More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2122 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2122  SufS subfamily cysteine desulfurase  100 
 
 
435 aa  875    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0104519  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3079  SufS subfamily cysteine desulfurase  66.27 
 
 
434 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582401  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  66.67 
 
 
434 aa  570  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  64.59 
 
 
429 aa  563  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  62.8 
 
 
421 aa  536  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  64.05 
 
 
441 aa  530  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  60.96 
 
 
419 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.09 
 
 
442 aa  508  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  58.35 
 
 
421 aa  489  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  58.19 
 
 
418 aa  481  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  58.17 
 
 
429 aa  477  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.69 
 
 
433 aa  472  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.97 
 
 
428 aa  474  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  56.73 
 
 
424 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  58.98 
 
 
411 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.43 
 
 
443 aa  467  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.65 
 
 
435 aa  457  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5150  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.24 
 
 
425 aa  451  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.32 
 
 
435 aa  439  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.4 
 
 
414 aa  433  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  53.15 
 
 
441 aa  427  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.41 
 
 
412 aa  427  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.07 
 
 
419 aa  427  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.52 
 
 
421 aa  423  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.67 
 
 
414 aa  423  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.3 
 
 
449 aa  419  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.09 
 
 
412 aa  420  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.27 
 
 
415 aa  418  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  52.29 
 
 
417 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.23 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2386  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.14 
 
 
426 aa  417  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168267  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.26 
 
 
429 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.77 
 
 
429 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.17 
 
 
406 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.92 
 
 
417 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  53.06 
 
 
414 aa  410  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.54 
 
 
406 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.43 
 
 
417 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  53.62 
 
 
425 aa  410  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.43 
 
 
417 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3484  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.09 
 
 
442 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  49.03 
 
 
420 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.71 
 
 
416 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.97 
 
 
420 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.94 
 
 
420 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  45.63 
 
 
420 aa  400  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.76 
 
 
417 aa  401  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.79 
 
 
419 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.04 
 
 
419 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  46.76 
 
 
414 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  46.06 
 
 
420 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  48.18 
 
 
419 aa  397  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.61 
 
 
406 aa  395  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.74 
 
 
410 aa  398  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.4 
 
 
417 aa  396  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  45.65 
 
 
423 aa  395  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.53 
 
 
409 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0407  cysteine desulphurases, SufS  48.18 
 
 
428 aa  392  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.61 
 
 
451 aa  395  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  47.94 
 
 
413 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.88 
 
 
413 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.81 
 
 
441 aa  391  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50 
 
 
418 aa  391  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  44.88 
 
 
406 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.88 
 
 
413 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.06 
 
 
404 aa  389  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1361  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.35 
 
 
446 aa  389  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  51.09 
 
 
408 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.88 
 
 
406 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.38 
 
 
414 aa  390  1e-107  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.52 
 
 
427 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1235  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.16 
 
 
443 aa  389  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  44.88 
 
 
406 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  44.88 
 
 
406 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  44.88 
 
 
406 aa  388  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  44.88 
 
 
406 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1144  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.88 
 
 
432 aa  387  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2279  cysteine desulfurase  49.75 
 
 
426 aa  386  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0879534  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  44.88 
 
 
406 aa  388  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  48.3 
 
 
422 aa  385  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.24 
 
 
416 aa  388  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  44.88 
 
 
406 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.59 
 
 
429 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  47.88 
 
 
417 aa  385  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  44.12 
 
 
408 aa  388  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.17 
 
 
415 aa  385  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  44.88 
 
 
406 aa  388  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  45.43 
 
 
413 aa  382  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.25 
 
 
415 aa  383  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  44.63 
 
 
406 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.45 
 
 
419 aa  383  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.12 
 
 
407 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.7 
 
 
774 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  47.57 
 
 
406 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.31 
 
 
412 aa  382  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.15 
 
 
408 aa  382  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.97 
 
 
414 aa  385  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.58 
 
 
415 aa  385  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.69 
 
 
415 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.89 
 
 
406 aa  381  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>