.4  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  29.02 
 
 
223 aa  92.4  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2052  HAD superfamily hydrolase  28.05 
 
 
707 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380026  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3689  HAD family hydrolase  28.05 
 
 
707 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3972  HAD family hydrolase  30.9 
 
 
241 aa  92  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.5 
 
 
234 aa  91.7  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.26 
 
 
235 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3945  HAD superfamily hydrolase  30.41 
 
 
221 aa  91.3  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4073  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  29.17 
 
 
219 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.358464  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
218 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4222  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.41 
 
 
220 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  31.38 
 
 
220 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.36 
 
 
235 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3956  HAD superfamily hydrolase  31.44 
 
 
220 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.945579  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1729  HAD family hydrolase  30.21 
 
 
728 aa  90.9  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.696153  hitchhiker  0.000289006 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4056  HAD family hydrolase  29.79 
 
 
215 aa  90.5  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.23 
 
 
219 aa  89  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  26.39 
 
 
221 aa  89  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  30.77 
 
 
219 aa  89.4  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  28.7 
 
 
215 aa  89  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  32.12 
 
 
188 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.77 
 
 
231 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1571  HAD family hydrolase  27.19 
 
 
714 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.882263 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  30.35 
 
 
233 aa  88.2  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.27 
 
 
218 aa  88.2  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  31.58 
 
 
235 aa  88.2  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  31.77 
 
 
188 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  31.77 
 
 
188 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  29.15 
 
 
219 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2939  fructose-1-phosphatase  32.12 
 
 
188 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>