More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1325 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
478 aa  973  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  51.35 
 
 
485 aa  509  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.49346e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  54.58 
 
 
464 aa  501  1e-141  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 
485 aa  489  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.94011e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 
482 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 
494 aa  475  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
477 aa  473  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 
485 aa  461  1e-128  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  4.30888e-08  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 
479 aa  456  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 
490 aa  457  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 
490 aa  455  1e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.92193e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 
480 aa  453  1e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 
481 aa  452  1e-126  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 
488 aa  449  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.04549e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 
490 aa  446  1e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 
469 aa  442  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
469 aa  439  1e-122  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 
491 aa  439  1e-122  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.57278e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 
486 aa  438  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  5.07745e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  44.31 
 
 
495 aa  433  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 
491 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
501 aa  428  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
488 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  46.52 
 
 
518 aa  421  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
491 aa  417  1e-115  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 
469 aa  417  1e-115  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
485 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.96162e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
485 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  4.57939e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
485 aa  412  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.72568e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
485 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  9.37191e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
485 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  7.68632e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 
491 aa  414  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.69227e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
485 aa  413  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  5.36948e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
485 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  5.2897e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 
491 aa  408  1e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.14653e-06  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
473 aa  405  1e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
485 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.67432e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 
488 aa  404  1e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 
484 aa  400  1e-110  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
492 aa  397  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
484 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
484 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
496 aa  397  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  44.98 
 
 
546 aa  398  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 
467 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 
465 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
467 aa  388  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 
466 aa  385  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
469 aa  386  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
467 aa  381  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  5.0225e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 
466 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
484 aa  379  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
464 aa  378  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  4.16745e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 
464 aa  376  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 
495 aa  375  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 
468 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 
499 aa  373  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.20471e-10  hitchhiker  3.82568e-09 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 
471 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
487 aa  374  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 
488 aa  374  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 
481 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  7.02508e-12  unclonable  1.80865e-07 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 
484 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 
500 aa  371  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
464 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 
480 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 
494 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 
466 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_52655  glutamyl-trna synthase  41.02 
 
 
588 aa  367  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.233509  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 
481 aa  364  1e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  4.48328e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 
463 aa  365  1e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 
472 aa  363  3e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  3.47292e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 
498 aa  362  8e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1201  glutamyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
501 aa  362  9e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.96599e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
468 aa  362  1e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
465 aa  361  2e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0777  glutamyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 
467 aa  358  8e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.980364  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 
491 aa  358  1e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
493 aa  358  1e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 
464 aa  357  2e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 
483 aa  357  3e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2222  glutamyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 
508 aa  357  4e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.493461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1876  glutamyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 
482 aa  357  4e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000140035  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
483 aa  356  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
483 aa  355  9e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
481 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0592  glutamyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 
467 aa  355  1e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 
492 aa  354  2e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
464 aa  353  5e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 
469 aa  352  6e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  2.88711e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 
504 aa  352  7e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
484 aa  352  9e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0161  glutamyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 
498 aa  350  2e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0361508  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
494 aa  351  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 
467 aa  350  4e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl651  glutamyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 
482 aa  348  8e-95  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 
476 aa  347  4e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
471 aa  346  4e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2714  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
469 aa  346  6e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.69422e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0696  glutamyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 
463 aa  346  6e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69774  normal  0.269454 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 
472 aa  345  9e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>