More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2859 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5405  excinuclease ABC, C subunit  56.21 
 
 		 688 aa  733    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  95.18 
 
 		 623 aa  1226    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1362  excinuclease ABC subunit C  54.74 
 
 		 704 aa  687    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2878  excinuclease ABC, C subunit  55.18 
 
 		 682 aa  735    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4277  excinuclease ABC subunit C  59.65 
 
 		 634 aa  746    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.471865 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 623 aa  1281    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0699  excinuclease ABC subunit C  60 
 
 		 690 aa  762    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0420  excinuclease ABC subunit C  57.52 
 
 		 620 aa  704    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000882939  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1712  excinuclease ABC, C subunit  57.89 
 
 		 692 aa  725    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2526  excinuclease ABC subunit C  56.56 
 
 		 666 aa  690    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0644  excinuclease ABC subunit C  81.12 
 
 		 631 aa  1032    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  95.18 
 
 		 623 aa  1228    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1086  excinuclease ABC subunit C  58.59 
 
 		 680 aa  758    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000501867 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2276  excinuclease ABC, C subunit  60.42 
 
 		 644 aa  780    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2652  excinuclease ABC, C subunit  57.17 
 
 		 668 aa  709    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2589  excinuclease ABC subunit C  60.74 
 
 		 691 aa  780    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0718587  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1434  excinuclease ABC, C subunit  55.85 
 
 		 679 aa  704    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2220  excinuclease ABC subunit C  60.07 
 
 		 639 aa  748    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0021269  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1177  excinuclease ABC subunit C  55.54 
 
 		 695 aa  705    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.8668  normal  0.100977 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1060  excinuclease ABC subunit C  55.07 
 
 		 658 aa  680    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41739  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3919  excinuclease ABC subunit C  76.92 
 
 		 631 aa  986    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0901  excinuclease ABC subunit C  56.46 
 
 		 699 aa  716    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.686054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1281  excinuclease ABC subunit C  55.38 
 
 		 695 aa  702    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280524  normal  0.136737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3146  excinuclease ABC subunit C  56.87 
 
 		 690 aa  702    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.055346  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4491  excinuclease ABC subunit C  57.95 
 
 		 642 aa  726    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.191027 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  72.09 
 
 		 635 aa  927    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1082  excinuclease ABC subunit C  56.13 
 
 		 644 aa  721    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1558  excinuclease ABC subunit C  58.95 
 
 		 690 aa  757    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3104  excinuclease ABC, C subunit  55.18 
 
 		 682 aa  735    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.299342  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0046  excinuclease ABC subunit C  55.79 
 
 		 629 aa  675    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.714841  hitchhiker  0.00962006 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1975  excinuclease ABC subunit C  61.86 
 
 		 653 aa  798    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1728  excinuclease ABC subunit C  54.98 
 
 		 688 aa  679    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415792 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0690  excinuclease ABC subunit C  60.16 
 
 		 690 aa  764    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.485523  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0772  excinuclease ABC subunit C  59.9 
 
 		 633 aa  738    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00962744  normal  0.347624 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0516  excinuclease ABC subunit C  53.18 
 
 		 658 aa  706    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0782  excinuclease ABC subunit C  60.9 
 
 		 674 aa  774    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191761  normal  0.0714693 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1232  excinuclease ABC subunit C  58.59 
 
 		 680 aa  753    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3713  excinuclease ABC, C subunit  56.84 
 
 		 668 aa  708    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2312  excinuclease ABC subunit C  79.23 
 
 		 623 aa  992    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.136814 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3001  excinuclease ABC, C subunit  55.01 
 
 		 700 aa  733    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2344  excinuclease ABC, C subunit  61.74 
 
 		 779 aa  587  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.77277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  47.19 
 
 		 607 aa  526  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  47.51 
 
 		 609 aa  524  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  45.44 
 
 		 613 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  45.51 
 
 		 611 aa  515  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  45.56 
 
 		 617 aa  516  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  43.64 
 
 		 599 aa  499  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  43.23 
 
 		 607 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  43.47 
 
 		 626 aa  486  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  42.41 
 
 		 608 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0853  excinuclease ABC, C subunit  43.52 
 
 		 608 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  41.68 
 
 		 607 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  41.91 
 
 		 607 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  42.41 
 
 		 608 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0979  excinuclease ABC, C subunit  43.52 
 
 		 623 aa  478  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0363417 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  41.32 
 
 		 607 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  42.43 
 
 		 599 aa  477  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25040  excinuclease ABC subunit C  42.24 
 
 		 607 aa  474  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  40.83 
 
 		 607 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  40.99 
 
 		 607 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  40.99 
 
 		 607 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  40.13 
 
 		 613 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2698  excinuclease ABC subunit C  41.3 
 
 		 618 aa  466  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  42.69 
 
 		 619 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1803  excinuclease ABC, C subunit  42.18 
 
 		 657 aa  462  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0340936  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2570  excinuclease ABC subunit C  41.14 
 
 		 618 aa  464  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0154  excinuclease ABC subunit C  41.32 
 
 		 605 aa  461  9.999999999999999e-129  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.168899  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  40.1 
 
 		 612 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1403  excinuclease ABC subunit C  43.74 
 
 		 614 aa  461  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.252536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  42.24 
 
 		 603 aa  457  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3671  excinuclease ABC subunit C  40.88 
 
 		 585 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159711  hitchhiker  0.0000000375345 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0701  excinuclease ABC subunit C  43.62 
 
 		 598 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1071  excinuclease ABC subunit C  41.1 
 
 		 654 aa  451  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000538512  normal  0.216036 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2454  excinuclease ABC subunit C  40.1 
 
 		 609 aa  450  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.263996  normal  0.543932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0936  excinuclease ABC subunit C  40.66 
 
 		 657 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.581594  normal  0.110547 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1271  excinuclease ABC subunit C  41.26 
 
 		 606 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2151  excinuclease ABC subunit C  39.05 
 
 		 609 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.054241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2410  excinuclease ABC subunit C  41.24 
 
 		 673 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.308713  hitchhiker  0.000953685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1001  excinuclease ABC subunit C  40.35 
 
 		 657 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3241  excinuclease ABC, C subunit  39.74 
 
 		 607 aa  445  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0161382  hitchhiker  0.00210477 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2306  excinuclease ABC subunit C  41.3 
 
 		 605 aa  444  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.391453  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  39.6 
 
 		 604 aa  444  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1608  excinuclease ABC subunit C  39.34 
 
 		 606 aa  444  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00130294  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1861  excinuclease ABC subunit C  38.46 
 
 		 609 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1316  excinuclease ABC subunit C  40.1 
 
 		 627 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.235211  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1410  excinuclease ABC subunit C  40.1 
 
 		 621 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1548  excinuclease ABC subunit C  38.3 
 
 		 609 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000704584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2599  excinuclease ABC subunit C  38.07 
 
 		 609 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00115318  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2561  excinuclease ABC subunit C  38.07 
 
 		 609 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00257936  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2161  excinuclease ABC subunit C  38.37 
 
 		 674 aa  438  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1437  excinuclease ABC subunit C  39.67 
 
 		 609 aa  438  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0535013  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  38.52 
 
 		 609 aa  438  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2676  excinuclease ABC subunit C  38.24 
 
 		 609 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1615  excinuclease ABC subunit C  38.3 
 
 		 609 aa  438  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000543557  normal  0.3636 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1783  excinuclease ABC subunit C  38.24 
 
 		 610 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0533171  hitchhiker  0.000000162173 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4255  excinuclease ABC subunit C  38.5 
 
 		 677 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1519  excinuclease ABC subunit C  39.67 
 
 		 610 aa  435  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0983209  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1783  excinuclease ABC subunit C  40.06 
 
 		 653 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1609  excinuclease ABC subunit C  37.97 
 
 		 609 aa  434  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000167064  normal  0.0818954 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00582  excinuclease ABC subunit C  40.5 
 
 		 618 aa  435  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>