137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0327 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  100 
 
 
237 aa  492  1e-138  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  36.32 
 
 
228 aa  173  2e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2316  urease accessory protein UreF  38.39 
 
 
229 aa  171  7e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  38.39 
 
 
229 aa  171  7e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1873  urease accessory protein UreF  35.27 
 
 
229 aa  157  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.674114  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0475  urease accessory protein UreF  35.11 
 
 
235 aa  155  5e-37  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  33.78 
 
 
232 aa  149  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  31.84 
 
 
225 aa  143  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  30.94 
 
 
238 aa  137  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2769  Urease accessory protein UreF  33.8 
 
 
225 aa  134  1e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  33.18 
 
 
227 aa  132  4e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  28.51 
 
 
228 aa  112  4e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  25.33 
 
 
240 aa  111  1e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  26.22 
 
 
240 aa  110  2e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  28.51 
 
 
228 aa  108  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  28.09 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  27.8 
 
 
230 aa  84.3  1e-15  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  22.87 
 
 
227 aa  77  2e-13  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  23.98 
 
 
224 aa  75.9  5e-13  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  25.32 
 
 
230 aa  72.8  4e-12  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  24.55 
 
 
228 aa  72  8e-12  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  23.08 
 
 
235 aa  70.5  2e-11  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6191  urease accessory protein UreF  26.7 
 
 
227 aa  70.5  2e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00827459  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  24 
 
 
232 aa  70.9  2e-11  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  22.59 
 
 
233 aa  70.1  3e-11  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  23.38 
 
 
224 aa  69.7  3e-11  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2996  urease accessory protein UreF  22.52 
 
 
232 aa  69.3  5e-11  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  27.68 
 
 
210 aa  69.3  5e-11  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  23.01 
 
 
224 aa  68.9  6e-11  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1465  Urease accessory protein UreF  23.42 
 
 
240 aa  68.9  6e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2030  urease accessory protein UreF  25.33 
 
 
229 aa  68.9  7e-11  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.859598  normal  0.139287 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  23.42 
 
 
253 aa  68.9  7e-11  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  27.7 
 
 
227 aa  67.4  2e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1303  urease accessory protein UreF  23.42 
 
 
240 aa  67.4  2e-10  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  21.97 
 
 
223 aa  67  3e-10  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  23.89 
 
 
251 aa  66.6  3e-10  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  24.14 
 
 
230 aa  66.2  4e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00891  Urease accessory protein UreF  23.72 
 
 
208 aa  66.2  4e-10  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42714  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2362  putative urease accessory protein  26.46 
 
 
210 aa  65.9  5e-10  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.875021 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1070  urease accessory protein UreF  24.08 
 
 
250 aa  65.9  5e-10  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4452  urease accessory protein UreF  24.55 
 
 
224 aa  66.2  5e-10  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1180  urease accessory protein UreF  24.8 
 
 
238 aa  64.7  1e-09  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801104  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0562  urease accessory protein UreF  24.32 
 
 
224 aa  64.7  1e-09  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4910  urease accessory protein UreF  24.44 
 
 
224 aa  63.9  2e-09  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  23.83 
 
 
226 aa  63.9  2e-09  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1553  Urease accessory protein UreF  22.69 
 
 
266 aa  62.8  4e-09  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  21.46 
 
 
236 aa  62.4  6e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1859  Urease accessory protein UreF  24.55 
 
 
229 aa  62.4  7e-09  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  27.15 
 
 
210 aa  62  7e-09  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  23.73 
 
 
230 aa  62  8e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0721  urease accessory protein UreF  20.09 
 
 
236 aa  61.2  1e-08  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2555  urease accessory protein UreF  20.09 
 
 
226 aa  61.2  1e-08  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3114  urease accessory protein UreF  20.09 
 
 
236 aa  61.2  1e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  25.34 
 
 
240 aa  61.2  1e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  27.48 
 
 
210 aa  61.6  1e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2059  urease accessory protein UreF  20.09 
 
 
236 aa  61.2  1e-08  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.917688  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3078  urease accessory protein UreF  20.09 
 
 
236 aa  61.2  1e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0958  urease accessory protein UreF  22.54 
 
 
230 aa  61.6  1e-08  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3137  urease accessory protein  20.09 
 
 
236 aa  61.2  1e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2186  urease accessory protein UreF  20.09 
 
 
226 aa  61.2  1e-08  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  22.82 
 
 
238 aa  61.6  1e-08  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0223  urease accessory protein UreF  23.71 
 
 
221 aa  61.2  1e-08  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0061  Urease accessory protein UreF  24.48 
 
 
239 aa  60.5  2e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0665  urease accessory protein UreF  25.56 
 
 
224 aa  60.5  2e-08  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675417  normal  0.0233838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4444  urease accessory protein UreF  21.97 
 
 
225 aa  60.8  2e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.8214 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4214  urease accessory protein UreF  23.98 
 
 
247 aa  60.8  2e-08  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  23.24 
 
 
244 aa  60.1  3e-08  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2991  urease accessory protein UreF  22.42 
 
 
231 aa  59.7  3e-08  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.901747  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  21.46 
 
 
228 aa  60.1  3e-08  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  21.97 
 
 
232 aa  59.3  5e-08  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  24.46 
 
 
231 aa  58.9  6e-08  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  23.98 
 
 
241 aa  58.9  6e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  21.27 
 
 
226 aa  58.5  8e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3941  Urease accessory protein UreF  22.58 
 
 
259 aa  58.5  8e-08  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.552118  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2420  urease accessory protein UreF  24.55 
 
 
224 aa  58.5  1e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1195  urease accessory protein UreF  26.11 
 
 
226 aa  57  2e-07  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  22.42 
 
 
225 aa  57.4  2e-07  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3469  urease accessory protein  25.1 
 
 
230 aa  57.8  2e-07  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  21.19 
 
 
232 aa  57.4  2e-07  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  22.94 
 
 
309 aa  56.6  3e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2182  Urease accessory protein UreF  24.12 
 
 
229 aa  56.6  3e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.124246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5615  urease accessory protein UreF  25.89 
 
 
223 aa  56.2  4e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  20.09 
 
 
226 aa  56.2  5e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64660  urease accessory protein UreF  25.89 
 
 
223 aa  55.5  8e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0385936  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0984  urease accessory protein UreF  23.83 
 
 
269 aa  55.1  9e-07  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.341569  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  20.68 
 
 
226 aa  55.1  9e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1355  Urease accessory protein UreF  24.34 
 
 
226 aa  54.3  1e-06  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1081  urease accessory protein UreF  22.37 
 
 
228 aa  54.7  1e-06  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  25.64 
 
 
223 aa  55.1  1e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.31623 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1135  urease accessory protein UreF  21.52 
 
 
228 aa  54.3  2e-06  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5118  Urease accessory protein UreF  21.62 
 
 
240 aa  53.9  2e-06  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3558  urease accessory protein  21.52 
 
 
228 aa  54.3  2e-06  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45506  normal  0.0231315 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2492  urease accessory protein UreF  20.43 
 
 
226 aa  53.9  2e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1206  urease accessory protein UreF  24.89 
 
 
215 aa  53.5  2e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3468  urease accessory protein UreF  23.58 
 
 
224 aa  54.3  2e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000115011  normal  0.208076 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  19.65 
 
 
226 aa  53.1  3e-06  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  21.05 
 
 
243 aa  53.5  3e-06  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0664  urease accessory protein  23.4 
 
 
237 aa  53.5  3e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  19.65 
 
 
226 aa  53.1  3e-06  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2866  urease accessory protein UreF  23.01 
 
 
229 aa  53.5  3e-06  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  0.213531 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>