More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_12474 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009358  OSTLU_12474  predicted protein  100 
 
 		 547 aa  1103    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161702  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3293  malate dehydrogenase  45.49 
 
 		 555 aa  447  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5810  malate dehydrogenase  44.69 
 
 		 543 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.414547  normal  0.345135 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0767  malate dehydrogenase  44.71 
 
 		 556 aa  425  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51970  predicted protein  43.99 
 
 		 555 aa  417  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0997978  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0661  malate dehydrogenase  43.72 
 
 		 535 aa  412  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.245423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3937  malate dehydrogenase  42.6 
 
 		 550 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1833  malate dehydrogenase  43.39 
 
 		 544 aa  400  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.381517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32508  predicted protein  45.29 
 
 		 539 aa  380  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00409134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_56501  predicted protein  38.69 
 
 		 638 aa  367  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.511026  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41212  predicted protein  38.01 
 
 		 555 aa  360  3e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0240958  normal  0.449043 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06168  Malic enzyme [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J260]  38.89 
 
 		 648 aa  352  8e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0801811  normal  0.142996 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1786  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))  38.71 
 
 		 552 aa  347  3e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28620  predicted protein  39.52 
 
 		 549 aa  342  1e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26919  predicted protein  37.23 
 
 		 565 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3704  malate dehydrogenase  38.49 
 
 		 574 aa  332  8e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303465 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1848  malate dehydrogenase  39.45 
 
 		 570 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000107878 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1650  malate dehydrogenase  39.45 
 
 		 577 aa  332  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1615  malate dehydrogenase  39.45 
 
 		 577 aa  332  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1243  malate dehydrogenase  34.89 
 
 		 571 aa  332  1e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1922  malate dehydrogenase  39.45 
 
 		 570 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1812  malate dehydrogenase  39.45 
 
 		 570 aa  331  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3529  malate dehydrogenase  39.24 
 
 		 570 aa  331  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1873  malate dehydrogenase  39.45 
 
 		 577 aa  330  3e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1668  malate dehydrogenase  39.24 
 
 		 570 aa  330  4e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1801  malate dehydrogenase  39.24 
 
 		 577 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1243  malate dehydrogenase  35.14 
 
 		 571 aa  330  6e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1695  malate dehydrogenase  35.78 
 
 		 565 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.488975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1564  malate dehydrogenase  35.78 
 
 		 565 aa  327  5e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2178  malate dehydrogenase  35.78 
 
 		 565 aa  327  5e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2091  malate dehydrogenase  35.78 
 
 		 565 aa  327  5e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01437  malate dehydrogenase, (decarboxylating, NAD-requiring) (malic enzyme)  35.78 
 
 		 565 aa  326  6e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00511494  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2168  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  35.78 
 
 		 565 aa  326  6e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.399362  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01449  hypothetical protein  35.78 
 
 		 565 aa  326  6e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0044137  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2463  malate dehydrogenase  36.68 
 
 		 565 aa  326  7e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2562  malate dehydrogenase  36.68 
 
 		 565 aa  326  7e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1661  malate dehydrogenase  35.78 
 
 		 565 aa  326  7e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1742  malate dehydrogenase  35.78 
 
 		 565 aa  326  8.000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.375647  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1666  malate dehydrogenase  38.4 
 
 		 570 aa  325  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1387  malate dehydrogenase  34.19 
 
 		 560 aa  324  3e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1599  malate dehydrogenase  34.68 
 
 		 565 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1743  malate dehydrogenase  34.68 
 
 		 565 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.260406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1680  malate dehydrogenase  34.91 
 
 		 565 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.13099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1682  malate dehydrogenase  34.68 
 
 		 565 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.638669 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1777  malate dehydrogenase  34.91 
 
 		 565 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0736  malate dehydrogenase  37.65 
 
 		 562 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1274  malate dehydrogenase  34.82 
 
 		 562 aa  318  2e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.145162  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0902  malate dehydrogenase  35.78 
 
 		 562 aa  318  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1836  malate dehydrogenase  39.57 
 
 		 570 aa  318  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2901  malate dehydrogenase  35.96 
 
 		 556 aa  318  2e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003737  NAD-dependent malic enzyme  36.44 
 
 		 562 aa  318  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0866358  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2451  malate dehydrogenase  36.44 
 
 		 565 aa  316  8e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0979  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  37.15 
 
 		 577 aa  316  9e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3043  malate dehydrogenase  35.96 
 
 		 556 aa  315  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2047  malate dehydrogenase  35.81 
 
 		 565 aa  315  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1567  malate dehydrogenase  35.91 
 
 		 565 aa  314  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3186  malate dehydrogenase  35.7 
 
 		 562 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3518  malate dehydrogenase  35.84 
 
 		 562 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3188  malate dehydrogenase  36.23 
 
 		 562 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000330281 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0778  malate dehydrogenase  36.23 
 
 		 562 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0299274 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02034  malate dehydrogenase  35.56 
 
 		 562 aa  313  3.9999999999999997e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0982  malate dehydrogenase  34.55 
 
 		 560 aa  313  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.871776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2963  malate dehydrogenase  37.3 
 
 		 561 aa  313  5.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0750  malate dehydrogenase  36.03 
 
 		 562 aa  312  9e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.036774 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3566  malate dehydrogenase  36.03 
 
 		 562 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3634  malate dehydrogenase  36.03 
 
 		 562 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.532529  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2962  malate dehydrogenase  35.83 
 
 		 562 aa  311  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3855  malate dehydrogenase  36.23 
 
 		 562 aa  311  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3924  malate dehydrogenase  36.01 
 
 		 573 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.694196  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2971  malate dehydrogenase  36.36 
 
 		 565 aa  311  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.419193  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4262  malate dehydrogenase  36.33 
 
 		 562 aa  310  2.9999999999999997e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0676  malate dehydrogenase  35.83 
 
 		 562 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0809  malate dehydrogenase  35.83 
 
 		 562 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1561  malate dehydrogenase  35.03 
 
 		 563 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.501858  hitchhiker  0.00674056 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1744  malate dehydrogenase  34.1 
 
 		 571 aa  310  4e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.945317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3757  malate dehydrogenase  35.83 
 
 		 562 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0833  malate dehydrogenase  35.43 
 
 		 562 aa  310  5e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0784  malate dehydrogenase  35.63 
 
 		 562 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.228066  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0537  malate dehydrogenase  35.91 
 
 		 560 aa  309  8e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1494  malate dehydrogenase  35.14 
 
 		 565 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2621  malate dehydrogenase  34.93 
 
 		 562 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.898165 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00517  malate dehydrogenase  35.63 
 
 		 563 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2546  malate dehydrogenase  35.35 
 
 		 565 aa  306  8.000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0724  malate dehydrogenase  35.34 
 
 		 564 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2964  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  35.55 
 
 		 572 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.10034  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4404  malate dehydrogenase  37.28 
 
 		 570 aa  303  5.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19190  malate dehydrogenase  35.64 
 
 		 564 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.408174 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00620  malate dehydrogenase  37.65 
 
 		 609 aa  302  1e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1242  malate dehydrogenase  39.66 
 
 		 569 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3529  malate dehydrogenase  37.45 
 
 		 568 aa  299  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06933  conserved hypothetical protein similar to yeast mitochondrial NAD-dependent malic enzyme (Eurofung)  35 
 
 		 581 aa  298  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0486  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))  36.69 
 
 		 596 aa  298  3e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1564  malate dehydrogenase  34.57 
 
 		 541 aa  296  6e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1005  malate dehydrogenase  34.36 
 
 		 542 aa  296  6e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2079  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  37.15 
 
 		 579 aa  295  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.128788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2155  malate dehydrogenase  36.85 
 
 		 582 aa  295  2e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03780  malate dehydrogenase, putative  33.94 
 
 		 629 aa  291  3e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.807689  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1656  malate dehydrogenase  35.64 
 
 		 564 aa  290  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.843142  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2154  malate dehydrogenase  38.17 
 
 		 578 aa  288  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0888  malate dehydrogenase  34.62 
 
 		 565 aa  288  2e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.950644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>