44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0454 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0454  hypothetical protein  100 
 
 		 744 aa  1436    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.110382  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  38.15 
 
 		 630 aa  69.7  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  35.85 
 
 		 926 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  30.29 
 
 		 423 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1562  NlpC/P60 family protein  48.33 
 
 		 553 aa  61.2  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000246871  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  37.31 
 
 		 575 aa  55.5  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0640  peptidase M23B  35.71 
 
 		 386 aa  54.7  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000535366  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1353  NLP/P60 family protein, enterotoxin  46.67 
 
 		 549 aa  54.7  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.185421  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  29.95 
 
 		 489 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  37.33 
 
 		 370 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 424 aa  53.9  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5083  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, N-terminus  36.92 
 
 		 131 aa  52.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1245  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  47.06 
 
 		 969 aa  52.4  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0232944  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1439  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  27.96 
 
 		 1049 aa  52.4  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00896108  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4552  peptidase, M23/M37 family  32 
 
 		 384 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000312233  normal  0.0469454 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0801  peptidase, M23/M37 family  37.97 
 
 		 386 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70657e-48 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  31.88 
 
 		 578 aa  50.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0779  peptidase, M23/M37 family  35.44 
 
 		 384 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0000701566  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  36.92 
 
 		 598 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  30.16 
 
 		 484 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  36.56 
 
 		 296 aa  50.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.92 
 
 		 580 aa  50.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  36.92 
 
 		 579 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  37.97 
 
 		 386 aa  49.7  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.2041900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.16 
 
 		 553 aa  49.3  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3298  flagellar hook-length control protein  22.16 
 
 		 602 aa  49.3  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0794  M24/M37 family peptidase  37.97 
 
 		 384 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000011526  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  31.88 
 
 		 577 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0634  peptidase NLP/P60 /M23/M37 peptidase domain-containing protein  37.97 
 
 		 386 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000528425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  25.73 
 
 		 582 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.67 
 
 		 1776 aa  48.5  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0876  peptidase, M23/M37 family  37.97 
 
 		 386 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0001  bacteriocin  41.38 
 
 		 879 aa  48.5  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4829  hypothetical protein  28.04 
 
 		 5185 aa  48.1  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27186 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  36.51 
 
 		 582 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  38.3 
 
 		 582 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0610  peptidase M23B  36.71 
 
 		 383 aa  46.6  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000136568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  38.46 
 
 		 341 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0006  bacteriocin  36.67 
 
 		 1067 aa  45.4  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0724  M23/37 family peptidase  36.71 
 
 		 386 aa  44.7  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000754893  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0690  M24/M37 family peptidase  36.71 
 
 		 386 aa  44.7  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000234103  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0263  peptidase, M23/M37 family  40 
 
 		 603 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0203  enterotoxin, putative  40 
 
 		 603 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3187  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  21.38 
 
 		 474 aa  44.3  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>