More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0266 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 116 aa  228  1e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0290  30S ribosomal protein S13  73.04 
 
 		 126 aa  176  7e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000353572  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  71.3 
 
 		 122 aa  161  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  68.7 
 
 		 125 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  65.22 
 
 		 124 aa  160  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  67.54 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  67.83 
 
 		 123 aa  159  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  66.09 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  66.09 
 
 		 124 aa  159  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  66.09 
 
 		 122 aa  158  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  66.96 
 
 		 122 aa  159  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  66.96 
 
 		 128 aa  157  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  70.43 
 
 		 126 aa  157  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  67.83 
 
 		 122 aa  157  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  66.09 
 
 		 122 aa  157  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  66.09 
 
 		 122 aa  157  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  66.96 
 
 		 128 aa  156  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  66.96 
 
 		 128 aa  156  8e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  68.75 
 
 		 122 aa  155  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  66.96 
 
 		 123 aa  155  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  66.09 
 
 		 127 aa  155  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  64.35 
 
 		 123 aa  154  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  66.96 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1113  30S ribosomal protein S13  64.91 
 
 		 123 aa  154  4e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000830783  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  65.18 
 
 		 122 aa  153  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  66.09 
 
 		 123 aa  153  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  65.18 
 
 		 122 aa  153  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  66.67 
 
 		 127 aa  153  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5763  30S ribosomal protein S13  63.48 
 
 		 125 aa  153  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  67.83 
 
 		 126 aa  153  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  66.09 
 
 		 127 aa  153  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  66.09 
 
 		 123 aa  153  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  65.22 
 
 		 122 aa  153  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  65.22 
 
 		 124 aa  152  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4367  30S ribosomal protein S13  65.22 
 
 		 125 aa  152  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.128251  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  66.96 
 
 		 124 aa  152  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  65.18 
 
 		 122 aa  151  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  63.48 
 
 		 127 aa  151  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  63.48 
 
 		 123 aa  152  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3139  30S ribosomal protein S13  60.87 
 
 		 125 aa  151  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111016  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  62.61 
 
 		 121 aa  151  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1317  30S ribosomal protein S13  60.53 
 
 		 125 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1369  30S ribosomal protein S13  60.53 
 
 		 125 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000385836  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0173  30S ribosomal protein S13  64.35 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.190252 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  64.35 
 
 		 123 aa  150  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0092  30S ribosomal protein S13  64.35 
 
 		 121 aa  150  4e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0157087  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  63.48 
 
 		 124 aa  150  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  63.48 
 
 		 124 aa  150  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  63.48 
 
 		 124 aa  150  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0866  ribosomal protein S13  66.09 
 
 		 126 aa  150  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.336367  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  64.29 
 
 		 122 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  61.74 
 
 		 125 aa  150  7e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  64.35 
 
 		 125 aa  150  8e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  62.61 
 
 		 124 aa  149  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  62.93 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1579  30S ribosomal protein S13  63.48 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  60.87 
 
 		 126 aa  148  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1764  30S ribosomal protein S13  63.48 
 
 		 121 aa  149  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  65.22 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04230  SSU ribosomal protein S13P  64.35 
 
 		 126 aa  148  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.305446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1945  30S ribosomal protein S13  63.48 
 
 		 121 aa  149  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.260742  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0275  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 125 aa  148  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  64.29 
 
 		 122 aa  149  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1214  30S ribosomal protein S13  64.35 
 
 		 126 aa  148  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698597 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  62.28 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2657  30S ribosomal protein S13  65.22 
 
 		 124 aa  148  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  61.74 
 
 		 123 aa  147  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2942  30S ribosomal protein S13  65.22 
 
 		 125 aa  148  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1731  30S ribosomal protein S13  61.74 
 
 		 125 aa  148  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  63.48 
 
 		 124 aa  148  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2620  30S ribosomal protein S13  64.55 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0961  ribosomal protein S13  60.87 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4289  30S ribosomal protein S13  64.35 
 
 		 126 aa  147  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.532691  hitchhiker  0.0012872 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  60.87 
 
 		 122 aa  147  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  64.29 
 
 		 123 aa  147  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  62.61 
 
 		 122 aa  147  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  62.61 
 
 		 122 aa  147  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_441  ribosomal protein S13  58.26 
 
 		 129 aa  146  8e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306085  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3898  30S ribosomal protein S13  64.35 
 
 		 126 aa  146  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1008  30S ribosomal protein S13  63.48 
 
 		 122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836667  normal  0.0493097 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1924  30S ribosomal protein S13  62.83 
 
 		 125 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0591  30S ribosomal protein S13  64.35 
 
 		 123 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000407723  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0430  30S ribosomal protein S13  64.35 
 
 		 123 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  62.61 
 
 		 122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0476  30S ribosomal protein S13  58.26 
 
 		 129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000389275  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2988  30S ribosomal protein S13  62.83 
 
 		 125 aa  145  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  61.74 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1945  30S ribosomal protein S13  61.74 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1011  30S ribosomal protein S13  60.87 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.452762  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1754  30S ribosomal protein S13  60.87 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0137496  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4293  ribosomal protein S13  65.45 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  61.74 
 
 		 125 aa  144  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  59.48 
 
 		 122 aa  144  3e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2529  30S ribosomal protein S13  61.74 
 
 		 122 aa  144  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186837  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0615  30S ribosomal protein S13  61.74 
 
 		 122 aa  144  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0730  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 127 aa  145  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2142  30S ribosomal protein S13  63.48 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2512  30S ribosomal protein S13  60.87 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2457  30S ribosomal protein S13  63.48 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0331  30S ribosomal protein S13  62.61 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352213  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>