43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG2063 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  100 
 
 
630 aa  1241    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  68.99 
 
 
926 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  62.5 
 
 
423 aa  195  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  64.34 
 
 
489 aa  157  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  65.29 
 
 
484 aa  141  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3298  flagellar hook-length control protein  34.05 
 
 
602 aa  141  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  47.75 
 
 
928 aa  105  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  66.67 
 
 
444 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  30.77 
 
 
267 aa  101  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  42.25 
 
 
3521 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  38.99 
 
 
3409 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  40.24 
 
 
3472 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  40.24 
 
 
3471 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  27.66 
 
 
522 aa  64.3  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.09 
 
 
261 aa  63.9  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  40.86 
 
 
499 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  41.94 
 
 
407 aa  57.4  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0454  hypothetical protein  35.57 
 
 
744 aa  57.4  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.110382  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  50 
 
 
332 aa  55.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  45.24 
 
 
1261 aa  54.7  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3267  hypothetical protein  28.92 
 
 
537 aa  54.3  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51761  predicted protein  35.29 
 
 
136 aa  52  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.935673  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4829  hypothetical protein  36.89 
 
 
5185 aa  51.6  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.27186 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0079  surface layer protein  73.33 
 
 
404 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  2.3790999999999998e-28  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  28.66 
 
 
1000 aa  48.9  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3786  outer membrane autotransporter  28.35 
 
 
573 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.968521 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  21.84 
 
 
1240 aa  48.5  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1357  hypothetical protein  21.58 
 
 
784 aa  48.5  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4683  ribonuclease III  41.11 
 
 
368 aa  48.5  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636266  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  24.6 
 
 
1567 aa  47.8  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2790  RNA pseudouridine synthase  45.31 
 
 
322 aa  47.4  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525633  normal  0.683012 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2967  hypothetical protein  35.71 
 
 
440 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000478189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2756  hypothetical protein  35.71 
 
 
440 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00725843  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3347  hypothetical protein  27.47 
 
 
941 aa  46.6  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0359  DNA repair protein  39.39 
 
 
776 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.896103 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  34.26 
 
 
897 aa  46.2  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5683  ABC transporter related  39.62 
 
 
475 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  27.43 
 
 
830 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  55.93 
 
 
279 aa  46.6  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0144  virulence-associated E family protein  37.04 
 
 
812 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856396 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  36.17 
 
 
2353 aa  45.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3046  cell wall anchor domain-containing protein  46.77 
 
 
598 aa  44.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.635114  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46569  predicted protein  26.47 
 
 
818 aa  43.9  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.61135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>