More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0299 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0299  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 
259 aa  537  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1025  IstB domain protein ATP-binding protein  39.83 
 
 
280 aa  188  5.999999999999999e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.595202  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2581  transposase  38.31 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272524  normal  0.0734737 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4925  transposase  39.13 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  normal  0.337311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3161  transposase  39.13 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2855  transposase  39.13 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1969  transposase  39.13 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1590  transposase  39.13 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1025  transposase  39.13 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97029  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0137  IstB ATP binding domain-containing protein  39.83 
 
 
259 aa  175  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.784901  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2832  IstB ATP binding domain-containing protein  39.83 
 
 
259 aa  175  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443511  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2005  IstB-like ATP-binding protein  41.7 
 
 
252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00256513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2199  IstB-like ATP-binding protein  41.7 
 
 
252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2295  IstB-like ATP-binding protein  41.7 
 
 
252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2830  IstB-like ATP-binding protein  41.7 
 
 
252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1046  IstB ATP binding domain-containing protein  38.08 
 
 
252 aa  172  6.999999999999999e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1082  IstB domain protein ATP-binding protein  36.97 
 
 
258 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0856572  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0118  IstB domain protein ATP-binding protein  36.97 
 
 
258 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2580  IstB domain protein ATP-binding protein  37.97 
 
 
256 aa  167  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.226094  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0222  IstB domain protein ATP-binding protein  35.15 
 
 
274 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.923755  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1870  IstB domain protein ATP-binding protein  35.15 
 
 
274 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3227  IstB domain protein ATP-binding protein  35.15 
 
 
274 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3016  IstB domain protein ATP-binding protein  35.15 
 
 
274 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0289  IstB-like ATP-binding protein  37.28 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.241436  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0645  IstB-like ATP-binding protein  37.28 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0663  IstB-like ATP-binding protein  37.28 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00126088  hitchhiker  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2240  IstB-like ATP-binding protein  37.28 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0212724 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0791  putative DNA replication factor  39.22 
 
 
255 aa  163  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1500  IstB domain protein ATP-binding protein  36.75 
 
 
252 aa  160  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0247434  hitchhiker  0.000108884 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1176  IstB domain protein ATP-binding protein  36.75 
 
 
252 aa  160  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00428449  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1015  IstB domain protein ATP-binding protein  36.75 
 
 
252 aa  160  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.684278  normal  0.112434 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4984  IstB ATP binding domain-containing protein  36.13 
 
 
255 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4957  IstB ATP binding domain-containing protein  36.13 
 
 
255 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5138  IstB ATP binding domain-containing protein  36.13 
 
 
255 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16967  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25740  DNA replication protein  35.17 
 
 
267 aa  160  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13669  transposase  36.21 
 
 
248 aa  155  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0534177 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1360  IstB ATP binding domain-containing protein  34.32 
 
 
245 aa  155  7e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0134  IstB domain protein ATP-binding protein  36.68 
 
 
252 aa  155  7e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0211  transposition helper protein, IS21 family  33.47 
 
 
252 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233513 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0682  IstB ATP binding domain-containing protein  36.36 
 
 
248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.566484  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2537  IstB-like ATP-binding protein  34.91 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.626121  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2739  IstB domain protein ATP-binding protein  37.82 
 
 
250 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0338  IstB domain protein ATP-binding protein  37.04 
 
 
250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1004  IstB domain protein ATP-binding protein  35.92 
 
 
272 aa  152  7e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.102956  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0469  IstB ATP binding domain-containing protein  36.64 
 
 
272 aa  151  8.999999999999999e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3716  IstB ATP binding domain-containing protein  36.96 
 
 
258 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0109  IstB ATP binding domain-containing protein  36.96 
 
 
258 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1008  IstB ATP binding domain-containing protein  36.96 
 
 
258 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.126896  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1320  IstB ATP binding domain-containing protein  36.96 
 
 
258 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2855  IstB ATP binding domain-containing protein  36.96 
 
 
258 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1848  IstB domain protein ATP-binding protein  37.04 
 
 
263 aa  151  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2227  IS21 family transposition helper protein  34.05 
 
 
264 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703207  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1846  IstB ATP binding domain-containing protein  34.44 
 
 
266 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal  0.127228 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1705  IstB ATP binding domain-containing protein  34.44 
 
 
266 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0995  IS21 family transposition helper protein  34.05 
 
 
264 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0035  IS21 family transposition helper protein  34.05 
 
 
264 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0042  IS21 family transposition helper protein  34.05 
 
 
264 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932139  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3339  IS21 family transposition helper protein  34.05 
 
 
264 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2922  IS21 family transposition helper protein  34.05 
 
 
264 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0018  IS21 family transposition helper protein  34.05 
 
 
264 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0341022  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5625  IstB ATP binding domain-containing protein  34.44 
 
 
266 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264731  normal  0.669883 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0708  IstB ATP binding domain-containing protein  37.56 
 
 
221 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0058  IS21 family transposition helper protein  34.05 
 
 
265 aa  149  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2531  IstB domain protein ATP-binding protein  34.15 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000490561  hitchhiker  0.00141169 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4518  IstB domain protein ATP-binding protein  34.15 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0424  IstB domain protein ATP-binding protein  34.15 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3657  IstB domain protein ATP-binding protein  34.15 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.32372  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1513  IstB domain protein ATP-binding protein  32.64 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3692  IstB domain protein ATP-binding protein  32.64 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0064  IstB ATP binding domain-containing protein  33.48 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1622  IstB ATP binding domain-containing protein  33.48 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2292  IstB domain protein ATP-binding protein  32.9 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1327  IstB domain protein ATP-binding protein  33.05 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0459  IstB ATP binding domain-containing protein  36.21 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.498177  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1779  IstB ATP binding domain-containing protein  35.78 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.330119  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0131  IstB domain protein ATP-binding protein  32.9 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0259  IstB domain protein ATP-binding protein  32.9 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2088  IstB domain protein ATP-binding protein  32.9 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3059  IstB domain protein ATP-binding protein  32.64 
 
 
259 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0023  hypothetical protein  37.6 
 
 
240 aa  146  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.49121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0484  hypothetical protein  37.6 
 
 
240 aa  146  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1289  hypothetical protein  37.6 
 
 
240 aa  146  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2205  hypothetical protein  37.6 
 
 
240 aa  146  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2219  hypothetical protein  37.6 
 
 
240 aa  146  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.571769  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2750  IstB-like ATP-binding protein  38.24 
 
 
241 aa  146  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.512582  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3265  IstB ATP binding domain-containing protein  35.68 
 
 
265 aa  145  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0499602  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03410  DNA replication protein  33.48 
 
 
257 aa  145  5e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.896278  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0787  IstB domain protein ATP-binding protein  31.8 
 
 
259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3066  IstB domain protein ATP-binding protein  40.61 
 
 
251 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31550  transposase/IS protein  34.85 
 
 
259 aa  143  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49640  transposase/IS protein  34.85 
 
 
259 aa  143  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0836597  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36470  transposase/IS protein  34.85 
 
 
259 aa  143  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09540  transposase/IS protein  34.85 
 
 
259 aa  143  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2071  IstB-like ATP-binding protein  43.24 
 
 
162 aa  142  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.941019  normal  0.145342 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0013  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  33.05 
 
 
286 aa  142  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.197955 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0100  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  33.05 
 
 
286 aa  142  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.390043 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3669  IstB domain protein ATP-binding protein  33.19 
 
 
263 aa  142  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0388523  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4914  IstB ATP binding domain-containing protein  33.19 
 
 
271 aa  141  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.297532 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1864  IstB domain protein ATP-binding protein  32.81 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5625  transposase  33.77 
 
 
274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.426495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>