More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0039 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0039  N-acetylneuraminate lyase, putative  100 
 
 
305 aa  629  1e-179  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1047  N-acetylneuraminate lyase  44.48 
 
 
309 aa  258  1e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3602  N-acetylneuraminate lyase  33.67 
 
 
297 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3699  N-acetylneuraminate lyase  33.67 
 
 
297 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3637  N-acetylneuraminate lyase  33.67 
 
 
297 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3530  N-acetylneuraminate lyase  33.67 
 
 
297 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.224809  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3532  N-acetylneuraminate lyase  33.33 
 
 
297 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3661  N-acetylneuraminate lyase  31.74 
 
 
297 aa  152  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.529009  normal  0.169481 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3551  N-acetylneuraminate lyase  31.76 
 
 
297 aa  151  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03036  hypothetical protein  31.76 
 
 
297 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03085  N-acetylneuraminate lyase  31.76 
 
 
297 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3707  N-acetylneuraminate lyase  31.76 
 
 
297 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0487465  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0481  N-acetylneuraminate lyase  31.76 
 
 
297 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.556937 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0481  N-acetylneuraminate lyase  31.76 
 
 
297 aa  151  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3413  N-acetylneuraminate lyase  31.76 
 
 
297 aa  151  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0759607  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4542  N-acetylneuraminate lyase  31.76 
 
 
297 aa  151  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3520  N-acetylneuraminate lyase  31.42 
 
 
297 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0303093  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3832  N-acetylneuraminate lyase  31.49 
 
 
302 aa  133  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217271  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0178  N-acetylneuraminate lyase  30.47 
 
 
288 aa  131  1e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0175  N-acetylneuraminate lyase  30.34 
 
 
288 aa  132  1e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2156  dihydrodipicolinate synthetase  27.12 
 
 
298 aa  125  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.157479  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0695  N-acetylneuraminate lyase  29.63 
 
 
292 aa  124  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  29.27 
 
 
298 aa  116  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2213  N-acetylneuraminate lyase  26.58 
 
 
308 aa  116  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  29.51 
 
 
293 aa  115  1e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0415  N-acetylneuraminate lyase  29.89 
 
 
295 aa  113  5e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.275578  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1620  dihydrodipicolinate synthetase  29.75 
 
 
297 aa  112  8e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  28.92 
 
 
298 aa  111  1e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  29.33 
 
 
298 aa  111  1e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  29.33 
 
 
298 aa  111  1e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64796e-05 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  29.33 
 
 
298 aa  111  1e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  28.87 
 
 
301 aa  111  2e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  28.98 
 
 
298 aa  110  2e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  28.92 
 
 
298 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 
298 aa  109  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  28.15 
 
 
298 aa  108  9e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2776  putative N-acetylneuraminate lyase  27.74 
 
 
297 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216717 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1400  dihydrodipicolinate synthetase  27.74 
 
 
297 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.13834  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1293  putative N-acetylneuraminate lyase  27.74 
 
 
297 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.519377  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0646  dihydrodipicolinate synthetase  25.09 
 
 
294 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 
298 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2548  Dihydrodipicolinate synthase  27.64 
 
 
371 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  28.76 
 
 
293 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  27.24 
 
 
305 aa  105  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0689  dihydrodipicolinate synthetase  25.35 
 
 
294 aa  105  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148381  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  27.52 
 
 
292 aa  105  8e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  26.48 
 
 
294 aa  105  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  27.9 
 
 
293 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2063  N-acetylneuraminate lyase  27.87 
 
 
307 aa  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  5.71385e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0305  N-acetylneuraminate lyase  26.03 
 
 
293 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  25.09 
 
 
313 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0298  N-acetylneuraminate lyase  26.03 
 
 
293 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  27.9 
 
 
293 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  25 
 
 
298 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  24.82 
 
 
290 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.6647e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  24.24 
 
 
301 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  3.02619e-06 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0090  Dihydrodipicolinate synthase  29.78 
 
 
289 aa  102  9e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  25.86 
 
 
303 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0899  dihydropicolinate synthase  27.3 
 
 
297 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.442458  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09012  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02270)  28.67 
 
 
298 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  23.73 
 
 
298 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  24.58 
 
 
300 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  24.58 
 
 
300 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  24.58 
 
 
300 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4841  dihydrodipicolinate synthase  28.33 
 
 
292 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00571792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1522  dihydrodipicolinate synthetase  25.9 
 
 
301 aa  100  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  27.36 
 
 
295 aa  99.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  26.97 
 
 
292 aa  99.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  27.36 
 
 
290 aa  99.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  23.91 
 
 
300 aa  99  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  23.91 
 
 
300 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  23.91 
 
 
300 aa  99  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  23.91 
 
 
300 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  23.91 
 
 
300 aa  99  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  23.91 
 
 
300 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  23.91 
 
 
300 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  22.97 
 
 
298 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3538  dihydrodipicolinate synthetase  25.62 
 
 
294 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.423247  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  22.97 
 
 
298 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3709  dihydrodipicolinate synthetase  25.62 
 
 
294 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.646628  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  23.79 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  27.9 
 
 
305 aa  98.2  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  28.21 
 
 
294 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  23.53 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  23.91 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  27.36 
 
 
290 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  27.36 
 
 
296 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  23.31 
 
 
298 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  26.33 
 
 
300 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  23.96 
 
 
291 aa  96.3  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  26.55 
 
 
326 aa  96.7  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  25.42 
 
 
297 aa  96.3  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  23.57 
 
 
301 aa  95.9  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  1.82643e-07 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  25.34 
 
 
291 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  23.57 
 
 
301 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1759  dihydrodipicolinate synthetase  25.68 
 
 
291 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0300118  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  26.94 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  26.1 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3902  dihydrodipicolinate synthetase  23.65 
 
 
301 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2643  dihydrodipicolinate synthase  22.89 
 
 
316 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.445991  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>