More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0592 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0592  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 467 aa  948    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0777  glutamyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 		 467 aa  493  9.999999999999999e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.980364  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  49.35 
 
 		 464 aa  478  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1176  glutamyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 		 462 aa  477  1e-133  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  49.35 
 
 		 464 aa  478  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 480 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 490 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 477 aa  385  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 494 aa  372  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 478 aa  373  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 491 aa  369  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 479 aa  372  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 485 aa  365  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 485 aa  365  1e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 482 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 		 501 aa  360  4e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 485 aa  359  5e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 496 aa  359  8e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  38.8 
 
 		 495 aa  358  9e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 		 466 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 490 aa  352  1e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 469 aa  350  3e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 470 aa  350  4e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 470 aa  349  5e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 473 aa  348  1e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 469 aa  348  2e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 464 aa  347  2e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 469 aa  346  4e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 		 466 aa  346  5e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 465 aa  345  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 469 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 481 aa  343  4e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 		 467 aa  343  5e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 467 aa  342  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 467 aa  341  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 490 aa  339  5e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 		 488 aa  337  2.9999999999999997e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  39.32 
 
 		 546 aa  335  7e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 486 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 		 463 aa  334  2e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 468 aa  333  4e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 		 480 aa  332  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1080  glutamyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 445 aa  331  2e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 		 464 aa  330  3e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 491 aa  330  3e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 471 aa  330  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 471 aa  330  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 469 aa  329  7e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 		 471 aa  328  1.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 471 aa  327  3e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 		 488 aa  327  3e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 488 aa  327  4.0000000000000003e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 		 500 aa  326  6e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 		 472 aa  325  8.000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 		 470 aa  325  9e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 		 468 aa  325  1e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 		 487 aa  324  2e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3417  glutamyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 		 469 aa  324  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 471 aa  324  3e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 		 495 aa  322  9.000000000000001e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1430  glutamyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 469 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 469 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000145575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 471 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 471 aa  321  9.999999999999999e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 		 491 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  34.53 
 
 		 484 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  37.29 
 
 		 472 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  36.73 
 
 		 471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 		 465 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1365  glutamyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 469 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000124879  normal  0.0325353 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 484 aa  320  3e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2350  glutamyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 474 aa  320  3e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 471 aa  320  3e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 484 aa  320  3e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 		 471 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2931  glutamyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 471 aa  319  5e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000400457  normal  0.117314 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 471 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 471 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 471 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 471 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000633167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 		 509 aa  319  7e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  37.29 
 
 		 474 aa  319  7e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  37.29 
 
 		 474 aa  319  7e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 470 aa  319  7e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 		 466 aa  318  9e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 		 466 aa  318  9e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 		 469 aa  318  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2499  glutamyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 		 469 aa  318  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000172182  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 		 467 aa  318  2e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1554  glutamyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 		 469 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000003282  normal  0.0351282 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2947  glutamyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 		 469 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000528448  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2822  glutamyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 		 469 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000059188  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 488 aa  317  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 485 aa  317  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>