More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0152 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  100 
 
 
310 aa  624  1e-178  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  93.87 
 
 
310 aa  597  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  93.87 
 
 
310 aa  597  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  68.87 
 
 
307 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  70.03 
 
 
308 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  70.59 
 
 
308 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  69.87 
 
 
307 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  69.21 
 
 
307 aa  394  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  69.21 
 
 
307 aa  394  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  69.21 
 
 
307 aa  394  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  69.21 
 
 
307 aa  394  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  69.21 
 
 
307 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  69.54 
 
 
307 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  68.87 
 
 
307 aa  391  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  68.87 
 
 
307 aa  393  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  68.54 
 
 
307 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  65.42 
 
 
312 aa  386  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  64.41 
 
 
312 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  62 
 
 
307 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  65.12 
 
 
306 aa  362  3e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  61.33 
 
 
307 aa  360  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  62 
 
 
307 aa  360  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  62.3 
 
 
307 aa  359  3e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  60.2 
 
 
306 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  60.13 
 
 
310 aa  344  1e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0334  cysteine synthase A  61.11 
 
 
308 aa  338  7e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  60.13 
 
 
308 aa  338  9e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  59.93 
 
 
311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  59.8 
 
 
310 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  58.05 
 
 
321 aa  335  5.999999999999999e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  56 
 
 
301 aa  334  1e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  60.73 
 
 
310 aa  333  2e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  60.33 
 
 
310 aa  333  3e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0404  cysteine synthase  60.6 
 
 
308 aa  332  4e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  59.87 
 
 
305 aa  331  7.000000000000001e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  61.18 
 
 
309 aa  331  8e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1438  cysteine synthase A  58.53 
 
 
305 aa  331  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.412307  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  54.33 
 
 
304 aa  330  2e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  53.77 
 
 
306 aa  330  2e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1697  cysteine synthase A  58.22 
 
 
305 aa  329  3e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1831  cysteine synthase A  58.22 
 
 
305 aa  329  3e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1691  cysteine synthase A  58.22 
 
 
305 aa  329  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  62.5 
 
 
309 aa  329  3e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1678  cysteine synthase A  58.22 
 
 
305 aa  329  4e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.423565  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1653  cysteine synthase A  57.89 
 
 
305 aa  329  4e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1875  cysteine synthase A  58.22 
 
 
305 aa  329  4e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101872 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  59.33 
 
 
308 aa  328  5.0000000000000004e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  62.17 
 
 
309 aa  328  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  58.82 
 
 
317 aa  328  7e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  59.8 
 
 
309 aa  328  8e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1954  cysteine synthase A  57.57 
 
 
305 aa  328  8e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1837  cysteine synthase A  57.89 
 
 
305 aa  328  9e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1919  cysteine synthase A  57.57 
 
 
305 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468327  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  57.67 
 
 
309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  59.74 
 
 
310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3506  cysteine synthase A  57.57 
 
 
305 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0537  cysteine synthase  59.93 
 
 
321 aa  326  3e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00106309  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  58.69 
 
 
317 aa  325  5e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  59.74 
 
 
306 aa  325  5e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  57.95 
 
 
309 aa  325  6e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  57.62 
 
 
309 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  55.08 
 
 
323 aa  323  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  57.62 
 
 
309 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  56.33 
 
 
309 aa  322  4e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  58.8 
 
 
311 aa  322  6e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  54.15 
 
 
306 aa  322  6e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  59.33 
 
 
308 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  56.67 
 
 
311 aa  321  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  52.16 
 
 
315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  58.78 
 
 
308 aa  319  3e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  55.96 
 
 
318 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  60.07 
 
 
309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  52.63 
 
 
311 aa  318  6e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  58.36 
 
 
327 aa  318  7e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  53.8 
 
 
304 aa  318  7e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  57.89 
 
 
320 aa  318  7.999999999999999e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  54.67 
 
 
307 aa  318  9e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  60.67 
 
 
309 aa  317  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  57.14 
 
 
311 aa  317  1e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  57.79 
 
 
309 aa  317  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  56.15 
 
 
309 aa  317  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  56.11 
 
 
311 aa  316  4e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  56.95 
 
 
308 aa  315  4e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  51.49 
 
 
307 aa  315  5e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  56.44 
 
 
311 aa  315  7e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  57.19 
 
 
302 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  55.37 
 
 
309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  57 
 
 
308 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  53.36 
 
 
305 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  57.19 
 
 
309 aa  312  3.9999999999999997e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  57.76 
 
 
309 aa  312  3.9999999999999997e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  50.99 
 
 
303 aa  312  4.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  56.67 
 
 
310 aa  311  6.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  54.36 
 
 
305 aa  311  7.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  57.84 
 
 
309 aa  311  7.999999999999999e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  54.73 
 
 
307 aa  311  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1091  cysteine synthase  56.71 
 
 
303 aa  311  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000826995  decreased coverage  0.00308217 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  53.51 
 
 
305 aa  310  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  55.92 
 
 
308 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  57.43 
 
 
309 aa  309  2.9999999999999997e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>