More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3237 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3237  flagellin  100 
 
 
272 aa  531  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  89.34 
 
 
273 aa  475  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1609  flagellin domain-containing protein  87.13 
 
 
272 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  87.5 
 
 
272 aa  464  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3076  flagellin  86.03 
 
 
273 aa  455  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1608  flagellin domain-containing protein  87.13 
 
 
273 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  84.93 
 
 
272 aa  443  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  83.46 
 
 
273 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2306  flagellin-like protein  82.72 
 
 
272 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  81.99 
 
 
273 aa  436  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1315  flagellin-like protein  81.62 
 
 
272 aa  434  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  81.25 
 
 
273 aa  426  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  79.93 
 
 
274 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  80.51 
 
 
273 aa  424  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  79.2 
 
 
274 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  79.78 
 
 
273 aa  421  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2585  flagellin domain-containing protein  83.09 
 
 
271 aa  420  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  84.19 
 
 
270 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  78.47 
 
 
275 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  78.47 
 
 
275 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  78.68 
 
 
271 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  78.68 
 
 
271 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  75.74 
 
 
272 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  77.21 
 
 
271 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  77.21 
 
 
271 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  75.74 
 
 
272 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  76.84 
 
 
271 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  76.84 
 
 
271 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  51.82 
 
 
276 aa  255  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  49.83 
 
 
294 aa  251  6e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  53.76 
 
 
280 aa  251  7e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3087  flagellin-like  51.45 
 
 
276 aa  247  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  48.14 
 
 
294 aa  245  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  50.91 
 
 
274 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  49.63 
 
 
272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3088  flagellin-like  50.55 
 
 
274 aa  241  7e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  49.29 
 
 
279 aa  239  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  48.93 
 
 
279 aa  237  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  48.21 
 
 
278 aa  231  9e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  49.12 
 
 
283 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4306  flagellin domain protein  49.08 
 
 
263 aa  229  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240686  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  48.85 
 
 
272 aa  229  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04961  hypothetical protein  49.31 
 
 
289 aa  227  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1489  flagellin  51.59 
 
 
283 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  48 
 
 
271 aa  226  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  48 
 
 
271 aa  225  6e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  47.7 
 
 
287 aa  224  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0066  flagellin domain-containing protein  47.64 
 
 
271 aa  223  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0569033 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2887  flagellin domain protein  49.82 
 
 
278 aa  223  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0985  flagellin domain protein  46.93 
 
 
277 aa  222  6e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  48.73 
 
 
271 aa  221  8e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2237  flagellin-like protein  45.56 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  48.55 
 
 
276 aa  219  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  43.44 
 
 
319 aa  219  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  44.79 
 
 
288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0618  flagellin domain-containing protein  47.08 
 
 
290 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  43.75 
 
 
319 aa  219  5e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001174  flagellin protein flaA  46.43 
 
 
281 aa  218  6e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  50 
 
 
282 aa  217  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  47.08 
 
 
263 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  48 
 
 
271 aa  217  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0082  flagellin domain-containing protein  46.18 
 
 
272 aa  217  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3233  flagellin domain protein  44.73 
 
 
275 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3466  flagellin  49.65 
 
 
282 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  47.43 
 
 
263 aa  216  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  47.27 
 
 
271 aa  216  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0077  flagellin domain protein  46.69 
 
 
266 aa  214  9e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4305  flagellin domain protein  46.52 
 
 
262 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0943523  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1010  flagellin domain-containing protein  45.3 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0630  flagellin domain protein  45.96 
 
 
281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.892831  hitchhiker  0.00000486769 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2236  flagellin-like protein  45.19 
 
 
272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1009  flagellin domain-containing protein  45.45 
 
 
286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  46.52 
 
 
271 aa  213  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  46.52 
 
 
271 aa  213  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0631  flagellin domain protein  45.93 
 
 
281 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000536021 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2035  flagellin domain protein  42.52 
 
 
295 aa  211  7.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.546619 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1527  flagellin  50.53 
 
 
283 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  38.62 
 
 
378 aa  210  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1986  flagellin-like protein  47.06 
 
 
285 aa  208  8e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.462318  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2036  flagellin domain protein  41.91 
 
 
304 aa  208  8e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.391359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0076  flagellin domain protein  45.59 
 
 
265 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0784  flagellin, C-terminal:flagellin, N-terminal  44 
 
 
273 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605686 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2037  flagellin domain protein  42.18 
 
 
293 aa  206  4e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3703  flagellin  48.06 
 
 
284 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2938  flagellin-like protein  43.66 
 
 
272 aa  204  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  43.46 
 
 
282 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  64.02 
 
 
484 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  63.41 
 
 
485 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2611  flagellin domain protein  42.45 
 
 
278 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409959  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0315  flagellin domain-containing protein  43.01 
 
 
278 aa  199  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  43.68 
 
 
275 aa  199  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1342  flagellin-like  42.09 
 
 
278 aa  198  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308098  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2038  flagellin domain protein  42.03 
 
 
295 aa  198  7e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.416457 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  61.21 
 
 
481 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2515  flagellin domain protein  41.73 
 
 
278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0378301  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  60.85 
 
 
468 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  38.27 
 
 
327 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  59.89 
 
 
394 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2519  flagellin domain protein  43.17 
 
 
279 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000201488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1339  flagellin-like  41.94 
 
 
279 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000247158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>