152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1460 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1460  transposase  100 
 
 		 166 aa  338  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277669  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1459  IS6 family transposase  99.27 
 
 		 162 aa  275  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835209  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1506  transposase  82.48 
 
 		 238 aa  238  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1481  transposase  82.48 
 
 		 238 aa  238  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84376  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1485  transposase  82.48 
 
 		 238 aa  238  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1495  transposase  82.48 
 
 		 238 aa  238  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0219  integrase catalytic subunit  65.69 
 
 		 231 aa  187  8e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.465023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  63.95 
 
 		 232 aa  185  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2782  integrase catalytic subunit  64.96 
 
 		 231 aa  183  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0790  transposase, putative  73.64 
 
 		 110 aa  164  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0245034  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  47.06 
 
 		 233 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9039  transposase  44.12 
 
 		 243 aa  104  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0563  transposase protein  44.2 
 
 		 238 aa  104  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0546  transposase  43.48 
 
 		 238 aa  99  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4725  transposase  43.57 
 
 		 237 aa  96.3  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393822  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7848  putative transposase  43.7 
 
 		 233 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8446  putative transposase  43.7 
 
 		 233 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7882  putative transposase  43.7 
 
 		 233 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7870  putative transposase  43.7 
 
 		 233 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7844  putative transposase  43.7 
 
 		 233 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  48.65 
 
 		 233 aa  95.5  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  48.65 
 
 		 233 aa  95.1  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  48.65 
 
 		 233 aa  95.1  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  48.65 
 
 		 233 aa  95.1  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0561  transposase protein  46.36 
 
 		 233 aa  91.7  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4519  putative transposase  46.85 
 
 		 233 aa  92  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00999598  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7470  transposase  42.75 
 
 		 196 aa  91.3  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8615  putative transposase  40.29 
 
 		 233 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4506  integrase catalytic region  32.12 
 
 		 236 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7074  transposase  42.22 
 
 		 238 aa  88.2  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8012  transposase protein  45.65 
 
 		 238 aa  87.8  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8044  transposase  45.65 
 
 		 238 aa  87.8  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3173  transposase  38.69 
 
 		 236 aa  87  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.19085  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1165  putative IS element transposase  44.63 
 
 		 242 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1696  IS6 family transposase  44.63 
 
 		 242 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1705  IS6 family transposase  44.63 
 
 		 242 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2794  ISRh1 transposase-like protein  44.63 
 
 		 242 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4360  transposase  43.57 
 
 		 237 aa  85.5  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.017545  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3113  transposase  38.69 
 
 		 236 aa  85.1  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3283  transposase  38.69 
 
 		 236 aa  85.1  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9042  transposase  44.93 
 
 		 238 aa  84.3  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1703  IS6 family transposase  43.8 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7148  transposase  51.79 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0077  IS6 family transposase  43.8 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9135  transposase  53.41 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0658372  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2762  transposase  37.78 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297514  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3017  transposase  38.93 
 
 		 237 aa  64.7  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3074  transposase  38.93 
 
 		 237 aa  64.7  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3086  transposase  38.93 
 
 		 237 aa  64.7  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2913  transposase  38.93 
 
 		 237 aa  64.7  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2945  transposase  38.93 
 
 		 237 aa  64.7  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2997  transposase  38.93 
 
 		 237 aa  64.7  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3012  transposase  38.93 
 
 		 237 aa  64.7  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5740  IS6 family transposase  38.61 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7263  transposase  37.5 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C12  transposase  37.78 
 
 		 226 aa  57.8  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  37.78 
 
 		 226 aa  57.4  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000656405  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D32  transposase  37.78 
 
 		 226 aa  57.8  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3336  IS240 transposase  33.67 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1619  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4166  integrase  30.84 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4558  transposase  34 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  36.67 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  33.67 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  33.67 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0148  transposase  36.67 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  30.91 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  30.91 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  37.5 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D13  transposase  35.56 
 
 		 236 aa  54.7  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  30.91 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  30 
 
 		 236 aa  54.7  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  30.91 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  35.71 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  30.91 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0139  transposase  35.56 
 
 		 226 aa  53.9  0.0000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  32.65 
 
 		 235 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3358  integrase catalytic region  30.7 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  30 
 
 		 213 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  31.37 
 
 		 222 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  30 
 
 		 213 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  30.91 
 
 		 237 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  36.36 
 
 		 226 aa  52  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4446  integrase catalytic region  29.91 
 
 		 175 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C41  transposase  36.36 
 
 		 226 aa  52  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  35.05 
 
 		 226 aa  52  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  28.81 
 
 		 212 aa  51.6  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  28.81 
 
 		 238 aa  51.6  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  29.91 
 
 		 236 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  30.91 
 
 		 237 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  29.91 
 
 		 224 aa  50.8  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0002  truncated IS431mec-like transposase  32.1 
 
 		 214 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00153541  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0021  truncated IS431mec-like transposase  32.1 
 
 		 208 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  31.96 
 
 		 243 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  29.13 
 
 		 236 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_52  transposase  32.17 
 
 		 246 aa  50.1  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00159101  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0249  IS431mec-like transposase  28.57 
 
 		 224 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2739  integrase catalytic subunit  30.86 
 
 		 221 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2815  integrase catalytic region  30.86 
 
 		 221 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.411277  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1579  IS431mec-like transposase  29.63 
 
 		 224 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0008  IS431mec-like transposase  29.63 
 
 		 224 aa  48.1  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>