More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3046 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2080  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 
259 aa  523  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00584299  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3046  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 
259 aa  523  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000101378  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3470  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 
259 aa  523  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000505364  hitchhiker  0.00163359 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3227  IstB domain protein ATP-binding protein  73.02 
 
 
274 aa  385  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0222  IstB domain protein ATP-binding protein  73.02 
 
 
274 aa  385  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.923755  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3016  IstB domain protein ATP-binding protein  73.02 
 
 
274 aa  385  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1870  IstB domain protein ATP-binding protein  73.02 
 
 
274 aa  385  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3669  IstB domain protein ATP-binding protein  75.1 
 
 
263 aa  382  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0388523  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3657  IstB domain protein ATP-binding protein  72.83 
 
 
263 aa  377  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.32372  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0424  IstB domain protein ATP-binding protein  72.83 
 
 
263 aa  377  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4518  IstB domain protein ATP-binding protein  72.83 
 
 
263 aa  377  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2531  IstB domain protein ATP-binding protein  72.83 
 
 
263 aa  377  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000490561  hitchhiker  0.00141169 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1779  IstB ATP binding domain-containing protein  77.51 
 
 
271 aa  362  3e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.330119  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0459  IstB ATP binding domain-containing protein  76.71 
 
 
272 aa  358  6e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.498177  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0469  IstB ATP binding domain-containing protein  75.59 
 
 
272 aa  358  6e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3265  IstB ATP binding domain-containing protein  58.59 
 
 
265 aa  266  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0499602  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5138  IstB ATP binding domain-containing protein  39.29 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16967  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4957  IstB ATP binding domain-containing protein  39.29 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4984  IstB ATP binding domain-containing protein  39.29 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1500  IstB domain protein ATP-binding protein  44.02 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0247434  hitchhiker  0.000108884 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1015  IstB domain protein ATP-binding protein  44.02 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.684278  normal  0.112434 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1176  IstB domain protein ATP-binding protein  44.02 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00428449  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0791  putative DNA replication factor  43.59 
 
 
255 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0708  IstB ATP binding domain-containing protein  39.63 
 
 
221 aa  166  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1004  IstB domain protein ATP-binding protein  35.29 
 
 
272 aa  161  8.000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.102956  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4914  IstB ATP binding domain-containing protein  37.7 
 
 
271 aa  159  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.297532 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0682  IstB ATP binding domain-containing protein  36.96 
 
 
248 aa  158  7e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.566484  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3059  IstB domain protein ATP-binding protein  36.14 
 
 
259 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1327  IstB domain protein ATP-binding protein  37.34 
 
 
259 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1513  IstB domain protein ATP-binding protein  36.91 
 
 
259 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3692  IstB domain protein ATP-binding protein  36.91 
 
 
259 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0137  IstB ATP binding domain-containing protein  34.62 
 
 
259 aa  155  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.784901  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2832  IstB ATP binding domain-containing protein  34.62 
 
 
259 aa  155  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443511  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0289  IstB-like ATP-binding protein  36.02 
 
 
252 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.241436  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0645  IstB-like ATP-binding protein  36.02 
 
 
252 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0663  IstB-like ATP-binding protein  36.02 
 
 
252 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00126088  hitchhiker  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2240  IstB-like ATP-binding protein  36.02 
 
 
252 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0212724 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5625  IstB ATP binding domain-containing protein  35.89 
 
 
266 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264731  normal  0.669883 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1705  IstB ATP binding domain-containing protein  35.89 
 
 
266 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1846  IstB ATP binding domain-containing protein  35.89 
 
 
266 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal  0.127228 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0196  transposase/IS protein  38.66 
 
 
278 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183611 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7662  transposase/IS protein  38.24 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2005  IstB-like ATP-binding protein  33.33 
 
 
252 aa  152  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00256513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2199  IstB-like ATP-binding protein  33.33 
 
 
252 aa  152  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2295  IstB-like ATP-binding protein  33.33 
 
 
252 aa  152  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2830  IstB-like ATP-binding protein  33.33 
 
 
252 aa  152  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0248  transposase/IS protein  36.13 
 
 
281 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2334  transposase/IS protein  36.13 
 
 
281 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0665572 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0452  transposase/IS protein  36.13 
 
 
281 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.97098  normal  0.300732 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0953  transposase/IS protein  36.13 
 
 
281 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.94129  normal  0.0557265 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1263  transposase/IS protein  36.4 
 
 
268 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00267464  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0377  IstB domain protein ATP-binding protein  37.76 
 
 
262 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2304  IstB domain protein ATP-binding protein  37.76 
 
 
262 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2875  IstB ATP binding domain-containing protein  35.17 
 
 
239 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0118  IstB domain protein ATP-binding protein  35.24 
 
 
258 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1082  IstB domain protein ATP-binding protein  35.24 
 
 
258 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0856572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0787  IstB domain protein ATP-binding protein  35.93 
 
 
259 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2666  IstB domain protein ATP-binding protein  37.39 
 
 
262 aa  149  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0013  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  36.03 
 
 
286 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.197955 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0100  putative insertion sequence IS21-like; putative ATP-binding protein  36.03 
 
 
286 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.390043 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1644  DNA replication protein  37.12 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1658  DNA replication protein  37.12 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5625  transposase  37.44 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.426495 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0042  IS21 family transposition helper protein  35.94 
 
 
264 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932139  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0018  IS21 family transposition helper protein  35.94 
 
 
264 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0341022  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4193  hypothetical protein  35.32 
 
 
287 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.356635 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2922  IS21 family transposition helper protein  35.94 
 
 
264 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0995  IS21 family transposition helper protein  35.94 
 
 
264 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2227  IS21 family transposition helper protein  35.94 
 
 
264 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3339  IS21 family transposition helper protein  35.94 
 
 
264 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0035  IS21 family transposition helper protein  35.94 
 
 
264 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3161  transposase  32.93 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2855  transposase  32.93 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1590  transposase  32.93 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4925  transposase  32.93 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  normal  0.337311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1969  transposase  32.93 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1025  transposase  32.93 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97029  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2581  transposase  32.93 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272524  normal  0.0734737 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1848  IstB domain protein ATP-binding protein  33.18 
 
 
263 aa  144  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0134  IstB domain protein ATP-binding protein  32.19 
 
 
252 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0023  hypothetical protein  35.54 
 
 
240 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.49121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0484  hypothetical protein  35.54 
 
 
240 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1289  hypothetical protein  35.54 
 
 
240 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2205  hypothetical protein  35.54 
 
 
240 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2219  hypothetical protein  35.54 
 
 
240 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.571769  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0025  IstB ATP binding domain-containing protein  35.37 
 
 
246 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1297  IstB ATP binding domain-containing protein  35.37 
 
 
246 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2217  IstB ATP binding domain-containing protein  35.37 
 
 
246 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0064  IstB ATP binding domain-containing protein  32.37 
 
 
270 aa  143  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0081  putative insertion sequence ATP-binding protein  35.68 
 
 
272 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.35432 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2666  putative IS21 transposase-associated ATP- binding protein  35.68 
 
 
272 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.568551  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1946  putative transposase-associated ATP- binding protein  35.68 
 
 
272 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382996  normal  0.0777522 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1622  IstB ATP binding domain-containing protein  32.37 
 
 
270 aa  143  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1787  putative transposase-associated ATP- binding protein  36.12 
 
 
280 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2908  transposase/IS protein  35.9 
 
 
257 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0541014  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3406  transposase/IS protein  35.9 
 
 
257 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2071  IstB-like ATP-binding protein  47.95 
 
 
162 aa  140  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.941019  normal  0.145342 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0604  IstB-like ATP-binding protein  35.24 
 
 
277 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1001  IstB-like ATP-binding protein  35.24 
 
 
277 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3060  IstB-like ATP-binding protein  35.24 
 
 
277 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.509299  normal  0.0540885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>