More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1833 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1833  malate dehydrogenase  100 
 
 		 544 aa  1111    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.381517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3937  malate dehydrogenase  59.78 
 
 		 550 aa  700    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3293  malate dehydrogenase  50.75 
 
 		 555 aa  508  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5810  malate dehydrogenase  48.03 
 
 		 543 aa  503  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.414547  normal  0.345135 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0767  malate dehydrogenase  47.94 
 
 		 556 aa  479  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0661  malate dehydrogenase  46.36 
 
 		 535 aa  472  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.245423 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28620  predicted protein  43.78 
 
 		 549 aa  444  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_56501  predicted protein  41.71 
 
 		 638 aa  438  1e-121  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.511026  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1786  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))  42.65 
 
 		 552 aa  427  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003737  NAD-dependent malic enzyme  41.89 
 
 		 562 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1274  malate dehydrogenase  41.17 
 
 		 562 aa  409  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.145162  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02034  malate dehydrogenase  40.62 
 
 		 562 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2971  malate dehydrogenase  42.08 
 
 		 565 aa  402  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.419193  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0809  malate dehydrogenase  40.98 
 
 		 562 aa  403  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2451  malate dehydrogenase  41.89 
 
 		 565 aa  404  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1494  malate dehydrogenase  42.08 
 
 		 565 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2463  malate dehydrogenase  42.08 
 
 		 565 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2546  malate dehydrogenase  42.26 
 
 		 565 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2562  malate dehydrogenase  42.08 
 
 		 565 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1567  malate dehydrogenase  42.08 
 
 		 565 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4262  malate dehydrogenase  40.26 
 
 		 562 aa  395  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2963  malate dehydrogenase  44.2 
 
 		 561 aa  396  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0724  malate dehydrogenase  41.44 
 
 		 564 aa  399  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12474  predicted protein  43.66 
 
 		 547 aa  397  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161702  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0537  malate dehydrogenase  40.69 
 
 		 560 aa  393  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3043  malate dehydrogenase  39.23 
 
 		 556 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2901  malate dehydrogenase  39.42 
 
 		 556 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26919  predicted protein  40.25 
 
 		 565 aa  395  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3566  malate dehydrogenase  41.45 
 
 		 562 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3634  malate dehydrogenase  41.45 
 
 		 562 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.532529  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2621  malate dehydrogenase  41.35 
 
 		 562 aa  392  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.898165 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06168  Malic enzyme [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J260]  38.95 
 
 		 648 aa  390  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0801811  normal  0.142996 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51970  predicted protein  41.77 
 
 		 555 aa  391  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0997978  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0676  malate dehydrogenase  41.27 
 
 		 562 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3757  malate dehydrogenase  41.27 
 
 		 562 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0736  malate dehydrogenase  41.64 
 
 		 562 aa  390  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00517  malate dehydrogenase  42.36 
 
 		 563 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1836  malate dehydrogenase  45.85 
 
 		 570 aa  386  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0784  malate dehydrogenase  40.91 
 
 		 562 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.228066  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2079  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  39.89 
 
 		 579 aa  387  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.128788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2155  malate dehydrogenase  40.8 
 
 		 582 aa  388  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2047  malate dehydrogenase  39.93 
 
 		 565 aa  385  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0902  malate dehydrogenase  40 
 
 		 562 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3855  malate dehydrogenase  40.62 
 
 		 562 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1243  malate dehydrogenase  37.7 
 
 		 571 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1387  malate dehydrogenase  39.42 
 
 		 560 aa  385  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3518  malate dehydrogenase  40.26 
 
 		 562 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3704  malate dehydrogenase  42.91 
 
 		 574 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303465 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3188  malate dehydrogenase  40.8 
 
 		 562 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000330281 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0778  malate dehydrogenase  40.8 
 
 		 562 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0299274 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1777  malate dehydrogenase  39.37 
 
 		 565 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0979  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  40.71 
 
 		 577 aa  379  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1243  malate dehydrogenase  37.34 
 
 		 571 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1561  malate dehydrogenase  40.11 
 
 		 563 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.501858  hitchhiker  0.00674056 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1599  malate dehydrogenase  39.56 
 
 		 565 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1680  malate dehydrogenase  39.37 
 
 		 565 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.13099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0982  malate dehydrogenase  39.42 
 
 		 560 aa  380  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.871776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1682  malate dehydrogenase  39.56 
 
 		 565 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.638669 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3186  malate dehydrogenase  40.18 
 
 		 562 aa  382  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19190  malate dehydrogenase  43.34 
 
 		 564 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.408174 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0750  malate dehydrogenase  40.26 
 
 		 562 aa  381  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.036774 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1743  malate dehydrogenase  39.56 
 
 		 565 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.260406  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01437  malate dehydrogenase, (decarboxylating, NAD-requiring) (malic enzyme)  39 
 
 		 565 aa  379  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00511494  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2168  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  39 
 
 		 565 aa  379  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.399362  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1695  malate dehydrogenase  38.82 
 
 		 565 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.488975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1742  malate dehydrogenase  38.82 
 
 		 565 aa  375  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.375647  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1744  malate dehydrogenase  38.21 
 
 		 571 aa  378  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.945317  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3924  malate dehydrogenase  40.94 
 
 		 573 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.694196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2178  malate dehydrogenase  39 
 
 		 565 aa  378  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2091  malate dehydrogenase  38.82 
 
 		 565 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1564  malate dehydrogenase  39 
 
 		 565 aa  378  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1661  malate dehydrogenase  38.82 
 
 		 565 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01449  hypothetical protein  39 
 
 		 565 aa  379  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0044137  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2962  malate dehydrogenase  40.49 
 
 		 562 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1656  malate dehydrogenase  43.34 
 
 		 564 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.843142  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0833  malate dehydrogenase  39.53 
 
 		 562 aa  373  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1242  malate dehydrogenase  41.54 
 
 		 569 aa  371  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4404  malate dehydrogenase  38.84 
 
 		 570 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1005  malate dehydrogenase  37.43 
 
 		 542 aa  366  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1812  malate dehydrogenase  37.73 
 
 		 570 aa  365  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3529  malate dehydrogenase  37.32 
 
 		 570 aa  364  2e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1666  malate dehydrogenase  37.73 
 
 		 570 aa  364  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1873  malate dehydrogenase  37.32 
 
 		 577 aa  360  3e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1650  malate dehydrogenase  37.14 
 
 		 577 aa  360  4e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1615  malate dehydrogenase  37.14 
 
 		 577 aa  360  4e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1922  malate dehydrogenase  37.14 
 
 		 570 aa  360  4e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1668  malate dehydrogenase  37.14 
 
 		 570 aa  360  5e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1848  malate dehydrogenase  37.14 
 
 		 570 aa  360  5e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000107878 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1801  malate dehydrogenase  37.14 
 
 		 577 aa  359  6e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1191  malate dehydrogenase  38.08 
 
 		 544 aa  359  8e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.16614  normal  0.0761619 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0888  malate dehydrogenase  37 
 
 		 565 aa  355  1e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.950644  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3529  malate dehydrogenase  42.86 
 
 		 568 aa  353  4e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0486  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))  38.3 
 
 		 596 aa  353  4e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1127  malate dehydrogenase  36.96 
 
 		 565 aa  353  5e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41212  predicted protein  36.2 
 
 		 555 aa  350  3e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0240958  normal  0.449043 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2154  malate dehydrogenase  40.26 
 
 		 578 aa  350  4e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1564  malate dehydrogenase  34.01 
 
 		 541 aa  347  2e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1532  malate dehydrogenase  36.16 
 
 		 542 aa  347  3e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000122059  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00620  malate dehydrogenase  37.97 
 
 		 609 aa  343  4e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32508  predicted protein  40.95 
 
 		 539 aa  339  8e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00409134  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>