130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3479 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4601  tryptophan-specific transport protein  76.33 
 
 		 414 aa  637    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4108  aromatic amino acid transporter  78.47 
 
 		 418 aa  655    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3513  aromatic amino acid transport protein  76.5 
 
 		 417 aa  647    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3787  aromatic amino acid transporter  77.51 
 
 		 418 aa  652    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3860  aromatic amino acid transporter  77.27 
 
 		 418 aa  650    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3987  aromatic amino acid transporter  77.03 
 
 		 418 aa  649    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3479  aromatic amino acid transport protein  100 
 
 		 418 aa  826    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0158  aromatic amino acid transporter  78.71 
 
 		 418 aa  658    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3778  aromatic amino acid transporter  77.03 
 
 		 418 aa  656    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4176  aromatic amino acid transporter  78.47 
 
 		 418 aa  656    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4307  aromatic amino acid transporter  78.71 
 
 		 418 aa  657    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3531  aromatic amino acid transporter  76.74 
 
 		 418 aa  626  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0182  aromatic amino acid transporter  74.82 
 
 		 418 aa  625  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0262  aromatic amino acid transporter  74.16 
 
 		 418 aa  621  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0202  aromatic amino acid transporter  76.98 
 
 		 418 aa  621  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3995  aromatic amino acid transporter  76.26 
 
 		 418 aa  619  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1031  aromatic amino acid transporter  56.46 
 
 		 425 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71710  tryptophan permease  57.59 
 
 		 417 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.268423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6222  tryptophan permease  58.09 
 
 		 467 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3236  aromatic amino acid transporter  52.43 
 
 		 414 aa  431  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2776  aromatic amino acid transporter  51.82 
 
 		 414 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3572  tryptophan permease  56.16 
 
 		 414 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3598  tryptophan permease  56.9 
 
 		 414 aa  421  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0157208 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2697  tryptophan-specific transport protein  51.57 
 
 		 414 aa  420  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3535  tryptophan permease  56.16 
 
 		 414 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0544  aromatic amino acid transporter  56.16 
 
 		 414 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3466  tryptophan permease  55.91 
 
 		 414 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3466  tryptophan permease  55.91 
 
 		 414 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4480  tryptophan permease  56.16 
 
 		 414 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1511  tryptophan-specific transport protein  51.57 
 
 		 412 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3457  tryptophan permease  55.91 
 
 		 414 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.813995 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03028  tryptophan transporter of high affinity  55.91 
 
 		 414 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3634  tryptophan permease  55.91 
 
 		 414 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02979  hypothetical protein  55.91 
 
 		 414 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3353  tryptophan permease  55.91 
 
 		 414 aa  414  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3643  tryptophan permease  55.91 
 
 		 414 aa  414  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0537  tryptophan permease  55.91 
 
 		 414 aa  414  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0411186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3611  tryptophan permease  55.91 
 
 		 414 aa  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0755  tryptophan permease  51.8 
 
 		 424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0991  tryptophan permease  53.32 
 
 		 424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0097  aromatic amino acid transporter  50.36 
 
 		 419 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.103921  normal  0.507347 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1562  tryptophan-specific transport protein  50.36 
 
 		 416 aa  385  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000304843  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1135  aromatic amino acid transporter  43.42 
 
 		 409 aa  330  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.55679  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03593  tryptophan transporter of low affinity  44.5 
 
 		 415 aa  329  4e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03537  hypothetical protein  44.5 
 
 		 415 aa  329  4e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3923  tryptophan permease TnaB  44.5 
 
 		 415 aa  329  4e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4218  tryptophan permease TnaB  44.5 
 
 		 415 aa  329  4e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4258  aromatic amino acid transporter  44.25 
 
 		 415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5140  tryptophan permease TnaB  44.5 
 
 		 415 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.406172 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4285  tryptophan permease TnaB  44.01 
 
 		 415 aa  327  3e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4213  tryptophan permease TnaB  44.25 
 
 		 413 aa  323  4e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1118  tryptophan-specific transport protein  44.23 
 
 		 411 aa  296  6e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0800  tryptophan permease  42.65 
 
 		 409 aa  289  6e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.121788  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1034  tyrosine-specific transport protein  36.84 
 
 		 403 aa  239  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311327  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1736  aromatic amino acid transporter  37.09 
 
 		 403 aa  239  9e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000018039  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1276  tyrosine-specific transport protein  37.09 
 
 		 403 aa  239  9e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00001928  hitchhiker  0.0000367731 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1118  aromatic amino acid transporter  37.59 
 
 		 402 aa  238  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01875  tyrosine transporter  36.84 
 
 		 403 aa  237  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0104717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01864  hypothetical protein  36.84 
 
 		 403 aa  237  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00693993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2005  tyrosine-specific transport protein  36.84 
 
 		 403 aa  237  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000529329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2140  tyrosine-specific transport protein  36.84 
 
 		 403 aa  237  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000592969  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2647  tyrosine-specific transport protein  36.84 
 
 		 403 aa  237  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.588852  hitchhiker  0.0000000318595 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1729  aromatic amino acid transporter  36.84 
 
 		 403 aa  237  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000563721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2092  tyrosine-specific transport protein  37.14 
 
 		 422 aa  232  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0842051  hitchhiker  0.0000739999 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3197  aromatic amino acid transporter  36.84 
 
 		 402 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1307  tyrosine-specific transport protein  36.88 
 
 		 422 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107929 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2152  tyrosine-specific transport protein  36.88 
 
 		 422 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000242218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2099  tyrosine-specific transport protein  36.88 
 
 		 422 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.23753e-19 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1184  tyrosine-specific transport protein  36.88 
 
 		 422 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0526  aromatic amino acid transporter  34.09 
 
 		 400 aa  227  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.560578  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2774  tyrosine-specific transport protein  37.97 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1318  tyrosine-specific transport protein  37.97 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2853  aromatic amino acid transporter  37.97 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2426  aromatic amino acid transporter  35.25 
 
 		 395 aa  223  7e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.392601  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2544  aromatic amino acid transporter  35.5 
 
 		 395 aa  223  7e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487399  decreased coverage  0.00912111 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1925  aromatic amino acid transporter  35.25 
 
 		 395 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00166231  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4434  aromatic amino acid transporter  36.39 
 
 		 400 aa  219  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2433  aromatic amino acid transporter  35 
 
 		 395 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.485869  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2186  aromatic amino acid transporter  35.25 
 
 		 395 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.338137  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2065  tyrosine-specific transport protein  35.44 
 
 		 395 aa  218  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3276  aromatic amino acid transporter  38.35 
 
 		 402 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3188  aromatic amino acid permease  36.07 
 
 		 395 aa  217  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1846  aromatic amino acid transporter  35.44 
 
 		 395 aa  216  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510263 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1792  aromatic amino acid transporter  35.19 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0511  putative tyrosine-specific transport protein  33.42 
 
 		 400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2185  aromatic amino acid transporter  36.27 
 
 		 395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0712  tyrosine-specific transport protein  35.62 
 
 		 400 aa  211  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0574  aromatic amino acid permease  36.7 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3298  tyrosine-specific transport protein  35.64 
 
 		 388 aa  207  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2489  aromatic amino acid transporter  36.65 
 
 		 425 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0641  aromatic amino acid permease  35.2 
 
 		 399 aa  203  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3878  aromatic amino acid permease  33.84 
 
 		 391 aa  202  9e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00957771  hitchhiker  0.00000285867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3938  aromatic amino acid permease  35.12 
 
 		 392 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  0.472237 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003573  tyrosine-specific transport protein  33.15 
 
 		 380 aa  192  9e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0780  tyrosine-specific transport protein  34.25 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000892482  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3465  aromatic amino acid permease  35.83 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.230898  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0897  aromatic amino acid permease  35.83 
 
 		 391 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3389  aromatic amino acid permease  35.47 
 
 		 395 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3588  aromatic amino acid permease  35.56 
 
 		 391 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0916  aromatic amino acid permease  36 
 
 		 395 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>