More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1054 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1054  putative replication protein  100 
 
 		 249 aa  513  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.547763  hitchhiker  0.000000820302 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1084  putative replication protein  100 
 
 		 249 aa  513  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.372508  hitchhiker  0.0000157316 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2283  putative replication protein  99.6 
 
 		 249 aa  510  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552648  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1260  putative replication protein  57.43 
 
 		 248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000160786  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2283  IstB domain protein ATP-binding protein  55.42 
 
 		 248 aa  292  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.681758  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2275  putative replication protein  56.2 
 
 		 246 aa  291  6e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00200673  hitchhiker  0.0000000000000951726 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1153  putative replication protein  52.61 
 
 		 248 aa  285  5e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.255011 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1434  putative replication protein  52.61 
 
 		 248 aa  284  7e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00253442  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04238  DNA biosynthesis protein  48.77 
 
 		 245 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3636  AAA ATPase  48.77 
 
 		 245 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000285217  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4901  DNA replication protein DnaC  48.77 
 
 		 245 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3694  DNA replication protein DnaC  48.77 
 
 		 245 aa  251  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000380442  hitchhiker  0.00426992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5874  DNA replication protein DnaC  48.77 
 
 		 245 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000300612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04204  hypothetical protein  48.77 
 
 		 245 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000534515  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4593  DNA replication protein DnaC  48.77 
 
 		 245 aa  251  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000805827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4954  DNA replication protein DnaC  48.77 
 
 		 245 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163404  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4906  DNA replication protein DnaC  48.77 
 
 		 245 aa  250  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000177661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4864  DNA replication protein DnaC  48.36 
 
 		 245 aa  245  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4797  DNA replication protein DnaC  48.36 
 
 		 245 aa  245  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.849133 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4898  DNA replication protein DnaC  48.36 
 
 		 245 aa  245  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4951  DNA replication protein DnaC  48.36 
 
 		 245 aa  245  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4957  DNA replication protein DnaC  47.54 
 
 		 245 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0516  DNA replication protein DnaC  46.31 
 
 		 245 aa  240  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591707 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1434  DNA replication protein DnaC, putative  41.76 
 
 		 259 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1277  IstB domain protein ATP-binding protein  38.22 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0461295 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0137  IstB domain protein ATP-binding protein  38.22 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.118943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1566  DNA replication protein DnaC, putative  38.22 
 
 		 286 aa  132  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0638  IstB ATP binding domain-containing protein  35.75 
 
 		 257 aa  118  9e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1552  IstB domain protein ATP-binding protein  35.48 
 
 		 234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000031305 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1255  putative replication protein DnaC  31.79 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0168344  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  34.63 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3438  IstB ATP binding domain-containing protein  34.86 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228593  unclonable  9.96626e-17 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3956  IstB ATP binding domain-containing protein  32.27 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  29.91 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  28.78 
 
 		 267 aa  95.9  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1319  IstB ATP binding domain-containing protein  35.23 
 
 		 257 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  28.78 
 
 		 267 aa  95.9  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  28.78 
 
 		 267 aa  95.9  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  28.78 
 
 		 267 aa  95.9  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  29.15 
 
 		 263 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  36.99 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  36.3 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  36.3 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  32.28 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  34.45 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  29.82 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  29.82 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  31.08 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  26.85 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  30.97 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  30.51 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5818  ATPase  25.11 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  28.95 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  30.23 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23130  AAA ATPase  26.45 
 
 		 348 aa  68.9  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1816  IstB domain protein ATP-binding protein  33.74 
 
 		 280 aa  68.6  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  33.09 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  31.69 
 
 		 469 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  27.95 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3709  DNA replication protein-like protein  29.79 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860458  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3449  AAA family ATPase  25.26 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.539616  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3170  DNA replication protein-like protein  27.12 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18880  phage DNA replication protein (predicted replicative helicase loader)  33.33 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.614946  normal  0.0813321 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_479  DNA replication protein  26.83 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3454  AAA ATPase  25.26 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2623  DNA replication protein DnaC  29.1 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2940  DNA replication protein DnaC  29.1 
 
 		 331 aa  58.5  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.443717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0607  IstB domain protein ATP-binding protein  24.87 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1251  IstB ATP binding domain-containing protein  30.61 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4228  IstB ATP binding domain-containing protein  31.51 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0192  IstB ATP binding domain-containing protein  32.39 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0411  IstB ATP binding domain-containing protein  32.39 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0597  IstB ATP binding domain-containing protein  32.39 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1629  IstB ATP binding domain-containing protein  32.39 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1853  IstB ATP binding domain-containing protein  32.39 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.262764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2255  IstB ATP binding domain-containing protein  32.39 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2397  IstB ATP binding domain-containing protein  32.39 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0127781  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3179  IstB ATP binding domain-containing protein  32.39 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3534  hypothetical protein  24.74 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3818  hypothetical protein  24.74 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3588  DNA replication protein-like  26.95 
 
 		 297 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0998  IstB ATP binding domain-containing protein  31.69 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3728  DNA replication protein-like protein  26.95 
 
 		 299 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3654  DNA replication protein-like protein  26.95 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2615  DNA replication protein-like protein  28.57 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00158711  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0060  DNA replication protein, DNAC-like  23.75 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1802  hypothetical protein  24.71 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1499  IstB domain protein ATP-binding protein  26.61 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0674056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0299  IstB ATP binding domain-containing protein  29.29 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2981  IstB ATP binding domain-containing protein  31.69 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0623611  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0524  IstB ATP binding domain-containing protein  34.45 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0355335  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0081  putative insertion sequence ATP-binding protein  26.88 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.35432 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2666  putative IS21 transposase-associated ATP- binding protein  26.88 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.568551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1946  putative transposase-associated ATP- binding protein  26.88 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382996  normal  0.0777522 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2347  DNA replication protein DnaC  27.82 
 
 		 327 aa  54.7  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.104478  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0105  DNA replication protein DnaC  23.13 
 
 		 334 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf001  chromosomal replication initiation protein  25.79 
 
 		 454 aa  53.9  0.000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3060  IstB-like ATP-binding protein  25.49 
 
 		 277 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.509299  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4491  IstB-like ATP-binding protein  25.49 
 
 		 277 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.182494 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1787  putative transposase-associated ATP- binding protein  24.02 
 
 		 280 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>