44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0720 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0720  major facilitator transporter  100 
 
 		 391 aa  779    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000797636  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0809  major facilitator transporter  79.59 
 
 		 407 aa  636    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0789  major facilitator transporter  77.69 
 
 		 395 aa  621  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0969  major facilitator transporter  80.53 
 
 		 402 aa  617  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00690521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0935  major facilitator transporter  80.79 
 
 		 402 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000445786  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0669  major facilitator transporter  79.37 
 
 		 396 aa  617  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0961  major facilitator superfamily MFS_1  80.26 
 
 		 402 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3401  major facilitator transporter  80.26 
 
 		 430 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3067  major facilitator transporter  80.05 
 
 		 401 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.126361 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3795  major facilitator transporter  79.37 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000234716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0870  major facilitator transporter  80.26 
 
 		 401 aa  610  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0905  major facilitator transporter  79.53 
 
 		 401 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0674  major facilitator transporter  77.02 
 
 		 388 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2883  major facilitator transporter  76.19 
 
 		 412 aa  594  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0141  major facilitator transporter  66.23 
 
 		 410 aa  520  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.197109  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0120  major facilitator transporter  63.02 
 
 		 397 aa  504  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001239  permease  59.32 
 
 		 393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.44328  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0845  MFS transporter  58.01 
 
 		 392 aa  456  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05106  hypothetical protein  58.01 
 
 		 393 aa  451  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2491  major facilitator transporter  56.99 
 
 		 405 aa  443  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3601  hypothetical protein  61.96 
 
 		 401 aa  436  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.190885  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1098  major facilitator superfamily MFS_1  52.47 
 
 		 409 aa  392  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1101  major facilitator transporter  53.4 
 
 		 398 aa  390  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0958  major facilitator transporter  51.02 
 
 		 415 aa  381  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2377  major facilitator transporter  50.91 
 
 		 411 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214373  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0430  major facilitator superfamily MFS_1  46.65 
 
 		 385 aa  324  2e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.138711  normal  0.304103 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1284  major facilitator transporter  46.18 
 
 		 380 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2829  hypothetical protein  45.33 
 
 		 396 aa  311  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0634  major facilitator transporter  44.03 
 
 		 382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0183387  normal  0.237204 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2366  major facilitator superfamily MFS_1  45.5 
 
 		 388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2940  major facilitator superfamily MFS_1  42.33 
 
 		 378 aa  287  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0699  major facilitator transporter  41.85 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2230  major facilitator superfamily transporter  40.16 
 
 		 391 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2176  major facilitator superfamily MFS_1  40.65 
 
 		 398 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2775  major facilitator superfamily MFS_1  41.29 
 
 		 388 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2047  major facilitator superfamily MFS_1  40.27 
 
 		 398 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.61632e-19 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1349  hypothetical protein  28.53 
 
 		 399 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138248  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1903  hypothetical protein  29.56 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0869  hypothetical protein  25.93 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1648  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4648  hypothetical protein  27.06 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000315706  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1379  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 438 aa  48.9  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  26.49 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 392 aa  43.1  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>