More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2973 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2973  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
416 aa  849    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5908  glycosyl transferase group 1  56.97 
 
 
410 aa  478  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3082  glycosyl transferase, group 1  52.28 
 
 
474 aa  418  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1718  glycosyl transferase group 1  47.12 
 
 
433 aa  380  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0528  glycosyl transferase, group 1  45.57 
 
 
406 aa  354  1e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000105595  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0542  glycosyl transferase group 1  45.57 
 
 
406 aa  353  2e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000128948  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0594  glycosyl transferase, group 1  48.84 
 
 
401 aa  339  5e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0797  glycosyl transferase, group 1  46.5 
 
 
408 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0451  glycosyl transferase group 1  42.2 
 
 
406 aa  335  9e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.340856  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1359  glycosyl transferase, group 1  48.2 
 
 
402 aa  333  3e-90  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.254886 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1821  glycosyl transferase, group 1  40.92 
 
 
403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0709671  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2083  glycosyl transferase, group 1  42.61 
 
 
411 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1740  glycosyl transferase group 1  42.61 
 
 
411 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163685 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1763  glycosyl transferase, group 1  42.13 
 
 
419 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.410209  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0419  glycosyl transferase group 1  42.63 
 
 
413 aa  312  6.999999999999999e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.102155  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2348  glycosyl transferase, group 1  43.18 
 
 
411 aa  310  5e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0363579  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3111  trehalose phosphorylase/synthase  43.1 
 
 
420 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0129  glycosyl transferase, group 1  43.22 
 
 
397 aa  306  3e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.730138  hitchhiker  0.000955625 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3832  glycosyl transferase group 1  39.6 
 
 
417 aa  306  5.0000000000000004e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672883  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0297  glycosyl transferase group 1  42.22 
 
 
411 aa  305  7e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1592  glycosyl transferase, group 1  40.69 
 
 
414 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0955331  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2023  glycosyl transferase, group 1  41.52 
 
 
442 aa  280  4e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1812  glycosyl transferase, group 1  39.95 
 
 
407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0100815  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1192  glycosyl transferase, group 1  39.36 
 
 
410 aa  269  8e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0427  glycosyl transferase group 1  37.29 
 
 
460 aa  255  9e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.049978  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1550  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
398 aa  207  3e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.267317  hitchhiker  0.0000000000000568319 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4094  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 
509 aa  168  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108712  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3637  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
497 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.564588 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04480  trehalose synthase, putative  27.87 
 
 
734 aa  117  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05021  trehalose synthase (Ccg-9), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12100)  25.99 
 
 
705 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0567  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
437 aa  71.2  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.923327  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
377 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.12 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3596  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
393 aa  67  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.12 
 
 
381 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  28.12 
 
 
381 aa  66.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  28.12 
 
 
381 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  28.12 
 
 
381 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.12 
 
 
381 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.12 
 
 
381 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.12 
 
 
381 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
374 aa  64.7  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
381 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  27.07 
 
 
375 aa  63.5  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.6 
 
 
381 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  32.68 
 
 
395 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  26.52 
 
 
375 aa  61.6  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
409 aa  61.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 
421 aa  60.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
394 aa  60.5  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 
381 aa  60.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 
398 aa  60.1  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
387 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
387 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
421 aa  60.1  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  32.46 
 
 
371 aa  59.7  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 
383 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
424 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
399 aa  58.9  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 
378 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
403 aa  58.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
386 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
419 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  27.4 
 
 
404 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
395 aa  58.2  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  31.72 
 
 
388 aa  58.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
387 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
453 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.32 
 
 
407 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  30.17 
 
 
415 aa  57.4  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  32.2 
 
 
411 aa  57  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
382 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1028  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.55 
 
 
380 aa  57  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
384 aa  57  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1092  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 
381 aa  57  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  23.44 
 
 
375 aa  57  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  26 
 
 
366 aa  56.6  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.48 
 
 
367 aa  55.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1590  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 
468 aa  55.8  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00816719  decreased coverage  0.0063014 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  31.47 
 
 
386 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
378 aa  55.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
382 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 
380 aa  55.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2529  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 
487 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0220634  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  35.51 
 
 
416 aa  55.1  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
374 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  39.29 
 
 
378 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  28.1 
 
 
382 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
378 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 
400 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  25 
 
 
404 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2100  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 
400 aa  54.7  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0507  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
424 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015181 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
355 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
748 aa  54.3  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4854  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  25.84 
 
 
362 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  23.08 
 
 
383 aa  53.9  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  28.29 
 
 
382 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>