More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0135 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
265 aa  523  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  46.91 
 
 
248 aa  203  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  41.7 
 
 
266 aa  195  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 
264 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  45.27 
 
 
237 aa  182  5.0000000000000004e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  38.61 
 
 
266 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  40.08 
 
 
263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  39.69 
 
 
263 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  43.13 
 
 
265 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  32.95 
 
 
283 aa  177  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  39.77 
 
 
280 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  37.84 
 
 
266 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  38.17 
 
 
263 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  41.96 
 
 
255 aa  170  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  40.08 
 
 
263 aa  168  6e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  35.14 
 
 
264 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  38.82 
 
 
263 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  37.4 
 
 
264 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  33.6 
 
 
277 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  34.36 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  37.22 
 
 
264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  38.4 
 
 
265 aa  161  8.000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  38.37 
 
 
263 aa  156  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  38.28 
 
 
263 aa  155  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  40.76 
 
 
259 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  38.93 
 
 
262 aa  151  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  37.15 
 
 
263 aa  150  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 
262 aa  149  5e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  34.11 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1087  alpha/beta hydrolase fold protein  39.33 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0523898  normal  0.954451 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  39.37 
 
 
254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1989  alpha/beta hydrolase fold  41.53 
 
 
235 aa  138  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.512291  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6107  alpha/beta hydrolase fold protein  38.84 
 
 
231 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 
261 aa  126  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  36.07 
 
 
261 aa  122  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1326  alpha/beta hydrolase fold protein  33.73 
 
 
279 aa  122  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1735  alpha/beta hydrolase fold protein  35.74 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  29.39 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3108  alpha/beta hydrolase fold protein  37.4 
 
 
248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962894  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
263 aa  116  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10250  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.85 
 
 
289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 
300 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  27.59 
 
 
261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  34.71 
 
 
260 aa  112  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  32.81 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  32.52 
 
 
392 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2426  alpha/beta hydrolase fold protein  31.09 
 
 
267 aa  108  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  32.58 
 
 
275 aa  108  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  32.1 
 
 
263 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0986  prolyl aminopeptidase  31.06 
 
 
285 aa  107  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 
277 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  32.33 
 
 
292 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  31.23 
 
 
262 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 
279 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  32.82 
 
 
268 aa  105  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  34.43 
 
 
425 aa  105  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  31.84 
 
 
258 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  30.68 
 
 
277 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  29.28 
 
 
265 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 
273 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
279 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  30.42 
 
 
265 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
273 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  32.1 
 
 
260 aa  102  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  30.23 
 
 
264 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 
266 aa  102  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  26.69 
 
 
270 aa  102  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  31.23 
 
 
275 aa  102  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 
275 aa  102  9e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  29.69 
 
 
263 aa  102  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  31.4 
 
 
279 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  33.05 
 
 
265 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  31.44 
 
 
277 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  30.86 
 
 
271 aa  101  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
270 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  28.29 
 
 
275 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  31.25 
 
 
270 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 
282 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  27.91 
 
 
269 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 
272 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  32.66 
 
 
282 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  34.9 
 
 
271 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  28.96 
 
 
261 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  30.7 
 
 
266 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0162  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  33.21 
 
 
274 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  29.23 
 
 
269 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
270 aa  99.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 
279 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 
261 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  35.11 
 
 
233 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 
268 aa  99  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  25.94 
 
 
270 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  30 
 
 
264 aa  98.6  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  25.94 
 
 
270 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0031  Alpha/beta hydrolase fold  34.2 
 
 
274 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  26.69 
 
 
270 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
277 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  34.34 
 
 
265 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>