More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0222 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0222  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 		 274 aa  557  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.923755  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1870  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 		 274 aa  557  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3016  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 		 274 aa  557  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3227  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 		 274 aa  557  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0459  IstB ATP binding domain-containing protein  81.99 
 
 		 272 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.498177  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0424  IstB domain protein ATP-binding protein  80.86 
 
 		 263 aa  401  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4518  IstB domain protein ATP-binding protein  80.86 
 
 		 263 aa  401  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3657  IstB domain protein ATP-binding protein  80.86 
 
 		 263 aa  401  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.32372  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2531  IstB domain protein ATP-binding protein  80.86 
 
 		 263 aa  401  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000490561  hitchhiker  0.00141169 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1779  IstB ATP binding domain-containing protein  84.13 
 
 		 271 aa  398  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.330119  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0469  IstB ATP binding domain-containing protein  82.54 
 
 		 272 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3669  IstB domain protein ATP-binding protein  78.43 
 
 		 263 aa  393  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0388523  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3046  IstB domain protein ATP-binding protein  73.02 
 
 		 259 aa  385  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000101378  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3470  IstB domain protein ATP-binding protein  73.02 
 
 		 259 aa  385  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000505364  hitchhiker  0.00163359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2080  IstB domain protein ATP-binding protein  73.02 
 
 		 259 aa  385  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00584299  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3265  IstB ATP binding domain-containing protein  58.59 
 
 		 265 aa  254  9e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0499602  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1176  IstB domain protein ATP-binding protein  40.17 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00428449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1015  IstB domain protein ATP-binding protein  40.17 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.684278  normal  0.112434 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1500  IstB domain protein ATP-binding protein  40.17 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0247434  hitchhiker  0.000108884 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0791  putative DNA replication factor  42.19 
 
 		 255 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5138  IstB ATP binding domain-containing protein  41.81 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16967  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4984  IstB ATP binding domain-containing protein  41.81 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4957  IstB ATP binding domain-containing protein  41.81 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0708  IstB ATP binding domain-containing protein  39.73 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2666  IstB domain protein ATP-binding protein  39.7 
 
 		 262 aa  168  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0299  IstB ATP binding domain-containing protein  35.15 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1705  IstB ATP binding domain-containing protein  39.91 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5625  IstB ATP binding domain-containing protein  39.91 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264731  normal  0.669883 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1846  IstB ATP binding domain-containing protein  39.91 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal  0.127228 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4914  IstB ATP binding domain-containing protein  38.11 
 
 		 271 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.297532 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0137  IstB ATP binding domain-containing protein  34.19 
 
 		 259 aa  159  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.784901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2832  IstB ATP binding domain-containing protein  34.19 
 
 		 259 aa  159  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0118  IstB domain protein ATP-binding protein  36.4 
 
 		 258 aa  159  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3692  IstB domain protein ATP-binding protein  35.34 
 
 		 259 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1082  IstB domain protein ATP-binding protein  36.4 
 
 		 258 aa  159  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0856572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1513  IstB domain protein ATP-binding protein  35.34 
 
 		 259 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1327  IstB domain protein ATP-binding protein  35.74 
 
 		 259 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2005  IstB-like ATP-binding protein  35.04 
 
 		 252 aa  158  9e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00256513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2199  IstB-like ATP-binding protein  35.04 
 
 		 252 aa  158  9e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2295  IstB-like ATP-binding protein  35.04 
 
 		 252 aa  158  9e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2830  IstB-like ATP-binding protein  35.04 
 
 		 252 aa  158  9e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0787  IstB domain protein ATP-binding protein  36.21 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3059  IstB domain protein ATP-binding protein  34.94 
 
 		 259 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1644  DNA replication protein  37.45 
 
 		 261 aa  155  7e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1658  DNA replication protein  37.45 
 
 		 261 aa  155  7e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0377  IstB domain protein ATP-binding protein  38.03 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0134  IstB domain protein ATP-binding protein  33.48 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2304  IstB domain protein ATP-binding protein  38.03 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0100  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  37.5 
 
 		 286 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.390043 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0013  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  37.5 
 
 		 286 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.197955 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1848  IstB domain protein ATP-binding protein  34.38 
 
 		 263 aa  152  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5625  transposase  38.77 
 
 		 274 aa  152  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.426495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0064  IstB ATP binding domain-containing protein  33.06 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2922  IS21 family transposition helper protein  34.89 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2227  IS21 family transposition helper protein  34.89 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3339  IS21 family transposition helper protein  34.89 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0018  IS21 family transposition helper protein  34.89 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0341022  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0035  IS21 family transposition helper protein  34.89 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0995  IS21 family transposition helper protein  34.89 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0042  IS21 family transposition helper protein  34.89 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932139  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1622  IstB ATP binding domain-containing protein  33.06 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1226  IstB domain protein ATP-binding protein  36.55 
 
 		 245 aa  148  9e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1515  IstB domain protein ATP-binding protein  39.04 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4193  hypothetical protein  37.33 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.356635 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3176  ISAfe9, transposition helper protein  39.04 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2702  IstB domain protein ATP-binding protein  35.84 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.674415  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2775  IstB domain protein ATP-binding protein  39.04 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2400  IstB domain protein ATP-binding protein  39.04 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2027  IstB domain protein ATP-binding protein  39.04 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0289  IstB-like ATP-binding protein  33.47 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.241436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0645  IstB-like ATP-binding protein  33.47 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0663  IstB-like ATP-binding protein  33.47 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00126088  hitchhiker  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2240  IstB-like ATP-binding protein  33.47 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0212724 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1046  IstB ATP binding domain-containing protein  31.51 
 
 		 252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1004  IstB domain protein ATP-binding protein  33.61 
 
 		 272 aa  145  6e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.102956  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1025  IstB domain protein ATP-binding protein  33.62 
 
 		 280 aa  145  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.595202  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1787  putative transposase-associated ATP- binding protein  36.56 
 
 		 280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1025  transposase  34.06 
 
 		 262 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97029  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1590  transposase  34.06 
 
 		 262 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3161  transposase  34.06 
 
 		 262 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4925  transposase  34.06 
 
 		 262 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  normal  0.337311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2855  transposase  34.06 
 
 		 262 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1969  transposase  34.06 
 
 		 262 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0081  putative insertion sequence ATP-binding protein  36.12 
 
 		 272 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.35432 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2666  putative IS21 transposase-associated ATP- binding protein  36.12 
 
 		 272 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.568551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1946  putative transposase-associated ATP- binding protein  36.12 
 
 		 272 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382996  normal  0.0777522 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0211  transposition helper protein, IS21 family  30.29 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233513 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0682  IstB ATP binding domain-containing protein  35.11 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.566484  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2537  IstB-like ATP-binding protein  34.75 
 
 		 266 aa  143  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.626121  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0070  IstB domain protein ATP-binding protein  34.93 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.166344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1792  IstB domain protein ATP-binding protein  40.3 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2875  IstB ATP binding domain-containing protein  37.44 
 
 		 239 aa  143  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0650  IstB domain protein ATP-binding protein  40.3 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.499197 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03410  DNA replication protein  32.94 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.896278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1263  transposase/IS protein  36.32 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00267464  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2581  transposase  33.62 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272524  normal  0.0734737 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0604  IstB-like ATP-binding protein  36.56 
 
 		 277 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1001  IstB-like ATP-binding protein  36.56 
 
 		 277 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3060  IstB-like ATP-binding protein  36.56 
 
 		 277 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.509299  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4491  IstB-like ATP-binding protein  36.56 
 
 		 277 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.182494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>