More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0661 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0661  malate dehydrogenase  100 
 
 		 535 aa  1098    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.245423 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0767  malate dehydrogenase  51.32 
 
 		 556 aa  568  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3293  malate dehydrogenase  54.51 
 
 		 555 aa  558  1e-158  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5810  malate dehydrogenase  50.85 
 
 		 543 aa  544  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.414547  normal  0.345135 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51970  predicted protein  49.25 
 
 		 555 aa  496  1e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0997978  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28620  predicted protein  44.09 
 
 		 549 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1833  malate dehydrogenase  46.36 
 
 		 544 aa  472  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.381517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_56501  predicted protein  44.24 
 
 		 638 aa  468  9.999999999999999e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.511026  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26919  predicted protein  45.2 
 
 		 565 aa  468  9.999999999999999e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06168  Malic enzyme [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J260]  43.63 
 
 		 648 aa  457  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0801811  normal  0.142996 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1786  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))  44.59 
 
 		 552 aa  455  1.0000000000000001e-126  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3043  malate dehydrogenase  42.41 
 
 		 556 aa  450  1e-125  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2901  malate dehydrogenase  42.88 
 
 		 556 aa  451  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0982  malate dehydrogenase  44.13 
 
 		 560 aa  450  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.871776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3704  malate dehydrogenase  46.49 
 
 		 574 aa  448  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303465 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1274  malate dehydrogenase  43.49 
 
 		 562 aa  446  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.145162  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1561  malate dehydrogenase  45.08 
 
 		 563 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.501858  hitchhiker  0.00674056 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1387  malate dehydrogenase  44.32 
 
 		 560 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0537  malate dehydrogenase  44.13 
 
 		 560 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1567  malate dehydrogenase  45.02 
 
 		 565 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0809  malate dehydrogenase  43.68 
 
 		 562 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3937  malate dehydrogenase  42.16 
 
 		 550 aa  445  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003737  NAD-dependent malic enzyme  43.49 
 
 		 562 aa  443  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0866358  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02034  malate dehydrogenase  43.68 
 
 		 562 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3924  malate dehydrogenase  44.92 
 
 		 573 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.694196  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2451  malate dehydrogenase  44.3 
 
 		 565 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1743  malate dehydrogenase  43.73 
 
 		 565 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.260406  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1873  malate dehydrogenase  43.22 
 
 		 577 aa  437  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1650  malate dehydrogenase  43.04 
 
 		 577 aa  435  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2971  malate dehydrogenase  43.62 
 
 		 565 aa  436  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.419193  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2546  malate dehydrogenase  43.62 
 
 		 565 aa  437  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1777  malate dehydrogenase  43.91 
 
 		 565 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1682  malate dehydrogenase  43.73 
 
 		 565 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.638669 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1599  malate dehydrogenase  43.73 
 
 		 565 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1680  malate dehydrogenase  43.91 
 
 		 565 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.13099  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01437  malate dehydrogenase, (decarboxylating, NAD-requiring) (malic enzyme)  42.8 
 
 		 565 aa  432  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00511494  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2168  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  42.8 
 
 		 565 aa  432  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.399362  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1836  malate dehydrogenase  46.67 
 
 		 570 aa  432  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1922  malate dehydrogenase  42.86 
 
 		 570 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1668  malate dehydrogenase  43.04 
 
 		 570 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1848  malate dehydrogenase  42.86 
 
 		 570 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000107878 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1564  malate dehydrogenase  42.8 
 
 		 565 aa  432  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1615  malate dehydrogenase  42.86 
 
 		 577 aa  433  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2178  malate dehydrogenase  42.8 
 
 		 565 aa  432  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01449  hypothetical protein  42.8 
 
 		 565 aa  432  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0044137  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1801  malate dehydrogenase  43.04 
 
 		 577 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1494  malate dehydrogenase  43.81 
 
 		 565 aa  435  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1661  malate dehydrogenase  42.8 
 
 		 565 aa  432  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1695  malate dehydrogenase  42.8 
 
 		 565 aa  432  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.488975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2562  malate dehydrogenase  44.1 
 
 		 565 aa  430  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2091  malate dehydrogenase  42.44 
 
 		 565 aa  431  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2463  malate dehydrogenase  44.1 
 
 		 565 aa  430  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3529  malate dehydrogenase  42.67 
 
 		 570 aa  432  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1812  malate dehydrogenase  42.49 
 
 		 570 aa  429  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2047  malate dehydrogenase  42.8 
 
 		 565 aa  429  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0724  malate dehydrogenase  43.28 
 
 		 564 aa  431  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1666  malate dehydrogenase  42.86 
 
 		 570 aa  431  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1742  malate dehydrogenase  42.8 
 
 		 565 aa  431  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.375647  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0902  malate dehydrogenase  44.92 
 
 		 562 aa  426  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1744  malate dehydrogenase  40.66 
 
 		 571 aa  426  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.945317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1242  malate dehydrogenase  45.29 
 
 		 569 aa  428  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2963  malate dehydrogenase  45.69 
 
 		 561 aa  426  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3186  malate dehydrogenase  44.03 
 
 		 562 aa  427  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3518  malate dehydrogenase  44.32 
 
 		 562 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0833  malate dehydrogenase  42.25 
 
 		 562 aa  424  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4262  malate dehydrogenase  42.01 
 
 		 562 aa  420  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1243  malate dehydrogenase  39 
 
 		 571 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2621  malate dehydrogenase  42.38 
 
 		 562 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.898165 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1243  malate dehydrogenase  38.82 
 
 		 571 aa  417  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0736  malate dehydrogenase  41.79 
 
 		 562 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19190  malate dehydrogenase  43.52 
 
 		 564 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.408174 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3529  malate dehydrogenase  46.49 
 
 		 568 aa  414  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41212  predicted protein  40.15 
 
 		 555 aa  414  1e-114  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0240958  normal  0.449043 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00517  malate dehydrogenase  42.97 
 
 		 563 aa  413  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2962  malate dehydrogenase  43.86 
 
 		 562 aa  414  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3188  malate dehydrogenase  41.45 
 
 		 562 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000330281 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0778  malate dehydrogenase  41.45 
 
 		 562 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0299274 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0676  malate dehydrogenase  41.79 
 
 		 562 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3855  malate dehydrogenase  41.45 
 
 		 562 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3634  malate dehydrogenase  41.79 
 
 		 562 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.532529  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3757  malate dehydrogenase  41.79 
 
 		 562 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3566  malate dehydrogenase  41.79 
 
 		 562 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0750  malate dehydrogenase  41.6 
 
 		 562 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.036774 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0979  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  43.86 
 
 		 577 aa  405  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2155  malate dehydrogenase  42.34 
 
 		 582 aa  405  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4404  malate dehydrogenase  41.97 
 
 		 570 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0784  malate dehydrogenase  41.98 
 
 		 562 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.228066  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12474  predicted protein  44.35 
 
 		 547 aa  405  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161702  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1656  malate dehydrogenase  43.7 
 
 		 564 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.843142  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2079  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  40.97 
 
 		 579 aa  394  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.128788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0888  malate dehydrogenase  39.52 
 
 		 565 aa  389  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.950644  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1127  malate dehydrogenase  39.33 
 
 		 565 aa  387  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32508  predicted protein  42.23 
 
 		 539 aa  388  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00409134  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06933  conserved hypothetical protein similar to yeast mitochondrial NAD-dependent malic enzyme (Eurofung)  40.36 
 
 		 581 aa  385  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0486  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))  40.48 
 
 		 596 aa  381  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1564  malate dehydrogenase  38.18 
 
 		 541 aa  377  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1532  malate dehydrogenase  38.57 
 
 		 542 aa  373  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000122059  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00620  malate dehydrogenase  39.58 
 
 		 609 aa  375  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1005  malate dehydrogenase  38.56 
 
 		 542 aa  372  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89732  mitochondrial malate dehydrogenase  37.18 
 
 		 638 aa  370  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>