More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4518 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4518  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 
263 aa  534  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3657  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 
263 aa  534  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.32372  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0424  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 
263 aa  534  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2531  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 
263 aa  534  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000490561  hitchhiker  0.00141169 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3669  IstB domain protein ATP-binding protein  88.21 
 
 
263 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0388523  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3016  IstB domain protein ATP-binding protein  79.77 
 
 
274 aa  417  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0222  IstB domain protein ATP-binding protein  79.77 
 
 
274 aa  417  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.923755  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1870  IstB domain protein ATP-binding protein  79.77 
 
 
274 aa  417  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3227  IstB domain protein ATP-binding protein  79.77 
 
 
274 aa  417  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0469  IstB ATP binding domain-containing protein  83.33 
 
 
272 aa  407  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0459  IstB ATP binding domain-containing protein  82.81 
 
 
272 aa  402  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.498177  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1779  IstB ATP binding domain-containing protein  82.88 
 
 
271 aa  402  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.330119  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3470  IstB domain protein ATP-binding protein  72.83 
 
 
259 aa  393  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000505364  hitchhiker  0.00163359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3046  IstB domain protein ATP-binding protein  72.83 
 
 
259 aa  393  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000101378  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2080  IstB domain protein ATP-binding protein  72.83 
 
 
259 aa  393  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00584299  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3265  IstB ATP binding domain-containing protein  59.91 
 
 
265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0499602  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5138  IstB ATP binding domain-containing protein  39.53 
 
 
255 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16967  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4957  IstB ATP binding domain-containing protein  39.53 
 
 
255 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4984  IstB ATP binding domain-containing protein  39.53 
 
 
255 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1500  IstB domain protein ATP-binding protein  38.87 
 
 
252 aa  171  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0247434  hitchhiker  0.000108884 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0708  IstB ATP binding domain-containing protein  41.71 
 
 
221 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1015  IstB domain protein ATP-binding protein  38.87 
 
 
252 aa  171  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.684278  normal  0.112434 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1176  IstB domain protein ATP-binding protein  38.87 
 
 
252 aa  171  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00428449  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0791  putative DNA replication factor  43.06 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2005  IstB-like ATP-binding protein  35.12 
 
 
252 aa  156  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00256513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2199  IstB-like ATP-binding protein  35.12 
 
 
252 aa  156  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2295  IstB-like ATP-binding protein  35.12 
 
 
252 aa  156  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2830  IstB-like ATP-binding protein  35.12 
 
 
252 aa  156  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2702  IstB domain protein ATP-binding protein  36.56 
 
 
267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.674415  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0604  IstB-like ATP-binding protein  37.89 
 
 
277 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1001  IstB-like ATP-binding protein  37.89 
 
 
277 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3060  IstB-like ATP-binding protein  37.89 
 
 
277 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.509299  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4491  IstB-like ATP-binding protein  37.89 
 
 
277 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.182494 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2666  IstB domain protein ATP-binding protein  38.49 
 
 
262 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0299  IstB ATP binding domain-containing protein  34.15 
 
 
259 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1004  IstB domain protein ATP-binding protein  34.02 
 
 
272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.102956  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5625  IstB ATP binding domain-containing protein  36.84 
 
 
266 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264731  normal  0.669883 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1705  IstB ATP binding domain-containing protein  36.84 
 
 
266 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1846  IstB ATP binding domain-containing protein  36.84 
 
 
266 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal  0.127228 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4193  hypothetical protein  36.44 
 
 
287 aa  148  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.356635 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0118  IstB domain protein ATP-binding protein  34.65 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1082  IstB domain protein ATP-binding protein  34.65 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0856572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1327  IstB domain protein ATP-binding protein  35.34 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1513  IstB domain protein ATP-binding protein  34.91 
 
 
259 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3692  IstB domain protein ATP-binding protein  34.91 
 
 
259 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3059  IstB domain protein ATP-binding protein  35.06 
 
 
259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1515  IstB domain protein ATP-binding protein  37.44 
 
 
275 aa  145  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2027  IstB domain protein ATP-binding protein  37.44 
 
 
275 aa  145  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2400  IstB domain protein ATP-binding protein  37.44 
 
 
275 aa  145  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2775  IstB domain protein ATP-binding protein  37.44 
 
 
275 aa  145  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0377  IstB domain protein ATP-binding protein  36.97 
 
 
262 aa  145  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2304  IstB domain protein ATP-binding protein  36.97 
 
 
262 aa  145  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3176  ISAfe9, transposition helper protein  37.44 
 
 
275 aa  145  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4914  IstB ATP binding domain-containing protein  35.81 
 
 
271 aa  145  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.297532 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1025  transposase  33.47 
 
 
262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97029  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1969  transposase  33.47 
 
 
262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3161  transposase  33.47 
 
 
262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1590  transposase  33.47 
 
 
262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4925  transposase  33.47 
 
 
262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  normal  0.337311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2855  transposase  33.47 
 
 
262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0682  IstB ATP binding domain-containing protein  35.11 
 
 
248 aa  145  8.000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.566484  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0137  IstB ATP binding domain-containing protein  32.48 
 
 
259 aa  145  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.784901  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2832  IstB ATP binding domain-containing protein  32.48 
 
 
259 aa  145  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443511  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7662  transposase/IS protein  35.17 
 
 
279 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3339  IS21 family transposition helper protein  33.33 
 
 
264 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0995  IS21 family transposition helper protein  33.33 
 
 
264 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0035  IS21 family transposition helper protein  33.33 
 
 
264 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2922  IS21 family transposition helper protein  33.33 
 
 
264 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5625  transposase  36.78 
 
 
274 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.426495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0196  transposase/IS protein  36.21 
 
 
278 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183611 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0018  IS21 family transposition helper protein  33.33 
 
 
264 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0341022  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0042  IS21 family transposition helper protein  33.33 
 
 
264 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932139  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2227  IS21 family transposition helper protein  33.33 
 
 
264 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703207  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1025  IstB domain protein ATP-binding protein  32.22 
 
 
280 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.595202  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5415  transposase  38.1 
 
 
269 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0289  IstB-like ATP-binding protein  33.61 
 
 
252 aa  142  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.241436  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0645  IstB-like ATP-binding protein  33.61 
 
 
252 aa  142  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0663  IstB-like ATP-binding protein  33.61 
 
 
252 aa  142  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00126088  hitchhiker  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2240  IstB-like ATP-binding protein  33.61 
 
 
252 aa  142  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0212724 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0013  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  34.43 
 
 
286 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.197955 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0100  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  34.43 
 
 
286 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.390043 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3234  IstB ATP binding domain-containing protein  37.32 
 
 
268 aa  142  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0081  putative insertion sequence ATP-binding protein  34.45 
 
 
272 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.35432 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2666  putative IS21 transposase-associated ATP- binding protein  34.45 
 
 
272 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.568551  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1946  putative transposase-associated ATP- binding protein  34.45 
 
 
272 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382996  normal  0.0777522 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1848  IstB domain protein ATP-binding protein  32.41 
 
 
263 aa  141  9e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2581  transposase  33.62 
 
 
262 aa  141  9e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272524  normal  0.0734737 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3402  IS21 family transposase  38.02 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2875  IstB ATP binding domain-containing protein  35.47 
 
 
239 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1638  IS21 family transposase  38.02 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0684  IS21 family transposase  38.02 
 
 
264 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3045  IS21 family transposase  38.02 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488044  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0134  IstB domain protein ATP-binding protein  32.41 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3510  IstB ATP binding domain-containing protein  36.61 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1644  DNA replication protein  37.05 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1658  DNA replication protein  37.05 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0787  IstB domain protein ATP-binding protein  34.48 
 
 
259 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0064  IstB ATP binding domain-containing protein  31.51 
 
 
270 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1787  putative transposase-associated ATP- binding protein  34.87 
 
 
280 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1622  IstB ATP binding domain-containing protein  31.51 
 
 
270 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>